ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sogatella furcifera isolate WBPHHN mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021417	TTCA	3	367	377	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	51134823
2	NC_021417	ATTT	3	608	619	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51134823
3	NC_021417	A	14	858	871	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51134823
4	NC_021417	TAA	4	3104	3116	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134823
5	NC_021417	ACAA	3	5969	5979	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_021417	TTAA	3	6064	6074	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_021417	AAATTT	3	6157	6174	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51134823
8	NC_021417	TAAA	3	6321	6331	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134823
9	NC_021417	AAGA	3	6392	6403	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51134823
10	NC_021417	TGAA	3	7110	7120	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	51134823
11	NC_021417	ATAAA	3	7702	7715	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	51134823
12	NC_021417	A	13	7725	7737	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	51134823
13	NC_021417	TAAAAG	3	8010	8026	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	51134823
14	NC_021417	A	16	8110	8125	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	51134823
15	NC_021417	A	13	8412	8424	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51134823
16	NC_021417	ATAA	4	8443	8458	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	51134823
17	NC_021417	A	13	8717	8729	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51134823
18	NC_021417	ATAAAA	3	9112	9130	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	51134823
19	NC_021417	AAATT	3	9232	9245	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	51134823
20	NC_021417	TTATAT	3	9637	9654	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	51134824
21	NC_021417	AATT	4	9998	10013	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_021417	A	33	10032	10064	33	100 %	0 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_021417	ATT	4	11067	11078	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134824
24	NC_021417	TAAA	3	11393	11404	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51134824
25	NC_021417	TAAA	3	11612	11623	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51134824
26	NC_021417	AAAATA	3	11728	11745	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	51134824
27	NC_021417	A	12	11815	11826	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	51134824
28	NC_021417	AAATT	3	11994	12007	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	51134824
29	NC_021417	TTTAAA	3	12310	12328	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
30	NC_021417	TTAATA	3	13049	13067	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
31	NC_021417	T	19	14548	14566	19	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021417	TA	6	14782	14794	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_021417	AT	6	14801	14812	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_021417	TA	8	14859	14875	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
35	NC_021417	TTAA	3	14880	14891	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_021417	T	26	14965	14990	26	0 %	100 %	0 %	0 %	3 %	Non-Coding
37	NC_021417	AT	7	15034	15046	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_021417	ATA	4	15099	15111	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_021417	ATT	5	15116	15131	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_021417	AT	8	15146	15162	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
41	NC_021417	TAT	5	15157	15172	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_021417	AT	6	15191	15202	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_021417	TA	10	15205	15225	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_021417	TA	6	15243	15255	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_021417	TA	6	15273	15286	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_021417	TAT	4	15328	15340	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_021417	TAA	4	15345	15355	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_021417	TA	6	15386	15396	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_021417	TAA	4	15499	15511	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_021417	AAAAT	3	16457	16471	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Sogatella furcifera isolate WBPHHN mitochondrion