ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Amata formosae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021416	TAT	4	136	146	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_021416	TTTTA	3	294	308	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	51134821
3	NC_021416	TAA	4	493	504	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134821
4	NC_021416	AATT	3	954	965	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134821
5	NC_021416	ATT	4	1038	1050	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134821
6	NC_021416	TTTTAA	4	1075	1098	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	51134821
7	NC_021416	TTTA	3	1259	1269	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134821
8	NC_021416	ATTT	3	1463	1475	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_021416	TAT	4	2049	2060	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134821
10	NC_021416	GAAA	3	2257	2267	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	51134821
11	NC_021416	TTA	4	3171	3182	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134821
12	NC_021416	AATT	3	3745	3755	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134821
13	NC_021416	A	13	3842	3854	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_021416	TCTTT	3	3933	3947	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	51134822
15	NC_021416	ATA	4	4006	4017	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134822
16	NC_021416	ATA	4	4023	4034	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134822
17	NC_021416	ATT	4	4655	4665	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134822
18	NC_021416	TTA	4	4972	4984	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134821
19	NC_021416	TTTAA	4	5587	5606	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_021416	ATAATT	3	5607	5624	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51134822
21	NC_021416	T	13	5888	5900	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51134822
22	NC_021416	TAAAAA	3	6269	6285	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
23	NC_021416	ATT	4	6390	6401	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134822
24	NC_021416	TAAA	3	6424	6435	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	51134822
25	NC_021416	TTA	4	7249	7260	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134822
26	NC_021416	ATA	4	7354	7365	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134822
27	NC_021416	ATT	4	7557	7568	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134822
28	NC_021416	AAAT	3	7593	7603	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134822
29	NC_021416	TAA	4	7792	7804	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134822
30	NC_021416	AT	6	7864	7874	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134822
31	NC_021416	TTA	4	8210	8221	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134822
32	NC_021416	ATT	4	8362	8373	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134822
33	NC_021416	AATT	3	8757	8769	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51134822
34	NC_021416	TAAA	3	9003	9013	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134822
35	NC_021416	AAAAT	3	9176	9189	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	51134822
36	NC_021416	TTAA	3	9329	9341	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51134822
37	NC_021416	AT	6	9365	9375	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134822
38	NC_021416	TAT	4	9498	9509	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134822
39	NC_021416	AT	9	9635	9651	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51134822
40	NC_021416	A	16	9673	9688	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	51134822
41	NC_021416	TAT	5	9978	9992	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	51134822
42	NC_021416	TTTA	3	10146	10157	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	51134822
43	NC_021416	TAT	4	10238	10249	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134822
44	NC_021416	AACA	3	10375	10386	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	51134822
45	NC_021416	TATAAT	3	10389	10406	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51134822
46	NC_021416	ATTT	4	10411	10426	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	51134822
47	NC_021416	ATT	4	10867	10877	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134822
48	NC_021416	ATTT	3	11102	11112	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134822
49	NC_021416	TAT	5	11211	11224	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134822
50	NC_021416	ATT	5	11506	11519	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134822
51	NC_021416	TATAAT	3	12183	12201	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51134822
52	NC_021416	CTA	4	12309	12320	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51134822
53	NC_021416	TTTAA	4	12776	12794	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
54	NC_021416	TTTAAT	3	12814	12832	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_021416	TAAA	3	13009	13020	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_021416	TTTA	3	13115	13126	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_021416	ATTT	3	13184	13195	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_021416	TAT	4	13505	13515	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_021416	ATT	5	13528	13542	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021416	TAAAT	3	13573	13587	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021416	TAAT	6	13720	13744	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_021416	TTAA	3	13960	13971	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_021416	TTTA	3	14093	14103	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_021416	TAT	6	14726	14742	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
65	NC_021416	ATTA	4	14754	14769	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021416	AATTT	3	14777	14791	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_021416	TTAA	4	14882	14897	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_021416	T	25	15004	15028	25	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_021416	TTTC	3	15136	15147	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
70	NC_021416	TATTAA	3	15257	15274	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021416	ATTA	5	15302	15322	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_021416	AT	12	15326	15348	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_021416	AT	9	15351	15368	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_021416	TA	19	15366	15403	38	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Amata formosae mitochondrion