ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Dichocrocis punctiferalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021389	TTTAT	3	128	142	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_021389	ATTA	3	454	465	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134785
3	NC_021389	ATT	4	694	705	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134785
4	NC_021389	T	14	843	856	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51134785
5	NC_021389	TTTA	3	887	897	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134785
6	NC_021389	ATT	4	1021	1033	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134785
7	NC_021389	TTTA	3	1135	1146	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51134785
8	NC_021389	T	12	1242	1253	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	51134785
9	NC_021389	TTTA	3	1336	1347	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_021389	AAT	4	3444	3455	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134785
11	NC_021389	AATT	3	3725	3735	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134785
12	NC_021389	ATT	4	3858	3868	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_021389	TTTTAT	3	3928	3945	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	51134785
14	NC_021389	TAAA	3	4014	4024	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134785
15	NC_021389	ATT	4	4163	4174	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134785
16	NC_021389	ATTTT	3	4589	4603	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	51134785
17	NC_021389	TTAA	5	4703	4722	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51134785
18	NC_021389	TA	7	5584	5597	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51134785
19	NC_021389	ATT	4	5861	5872	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134785
20	NC_021389	TAA	4	5924	5936	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134785
21	NC_021389	AT	34	6161	6226	66	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_021389	AATTAT	3	6423	6439	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51134785
23	NC_021389	TAAA	3	6475	6486	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	51134785
24	NC_021389	AATTAA	3	6937	6955	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	51134785
25	NC_021389	TAAA	3	7016	7027	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51134785
26	NC_021389	ATCT	3	7045	7056	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	51134785
27	NC_021389	TAA	4	7439	7450	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134785
28	NC_021389	TGAA	3	7493	7503	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	51134785
29	NC_021389	TAA	4	7843	7855	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134785
30	NC_021389	ATA	4	7873	7884	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134785
31	NC_021389	AAAAAT	3	8115	8132	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	51134785
32	NC_021389	ATTAAT	3	8408	8425	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	51134786
33	NC_021389	AATAT	3	9054	9068	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	51134786
34	NC_021389	AAAT	3	9133	9143	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134786
35	NC_021389	AAAAT	3	9222	9235	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	51134786
36	NC_021389	TAA	4	9274	9285	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134786
37	NC_021389	AT	6	9412	9423	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134786
38	NC_021389	A	13	9545	9557	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	51134786
39	NC_021389	AT	9	9686	9702	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51134786
40	NC_021389	TAAA	3	9713	9723	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134786
41	NC_021389	ATT	4	10025	10035	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134786
42	NC_021389	ATTTT	4	10144	10163	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	51134786
43	NC_021389	ATT	5	10180	10194	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	51134786
44	NC_021389	TATC	3	10195	10206	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	51134786
45	NC_021389	TTATT	3	10278	10291	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	51134786
46	NC_021389	TTTA	3	10369	10379	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134786
47	NC_021389	ATA	8	10430	10453	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134786
48	NC_021389	TATT	5	10450	10470	21	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134786
49	NC_021389	TTTTAT	3	10812	10829	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	51134786
50	NC_021389	TATTA	3	11255	11268	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	51134786
51	NC_021389	AATTTT	3	11433	11450	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	51134786
52	NC_021389	TTA	4	11580	11590	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134786
53	NC_021389	TAAA	3	11965	11977	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	51134786
54	NC_021389	TAAAA	3	12376	12389	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	51134786
55	NC_021389	TAA	4	12414	12424	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134786
56	NC_021389	TAT	4	12730	12740	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_021389	TTTA	3	12901	12912	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021389	T	15	13042	13056	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_021389	TAAT	4	13236	13251	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_021389	TTAA	3	13590	13601	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_021389	ATTA	4	13781	13796	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_021389	T	13	14075	14087	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_021389	ATT	5	14118	14132	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_021389	AATT	3	14138	14148	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_021389	TAAA	3	14333	14345	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_021389	AATTA	4	14714	14733	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
67	NC_021389	TTA	4	14913	14924	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021389	T	19	15029	15047	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_021389	TTTC	3	15092	15103	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
70	NC_021389	ATA	4	15104	15115	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_021389	TA	7	15238	15250	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_021389	ATTA	3	15258	15269	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021389	AT	11	15277	15297	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Dichocrocis punctiferalis mitochondrion