Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Butomus umbellatus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_021399TCT412711282120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
2NC_021399TAT4811481261333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51178259
3NC_021399AAC5897289861566.67 %0 %0 %33.33 %6 %51178259
4NC_021399GAT411157111671133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51178262
5NC_021399GAA412452124631266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51178262
6NC_021399TAG413357133681233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51178262
7NC_021399GTT41875618766110 %66.67 %33.33 %0 %9 %51178262
8NC_021399CAC428687286981233.33 %0 %0 %66.67 %8 %51178262
9NC_021399GAA429232292421166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51178262
10NC_021399AAG429264292751266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51178262
11NC_021399GGA434150341601133.33 %0 %66.67 %0 %9 %51178262
12NC_021399GAA435607356171166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51178262
13NC_021399TGC44291742928120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %51178262
14NC_021399GAA443649436591166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51178262
15NC_021399CTT45002350034120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51178262
16NC_021399CTA452212522231233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51178259
17NC_021399CTA453901539111133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51178259
18NC_021399TAT454448544581133.33 %66.67 %0 %0 %9 %51178259
19NC_021399CTT45557455584110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51178259
20NC_021399AGA462319623311366.67 %0 %33.33 %0 %7 %51178259
21NC_021399ACT463693637031133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51178259
22NC_021399GCC46430564316120 %0 %33.33 %66.67 %8 %51178259
23NC_021399CAT468686686961133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51178259
24NC_021399TGG47125471264110 %33.33 %66.67 %0 %9 %51178259
25NC_021399AGG571382713961533.33 %0 %66.67 %0 %6 %51178259
26NC_021399CTT47469674706110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51178259
27NC_021399GAC477330773411233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51178259
28NC_021399CTC47977479784110 %33.33 %0 %66.67 %9 %51178259
29NC_021399TCT48226582276120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51178259
30NC_021399GCA484912849231233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51178259
31NC_021399CGG48503885049120 %0 %66.67 %33.33 %8 %51178259
32NC_021399CTT48704587055110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51178262
33NC_021399CTT48754987560120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51178262
34NC_021399TCT48783387843110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51178262
35NC_021399TTC48869788708120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51178262
36NC_021399GAA490455904661266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51178262
37NC_021399CTA495361953721233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51178262
38NC_021399TAG497964979751233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51178262
39NC_021399CTT49835098361120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51178262
40NC_021399TCT49869398703110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51178262
41NC_021399CAG41002321002431233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51178262
42NC_021399GAT41011701011801133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51178262
43NC_021399AAG41085981086081166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51178262
44NC_021399TAT41102731102841233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51178262
45NC_021399CTT4110398110409120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51178262
46NC_021399TTC4110570110582130 %66.67 %0 %33.33 %7 %51178262
47NC_021399CGC4111377111388120 %0 %33.33 %66.67 %8 %51178262
48NC_021399TTA41117271117381233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51178262
49NC_021399AGG41119351119461233.33 %0 %66.67 %0 %8 %51178262
50NC_021399TTC4113753113764120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51178262
51NC_021399AGA41145381145491266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51178262
52NC_021399CTC4117355117366120 %33.33 %0 %66.67 %8 %51178262
53NC_021399GCC4125322125332110 %0 %33.33 %66.67 %9 %51178262
54NC_021399GCT4131020131031120 %33.33 %33.33 %33.33 %0 %51178262
55NC_021399GAT41312401312521333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %51178262
56NC_021399TTC4132858132868110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51178262
57NC_021399CTT5135429135443150 %66.67 %0 %33.33 %6 %51178262
58NC_021399CTT4136330136341120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51178262
59NC_021399TCT4138339138351130 %66.67 %0 %33.33 %7 %51178262
60NC_021399AGA41403491403591166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51178262
61NC_021399TAG41430161430281333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %51178262
62NC_021399TCT4143687143698120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51178262
63NC_021399TAC41438711438811133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51178262
64NC_021399CCA41450841450941133.33 %0 %0 %66.67 %9 %51178262
65NC_021399AGA41473381473481166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51178262
66NC_021399CAG41498131498241233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51178262
67NC_021399GCA41508201508311233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51178262
68NC_021399ACT41539121539221133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51178262
69NC_021399GAC41541681541781133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %51178262
70NC_021399AGA41552231552331166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51178262
71NC_021399GAC41566641566741133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %51178262
72NC_021399TCG4159106159116110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %51178262
73NC_021399GTC4159202159213120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %51178262
74NC_021399TCT4159758159768110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51178262
75NC_021399ATC41613391613501233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51178262
76NC_021399TAA41652751652861266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51178262
77NC_021399CTG4166244166255120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %51178262
78NC_021399TCC4170509170519110 %33.33 %0 %66.67 %9 %51178262
79NC_021399TCT4171247171258120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51178262
80NC_021399CTC5174246174261160 %33.33 %0 %66.67 %6 %51178262
81NC_021399AGA41862011862111166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51178262
82NC_021399CTT4187402187413120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51178262
83NC_021399TTC4192079192089110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51178262
84NC_021399GAA41991571991691366.67 %0 %33.33 %0 %7 %51178262
85NC_021399CTC4200592200602110 %33.33 %0 %66.67 %9 %51178262
86NC_021399AGA42027682027801366.67 %0 %33.33 %0 %7 %51178262
87NC_021399CTC4202792202802110 %33.33 %0 %66.67 %9 %51178262
88NC_021399TTC4204723204735130 %66.67 %0 %33.33 %7 %51178262
89NC_021399CCG4204975204986120 %0 %33.33 %66.67 %8 %51178262
90NC_021399GAT42095632095741233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51178262
91NC_021399TAC42156692156801233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51178262
92NC_021399AGA42157212157311166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51178262
93NC_021399CAT42196492196601233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51178262
94NC_021399CAT42211162211271233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51178262
95NC_021399CAG42245222245331233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51178262
96NC_021399CAA42262862262971266.67 %0 %0 %33.33 %8 %51178262
97NC_021399GGC4229010229021120 %0 %66.67 %33.33 %8 %51178262
98NC_021399AGA42329732329841266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51178262
99NC_021399GTC4234105234116120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %51178262
100NC_021399GAA42355292355401266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51178262
101NC_021399TTG4236009236019110 %66.67 %33.33 %0 %9 %51178262
102NC_021399TGA42364692364801233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51178262
103NC_021399AGA42381192381301266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51178262
104NC_021399ACG42422902423011233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51178262
105NC_021399GGT4242344242354110 %33.33 %66.67 %0 %9 %51178262
106NC_021399AGC42446182446281133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %51178262
107NC_021399CTA42458562458671233.33 %33.33 %0 %33.33 %0 %51178262
108NC_021399ACT42461472461581233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51178262
109NC_021399CTT5248469248483150 %66.67 %0 %33.33 %6 %51178262
110NC_021399CGT4251721251731110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %51178262
111NC_021399TCT5255184255198150 %66.67 %0 %33.33 %6 %51178262
112NC_021399AGA42556432556531166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51178262
113NC_021399GAA42624042624151266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51178262
114NC_021399TCT4263575263586120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51178262
115NC_021399CTT4271352271364130 %66.67 %0 %33.33 %7 %51178262
116NC_021399GAA42721822721941366.67 %0 %33.33 %0 %7 %51178262
117NC_021399TCC4272346272356110 %33.33 %0 %66.67 %9 %51178262
118NC_021399TTC5273111273125150 %66.67 %0 %33.33 %6 %51178262
119NC_021399AGA42768782768891266.67 %0 %33.33 %0 %0 %51178262
120NC_021399AGC42859502859611233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51178262
121NC_021399CAG42862092862191133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %51178262
122NC_021399TCA42903912904021233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51178262
123NC_021399TTC4291317291327110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51178262
124NC_021399CAA42913452913551166.67 %0 %0 %33.33 %9 %51178262
125NC_021399AAG42932152932251166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51178262
126NC_021399AGA42997602997721366.67 %0 %33.33 %0 %7 %51178262
127NC_021399ACT43011353011451133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51178262
128NC_021399GCC4301747301758120 %0 %33.33 %66.67 %8 %51178262
129NC_021399CGT4305355305365110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %51178262
130NC_021399CTA43061783061891233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51178262
131NC_021399CTT4322106322116110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51178262
132NC_021399CTT4324347324357110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51178262
133NC_021399TCC4336025336036120 %33.33 %0 %66.67 %8 %51178262
134NC_021399AGC43411183411281133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %51178262
135NC_021399TCT4341227341239130 %66.67 %0 %33.33 %7 %51178262
136NC_021399CTC4343752343764130 %33.33 %0 %66.67 %7 %51178262
137NC_021399TGA43532293532391133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51178262
138NC_021399AGC43537853537971333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %51178262
139NC_021399GAA53546733546861466.67 %0 %33.33 %0 %7 %51178262
140NC_021399GCC4356140356150110 %0 %33.33 %66.67 %9 %51178262
141NC_021399ACC43565613565721233.33 %0 %0 %66.67 %8 %51178262
142NC_021399GCA43573413573531333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %51178262
143NC_021399TGT4357748357761140 %66.67 %33.33 %0 %7 %51178262
144NC_021399CGT4360204360214110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %51178262
145NC_021399ATG43613203613301133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51178262
146NC_021399CTT4364175364187130 %66.67 %0 %33.33 %7 %51178262
147NC_021399CGG4365699365710120 %0 %66.67 %33.33 %8 %51178262
148NC_021399AGT43663133663231133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51178262
149NC_021399CTC4370144370155120 %33.33 %0 %66.67 %8 %51178262
150NC_021399GAA43784173784301466.67 %0 %33.33 %0 %7 %51178262
151NC_021399CTC4385572385583120 %33.33 %0 %66.67 %8 %51178262
152NC_021399TCT4391503391513110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51178262
153NC_021399GAG43986153986251133.33 %0 %66.67 %0 %9 %51178262
154NC_021399GAA43993693993811366.67 %0 %33.33 %0 %7 %51178262
155NC_021399CTT4400550400562130 %66.67 %0 %33.33 %7 %51178262
156NC_021399AGA44052894053001266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51178262
157NC_021399CTT4406887406897110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51178262
158NC_021399GAG44082024082131233.33 %0 %66.67 %0 %8 %51178262
159NC_021399GAT44126274126371133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51178262
160NC_021399GAA44145884145991266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51178262
161NC_021399ATG44157024157121133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51178262
162NC_021399TAC44181994182101233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51178262
163NC_021399ATG44193934194031133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51178262
164NC_021399AAG54202814202951566.67 %0 %33.33 %0 %6 %51178262
165NC_021399TGA44209484209591233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51178262
166NC_021399CTT4427778427790130 %66.67 %0 %33.33 %7 %51178262
167NC_021399CTT4428104428114110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51178262
168NC_021399TCG4431059431070120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
169NC_021399TTA44344534344631133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
170NC_021399GAG54364914365061633.33 %0 %66.67 %0 %6 %Non-Coding
171NC_021399GGC4438372438382110 %0 %66.67 %33.33 %9 %Non-Coding
172NC_021399TTC4439300439310110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
173NC_021399TCT4443967443977110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
174NC_021399AGA64485564485721766.67 %0 %33.33 %0 %5 %51178262