ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Hydra sinensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021406	GTAAA	3	1016	1029	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_021406	TAA	4	1275	1285	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_021406	AG	6	1335	1345	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_021406	AATT	3	1410	1421	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_021406	ATT	4	2104	2115	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_021406	TAA	4	2172	2182	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_021406	TTAG	3	3090	3101	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_021406	ATT	4	3196	3207	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_021406	TAT	4	3394	3405	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134807
10	NC_021406	ATT	4	3424	3434	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134807
11	NC_021406	TAT	4	4032	4043	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134807
12	NC_021406	T	15	4043	4057	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	51134807
13	NC_021406	ATA	4	4291	4302	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134807
14	NC_021406	TAT	5	5300	5313	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134808
15	NC_021406	TTA	4	5771	5781	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134808
16	NC_021406	TAT	4	5945	5955	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134808
17	NC_021406	TATT	3	6132	6143	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51134808
18	NC_021406	AATTT	3	6187	6200	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	51134808
19	NC_021406	ATT	4	6360	6371	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134808
20	NC_021406	TATT	6	6571	6594	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51134808
21	NC_021406	ATT	5	6662	6676	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	51134808
22	NC_021406	ATT	4	7012	7024	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134808
23	NC_021406	TAT	4	7215	7225	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134808
24	NC_021406	TAT	5	7586	7599	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134808
25	NC_021406	TAA	4	7649	7660	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134808
26	NC_021406	TAT	5	7684	7698	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	51134808
27	NC_021406	TAA	4	7876	7887	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134808
28	NC_021406	ATATG	3	7981	7995	15	40 %	40 %	20 %	0 %	0 %	51134808
29	NC_021406	TTA	4	8481	8493	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134808
30	NC_021406	ATA	4	8569	8579	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134808
31	NC_021406	GAAA	3	9037	9048	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_021406	ATAG	3	9700	9710	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_021406	AATT	3	10112	10124	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51134808
34	NC_021406	TAT	4	10196	10207	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134808
35	NC_021406	ATT	4	10720	10731	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134808
36	NC_021406	AAT	4	10837	10847	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134808
37	NC_021406	TAT	5	12306	12320	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	51134808
38	NC_021406	ATT	4	12773	12784	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134808
39	NC_021406	TTTA	3	13207	13218	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51134808
40	NC_021406	TAAT	3	13344	13354	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134808
41	NC_021406	ATG	4	13756	13768	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	51134808
42	NC_021406	TTCA	3	14301	14312	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	51134808
43	NC_021406	ATT	4	14355	14365	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134808
44	NC_021406	ATT	4	14867	14877	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134807
45	NC_021406	GGA	4	15209	15219	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	51134807

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Hydra sinensis mitochondrion