ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Frankliniella intonsa mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021378	T	20	94	113	20	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021378	TATT	8	141	172	32	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_021378	AAGA	3	283	293	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_021378	TAAA	3	1095	1106	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51134772
5	NC_021378	TTTTTA	3	1226	1242	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	51134772
6	NC_021378	TTC	4	1723	1733	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51134772
7	NC_021378	TAT	4	1794	1805	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134772
8	NC_021378	AATAAA	3	3154	3171	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_021378	ATT	4	3547	3558	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134772
10	NC_021378	AATT	4	3763	3778	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	51134772
11	NC_021378	CCTT	3	4051	4062	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	51134772
12	NC_021378	T	20	4512	4531	20	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021378	TATT	8	4559	4590	32	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_021378	A	14	4687	4700	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51134773
15	NC_021378	A	13	4758	4770	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51134773
16	NC_021378	TAAA	3	4795	4806	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51134773
17	NC_021378	TTTA	3	4987	4998	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51134773
18	NC_021378	GGAAA	3	5280	5294	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	51134773
19	NC_021378	TAA	4	5807	5817	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134773
20	NC_021378	AAAT	3	5856	5867	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51134773
21	NC_021378	CCCAA	3	5977	5991	15	40 %	0 %	0 %	60 %	6 %	51134773
22	NC_021378	A	12	6061	6072	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	51134773
23	NC_021378	A	16	6285	6300	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	51134773
24	NC_021378	AATT	3	6320	6330	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134773
25	NC_021378	AAAAT	3	6385	6398	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	51134773
26	NC_021378	TAT	4	6805	6816	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134773
27	NC_021378	AAAG	3	6984	6995	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51134773
28	NC_021378	AAAT	3	7226	7236	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134773
29	NC_021378	A	18	7360	7377	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	51134773
30	NC_021378	AAAG	3	7399	7410	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51134773
31	NC_021378	A	12	7592	7603	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	51134773
32	NC_021378	GAAA	3	7605	7615	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	51134773
33	NC_021378	CAAA	3	7939	7950	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	51134773
34	NC_021378	ATAA	3	8058	8068	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134773
35	NC_021378	A	13	8529	8541	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51134773
36	NC_021378	T	12	8556	8567	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_021378	TAAA	3	8659	8669	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_021378	AGA	4	8775	8785	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_021378	TAAA	3	8963	8973	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_021378	ATTT	3	9036	9046	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_021378	A	23	9050	9072	23	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_021378	TAA	4	9361	9371	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_021378	TAAA	3	9406	9417	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_021378	ATTT	3	9761	9772	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_021378	TTTG	3	10328	10339	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	51134773
46	NC_021378	AGA	4	11781	11792	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51134773
47	NC_021378	T	18	13714	13731	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021378	TATT	8	13759	13790	32	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_021378	AAGA	3	13902	13912	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_021378	T	13	15089	15101	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51134773

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Frankliniella intonsa mitochondrion