ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Adoxophyes orana mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021396	TTTAT	3	129	143	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_021396	ATTTT	4	463	481	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	51134795
3	NC_021396	TTTA	3	884	894	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134795
4	NC_021396	AATAT	3	933	946	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	51134795
5	NC_021396	ATTTT	3	1357	1371	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_021396	TAT	4	1944	1955	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134795
7	NC_021396	ACTTTT	3	2019	2036	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	51134795
8	NC_021396	GAAA	3	2231	2242	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51134795
9	NC_021396	ATT	4	2847	2859	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134795
10	NC_021396	ATT	4	2884	2894	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134795
11	NC_021396	TAATTA	3	3136	3153	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51134795
12	NC_021396	AATT	3	3716	3726	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134795
13	NC_021396	AATTA	3	3803	3817	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_021396	TAA	4	3987	3997	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134795
15	NC_021396	TAATT	3	4076	4089	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	51134795
16	NC_021396	TTTC	3	5000	5011	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	51134795
17	NC_021396	TAT	4	5078	5089	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134795
18	NC_021396	TATTTA	3	5512	5530	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
19	NC_021396	ATT	5	5603	5617	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	51134795
20	NC_021396	AAATTT	3	6106	6123	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_021396	TAAA	5	6346	6366	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134795
22	NC_021396	TAAA	3	6396	6407	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	51134795
23	NC_021396	ATT	4	6698	6709	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134795
24	NC_021396	TA	6	6900	6910	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134795
25	NC_021396	A	14	6935	6948	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51134795
26	NC_021396	ATA	5	7326	7340	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51134795
27	NC_021396	TAA	4	7764	7776	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134795
28	NC_021396	A	13	7973	7985	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51134795
29	NC_021396	ATAAA	3	7993	8006	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	51134795
30	NC_021396	A	12	8009	8020	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	51134795
31	NC_021396	A	21	8032	8052	21	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	51134795
32	NC_021396	AAAT	3	8064	8075	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51134795
33	NC_021396	ATC	4	8358	8369	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51134795
34	NC_021396	ATAAAT	3	8946	8963	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	51134795
35	NC_021396	AATAT	3	8979	8993	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	51134795
36	NC_021396	AAAT	3	9058	9068	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134795
37	NC_021396	A	13	9386	9398	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51134795
38	NC_021396	TAAAA	3	9400	9413	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	51134795
39	NC_021396	TA	6	9618	9630	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51134795
40	NC_021396	ATT	5	9888	9902	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_021396	TAA	8	9934	9957	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134796
42	NC_021396	ATTTT	4	10061	10080	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	51134796
43	NC_021396	TTTA	3	10106	10117	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	51134796
44	NC_021396	ATTTTT	3	10191	10208	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	51134796
45	NC_021396	TAA	7	10348	10368	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134796
46	NC_021396	TA	6	10628	10638	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134796
47	NC_021396	TAA	4	11038	11049	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134796
48	NC_021396	TAAT	3	11603	11614	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	51134796
49	NC_021396	A	14	11834	11847	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51134796
50	NC_021396	A	16	12304	12319	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	51134796
51	NC_021396	T	14	12941	12954	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_021396	ATTT	4	13023	13038	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_021396	TA	48	13030	13124	95	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_021396	AATTTA	3	13167	13185	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_021396	ATT	4	13200	13210	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_021396	TA	6	13525	13536	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_021396	TTAA	3	13886	13897	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021396	AATT	3	14038	14049	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_021396	T	13	14114	14126	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_021396	AAATT	3	14318	14332	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_021396	ATTAA	4	14699	14719	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_021396	ATTT	3	14741	14753	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_021396	AAAAT	3	14933	14947	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_021396	T	23	15037	15059	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_021396	AATT	3	15086	15096	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_021396	AT	6	15221	15233	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_021396	AT	12	15250	15272	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Adoxophyes orana mitochondrion