ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Apis florea mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021401	TAA	4	873	884	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_021401	TAA	4	893	905	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_021401	TAA	6	973	991	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
4	NC_021401	TAAA	3	1022	1032	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134800
5	NC_021401	ATTT	7	1037	1064	28	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	51134800
6	NC_021401	ATTA	3	1179	1190	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134800
7	NC_021401	ATT	4	1231	1243	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134800
8	NC_021401	TAT	4	1565	1576	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134800
9	NC_021401	TAT	4	1602	1614	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134800
10	NC_021401	ATTA	3	1632	1643	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	51134800
11	NC_021401	TAATTT	3	1706	1723	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	51134800
12	NC_021401	AAT	4	1839	1850	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134800
13	NC_021401	TTAA	3	2240	2252	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_021401	AAAATT	3	2267	2285	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
15	NC_021401	AATT	3	2533	2544	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134800
16	NC_021401	ATA	4	2800	2811	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134800
17	NC_021401	TAT	4	2918	2928	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134800
18	NC_021401	AGG	4	2964	2975	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	51134800
19	NC_021401	TAT	4	3702	3713	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134800
20	NC_021401	ATT	4	3735	3746	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	51134800
21	NC_021401	AAAT	3	3926	3937	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_021401	TAA	4	4043	4054	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134800
23	NC_021401	TTA	4	4052	4063	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134800
24	NC_021401	AATT	3	4491	4502	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134800
25	NC_021401	TAA	4	4626	4636	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134800
26	NC_021401	TTAAT	3	4891	4905	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	51134800
27	NC_021401	TAT	4	5033	5044	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134801
28	NC_021401	TA	6	5106	5116	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134801
29	NC_021401	TAT	5	5156	5170	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	51134801
30	NC_021401	TTAAT	3	5289	5302	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	51134801
31	NC_021401	TTTAT	3	5874	5887	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	51134801
32	NC_021401	ATT	4	6065	6077	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134801
33	NC_021401	AATA	3	6285	6295	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134801
34	NC_021401	ATTT	5	6384	6403	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	51134801
35	NC_021401	TAAATA	4	6419	6442	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_021401	TA	16	6429	6460	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_021401	A	13	6591	6603	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51134801
38	NC_021401	ATT	4	6721	6731	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134801
39	NC_021401	TCAAT	3	6757	6770	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	51134801
40	NC_021401	AAATTA	3	6917	6935	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
41	NC_021401	TTTA	3	7035	7045	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_021401	AATTA	3	7103	7117	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	51134801
43	NC_021401	AAATT	3	7149	7162	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	51134801
44	NC_021401	TTAA	3	7377	7388	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134801
45	NC_021401	TAT	4	8317	8328	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134801
46	NC_021401	AAAT	3	8513	8524	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51134801
47	NC_021401	TAAA	3	8599	8610	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51134801
48	NC_021401	ATTGA	3	8654	8667	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	51134801
49	NC_021401	TTA	6	8721	8738	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	51134801
50	NC_021401	AAT	4	8750	8760	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134801
51	NC_021401	TAAA	3	8848	8859	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	51134801
52	NC_021401	TAAA	6	8979	9003	25	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51134801
53	NC_021401	ATT	4	9263	9274	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134801
54	NC_021401	AATT	3	9417	9427	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134801
55	NC_021401	ATT	4	9467	9478	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134801
56	NC_021401	AT	6	9579	9589	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134801
57	NC_021401	TAAA	4	9616	9631	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	51134801
58	NC_021401	AT	6	9694	9704	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134801
59	NC_021401	AAT	4	9706	9718	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134801
60	NC_021401	TAA	4	9842	9852	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134801
61	NC_021401	ATTAA	3	10045	10058	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	51134801
62	NC_021401	TAT	4	10147	10158	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134801
63	NC_021401	AAACT	3	10292	10305	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	51134801
64	NC_021401	TAT	4	10371	10382	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134801
65	NC_021401	TAAA	3	10389	10399	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134801
66	NC_021401	ATT	4	10624	10634	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_021401	AATTAA	4	10920	10943	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134801
68	NC_021401	AAAT	3	11167	11179	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	51134801
69	NC_021401	ATTTT	5	11889	11912	24	20 %	80 %	0 %	0 %	8 %	51134801
70	NC_021401	TAA	4	12115	12125	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134801
71	NC_021401	TAA	4	12128	12140	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134801
72	NC_021401	TAAA	4	12331	12346	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	51134801
73	NC_021401	AT	11	12479	12502	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134801
74	NC_021401	ATAA	3	12654	12665	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	51134801
75	NC_021401	AAAT	3	13133	13143	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134801
76	NC_021401	ATT	4	13421	13433	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134801
77	NC_021401	TAATAT	3	13433	13450	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
78	NC_021401	ATT	4	13858	13870	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_021401	ATTC	3	14003	14014	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
80	NC_021401	AT	6	14255	14265	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_021401	AAATT	4	14471	14491	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_021401	AATT	3	14734	14744	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_021401	TTTA	3	15286	15297	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_021401	ATT	5	15381	15396	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_021401	TAAA	3	15410	15421	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_021401	TTAA	3	15454	15465	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_021401	TA	6	15618	15630	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_021401	ATAAAT	3	15779	15796	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
89	NC_021401	T	26	15814	15839	26	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_021401	TA	7	15874	15886	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_021401	TA	12	15953	15974	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_021401	TA	7	15977	15989	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_021401	AT	8	16050	16065	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_021401	TA	8	16076	16091	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_021401	AT	7	16115	16127	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_021401	AT	7	16134	16148	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_021401	TA	7	16188	16200	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_021401	AT	8	16261	16276	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_021401	TA	8	16287	16302	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
100	NC_021401	AT	7	16345	16359	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_021401	TA	7	16399	16411	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_021401	AT	8	16472	16487	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_021401	TA	8	16498	16513	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
104	NC_021401	AT	7	16537	16549	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_021401	AT	7	16556	16570	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_021401	TA	7	16610	16622	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_021401	AT	8	16683	16698	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
108	NC_021401	TA	8	16709	16724	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_021401	AT	7	16748	16760	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_021401	AT	7	16767	16781	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
111	NC_021401	TA	6	16805	16815	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_021401	TA	7	16821	16833	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_021401	TA	8	16887	16902	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_021401	TAA	4	16962	16973	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_021401	TAAA	4	17025	17040	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
116	NC_021401	AAAT	3	17081	17092	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021401	AAAT	3	17133	17144	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021401	AAAT	3	17184	17195	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021401	AAAT	3	17236	17247	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021401	AAAT	3	17287	17298	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021401	AAAT	3	17339	17350	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021401	AAAT	3	17391	17402	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021401	AAAT	3	17443	17454	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021401	AAAT	3	17495	17506	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021401	AAAT	3	17546	17557	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021401	AAAT	3	17598	17609	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Apis florea mitochondrion