ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Papilio maackii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021411	TAA	5	449	463	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51134814
2	NC_021411	ATT	4	675	687	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134814
3	NC_021411	T	12	999	1010	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	51134814
4	NC_021411	ATT	4	1194	1204	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_021411	AATT	3	1434	1445	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134814
6	NC_021411	ATTT	3	1627	1638	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51134814
7	NC_021411	AGG	4	1865	1876	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	51134814
8	NC_021411	GAAA	3	1984	1995	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51134814
9	NC_021411	CTTA	3	2416	2426	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	51134814
10	NC_021411	TAA	7	2590	2610	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	51134814
11	NC_021411	TAT	4	2636	2646	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134814
12	NC_021411	AATT	3	3470	3480	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134814
13	NC_021411	ATT	4	3703	3713	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134814
14	NC_021411	ATA	5	3721	3735	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51134814
15	NC_021411	ATT	4	3868	3880	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134815
16	NC_021411	AATT	3	4144	4154	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134815
17	NC_021411	AAT	4	5599	5610	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134815
18	NC_021411	T	14	5615	5628	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51134815
19	NC_021411	ATAA	4	6089	6103	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	51134815
20	NC_021411	TAAA	3	6129	6140	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	51134815
21	NC_021411	AATT	3	6147	6157	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134815
22	NC_021411	TAAA	3	6271	6281	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134815
23	NC_021411	AATTAT	3	6591	6609	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	51134815
24	NC_021411	TTA	4	6954	6965	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134815
25	NC_021411	ATA	4	7059	7073	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51134815
26	NC_021411	A	12	7298	7309	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	51134815
27	NC_021411	TAA	4	7497	7509	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134815
28	NC_021411	ATTT	3	7753	7763	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134815
29	NC_021411	A	12	7775	7786	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	51134815
30	NC_021411	TTAAA	4	7867	7885	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	51134815
31	NC_021411	AAAT	3	8787	8797	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134815
32	NC_021411	AAAAT	3	8876	8889	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	51134815
33	NC_021411	TAA	7	8931	8950	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	51134815
34	NC_021411	ATATTT	3	9097	9114	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	51134815
35	NC_021411	AT	8	9340	9354	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	51134815
36	NC_021411	ATT	4	9619	9629	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_021411	TTA	4	9671	9683	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134815
38	NC_021411	ATTTT	4	9796	9815	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	51134815
39	NC_021411	TTAT	4	9842	9857	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	51134815
40	NC_021411	TA	6	9953	9963	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134815
41	NC_021411	TTTTA	3	10018	10031	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	51134815
42	NC_021411	TAA	5	10086	10100	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51134815
43	NC_021411	TA	6	10358	10368	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134815
44	NC_021411	T	14	10466	10479	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51134815
45	NC_021411	ATT	4	10551	10564	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134815
46	NC_021411	ATTT	3	10789	10799	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134815
47	NC_021411	TAT	5	10903	10917	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	51134815
48	NC_021411	ATT	4	11196	11206	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134815
49	NC_021411	TAAAA	3	12023	12036	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	51134815
50	NC_021411	TAA	4	12061	12071	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134815
51	NC_021411	AAAT	3	12335	12346	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51134815
52	NC_021411	TA	7	12366	12379	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_021411	ATT	4	12502	12513	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_021411	TCAT	3	12723	12734	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
55	NC_021411	TAA	4	12827	12839	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_021411	ATTT	5	13129	13149	21	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_021411	TAATTA	3	13239	13255	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_021411	TAAT	3	13741	13751	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_021411	AAATT	3	13763	13776	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_021411	TAAA	3	13932	13944	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_021411	TATT	3	14239	14249	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_021411	TTAAA	3	14525	14539	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_021411	ATTAT	3	14898	14912	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021411	TAAT	3	14913	14925	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_021411	TAT	4	14945	14956	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_021411	TAT	4	14985	14995	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_021411	AAAATA	3	15098	15115	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_021411	TTTAT	3	15241	15255	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_021411	TAAAT	3	15313	15327	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Papilio maackii mitochondrion