ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Scirpophaga incertulas mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021413	TAT	5	230	243	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_021413	ATTT	3	278	289	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51134817
3	NC_021413	TTAT	3	468	478	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134817
4	NC_021413	ATT	7	696	716	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134817
5	NC_021413	TAA	4	1078	1089	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134817
6	NC_021413	TTTA	3	1100	1111	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51134817
7	NC_021413	T	12	1247	1258	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	51134817
8	NC_021413	TC	6	2048	2059	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	51134817
9	NC_021413	TTTG	3	2313	2323	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	51134817
10	NC_021413	AATT	3	3733	3743	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134817
11	NC_021413	TTAATA	3	3830	3848	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
12	NC_021413	T	13	4994	5006	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51134818
13	NC_021413	TTA	4	5603	5613	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134818
14	NC_021413	ATTT	3	5828	5839	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51134818
15	NC_021413	AATT	3	6253	6264	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_021413	TAAA	3	6354	6365	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	51134818
17	NC_021413	TAA	4	6572	6584	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134818
18	NC_021413	TAA	4	6751	6761	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134818
19	NC_021413	A	14	6893	6906	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51134818
20	NC_021413	TTA	4	7179	7190	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134818
21	NC_021413	TAA	4	7722	7734	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134818
22	NC_021413	AATAA	3	7971	7986	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	51134818
23	NC_021413	A	13	7994	8006	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51134818
24	NC_021413	TAAA	3	8220	8232	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	51134818
25	NC_021413	AAAT	4	8446	8461	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	51134818
26	NC_021413	A	12	8913	8924	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	51134818
27	NC_021413	AAAT	3	9012	9022	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134818
28	NC_021413	AAAAT	3	9101	9114	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	51134818
29	NC_021413	ATTAA	4	9157	9175	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	51134818
30	NC_021413	AT	7	9338	9351	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51134818
31	NC_021413	AT	9	9562	9578	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51134818
32	NC_021413	A	13	9603	9615	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	51134818
33	NC_021413	AAT	5	9897	9912	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51134818
34	NC_021413	CTAT	3	10069	10080	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	51134818
35	NC_021413	ATT	4	10295	10306	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134818
36	NC_021413	ATTT	3	10986	10996	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134818
37	NC_021413	ATTT	3	11121	11131	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134818
38	NC_021413	TAA	4	11654	11664	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134817
39	NC_021413	ATT	4	12021	12032	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134817
40	NC_021413	AAT	6	12185	12203	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	51134817
41	NC_021413	TAAA	3	12405	12416	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51134817
42	NC_021413	AAAATT	3	12692	12710	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
43	NC_021413	TTA	4	13039	13050	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_021413	TAT	9	13382	13408	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_021413	T	15	14845	14859	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_021413	TTTCT	3	14899	14913	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
47	NC_021413	ATT	4	14983	14994	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_021413	TTA	4	14995	15007	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_021413	ATTA	3	15069	15080	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021413	AT	18	15088	15122	35	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_021413	TTA	5	15186	15199	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_021413	TA	16	15193	15223	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Scirpophaga incertulas mitochondrion