ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Protobothrops jerdonii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021402	TTAA	3	1403	1414	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_021402	GTTC	3	2304	2315	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_021402	TAGCCT	3	2766	2783	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	51134802
4	NC_021402	CCT	4	3199	3210	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	51134802
5	NC_021402	ACA	4	3449	3460	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	0 %	51134802
6	NC_021402	GATA	3	3515	3527	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_021402	AACC	3	3532	3542	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
8	NC_021402	CAT	4	4893	4904	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51134802
9	NC_021402	ACA	4	4924	4934	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	51134802
10	NC_021402	CAA	4	5024	5034	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	51134802
11	NC_021402	TAA	4	5165	5176	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134802
12	NC_021402	ACA	4	5297	5308	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51134802
13	NC_021402	CAA	4	5528	5539	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51134802
14	NC_021402	ATA	4	5854	5865	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134802
15	NC_021402	CTA	5	6576	6590	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	51134802
16	NC_021402	TCC	4	6591	6602	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	51134802
17	NC_021402	TGGC	3	7214	7225	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	51134802
18	NC_021402	TCA	4	9813	9823	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51134802
19	NC_021402	AT	7	11432	11444	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51134802
20	NC_021402	CAAC	3	11624	11635	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	51134802
21	NC_021402	AC	6	12076	12087	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	51134802
22	NC_021402	TCT	4	12663	12674	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51134803
23	NC_021402	AT	6	12934	12944	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134803
24	NC_021402	AAT	4	12997	13008	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134803
25	NC_021402	CTAT	3	13128	13138	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	51134803
26	NC_021402	CAA	4	13458	13469	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51134803
27	NC_021402	CGC	4	13474	13485	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	51134803
28	NC_021402	TAA	4	13548	13559	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134803
29	NC_021402	CTC	4	13625	13636	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	51134803
30	NC_021402	AAAC	3	14579	14590	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	51134803
31	NC_021402	CAAC	3	16174	16185	12	50 %	0 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021402	TTAA	3	16188	16199	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Protobothrops jerdonii mitochondrion