ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ctenoplusia agnata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021410	TTTTA	3	286	299	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	51134813
2	NC_021410	TAT	4	707	718	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134813
3	NC_021410	AATT	3	788	798	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134813
4	NC_021410	AATT	5	959	978	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51134813
5	NC_021410	ATT	4	1029	1041	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134813
6	NC_021410	TAA	4	1045	1057	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134813
7	NC_021410	TTTTAT	3	1073	1090	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	51134813
8	NC_021410	TTTCA	3	1213	1226	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	51134813
9	NC_021410	T	14	1250	1263	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51134813
10	NC_021410	TAAA	3	1388	1398	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_021410	TAT	4	2046	2057	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134813
12	NC_021410	GGA	4	2135	2145	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	51134813
13	NC_021410	GAAA	3	2253	2264	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51134813
14	NC_021410	ATT	4	2869	2881	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134813
15	NC_021410	ATT	4	3746	3758	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134813
16	NC_021410	T	17	3936	3952	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	51134813
17	NC_021410	ATA	5	4010	4024	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51134813
18	NC_021410	TTAA	3	4114	4126	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51134813
19	NC_021410	TTTTA	3	4292	4305	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	51134813
20	NC_021410	AATT	3	4412	4422	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134813
21	NC_021410	T	15	5010	5024	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	51134813
22	NC_021410	ATT	4	5374	5385	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134813
23	NC_021410	TTAA	3	5621	5633	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51134813
24	NC_021410	TTATT	3	6071	6084	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_021410	TAA	4	6475	6486	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134813
26	NC_021410	TAT	4	6722	6733	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134813
27	NC_021410	TTA	4	7240	7251	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134813
28	NC_021410	AAT	5	7347	7361	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51134813
29	NC_021410	TAA	4	7379	7390	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134813
30	NC_021410	TAAA	3	7713	7724	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51134813
31	NC_021410	TAA	4	7783	7795	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134813
32	NC_021410	TAT	4	8042	8053	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134813
33	NC_021410	AAAAAT	3	8055	8072	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	51134813
34	NC_021410	TTA	4	8095	8105	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134813
35	NC_021410	ATC	4	8472	8483	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51134814
36	NC_021410	ATAAAT	3	8967	8984	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	51134814
37	NC_021410	TAAA	3	8995	9005	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134814
38	NC_021410	TAA	4	9132	9144	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134814
39	NC_021410	AAAAT	3	9168	9181	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	51134814
40	NC_021410	AT	6	9632	9644	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51134814
41	NC_021410	A	16	9668	9683	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	51134814
42	NC_021410	ATA	4	9770	9781	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134814
43	NC_021410	ATT	4	9912	9923	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_021410	AATT	3	10173	10184	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134814
45	NC_021410	ATA	8	10375	10399	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134814
46	NC_021410	T	14	10778	10791	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51134814
47	NC_021410	ATTT	3	11101	11111	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134814
48	NC_021410	TTA	4	11552	11562	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134814
49	NC_021410	AATT	3	11646	11657	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134814
50	NC_021410	TCT	4	12000	12011	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51134814
51	NC_021410	AAAAT	3	12134	12148	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	51134814
52	NC_021410	AAATT	3	12163	12176	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	51134814
53	NC_021410	AAT	4	12645	12656	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134814
54	NC_021410	TAATTT	3	13113	13129	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_021410	AATT	3	13151	13163	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_021410	TTTTA	3	13191	13205	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_021410	ATT	4	13502	13514	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_021410	TTAA	3	13582	13593	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_021410	AATT	4	13639	13655	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
60	NC_021410	AATT	3	13985	13996	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_021410	TTA	4	14047	14057	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_021410	ATTT	3	14058	14069	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_021410	AAATT	3	14257	14271	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_021410	TTAAA	3	14847	14861	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_021410	T	24	14953	14976	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_021410	AATAT	3	15098	15111	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_021410	TATTAA	3	15134	15151	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021410	AT	12	15166	15187	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_021410	A	20	15242	15261	20	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ctenoplusia agnata mitochondrion