ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Flammulina velutipes strain 4019-20 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021373	TTTATT	4	234	256	23	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	51134763
2	NC_021373	TAATCT	3	816	833	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	51134763
3	NC_021373	TTTTAT	3	1547	1565	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	51134763
4	NC_021373	TAATTT	3	3646	3669	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	51134763
5	NC_021373	AATTAA	3	5391	5408	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	51134763
6	NC_021373	TAATTA	3	12298	12316	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51134764
7	NC_021373	TTTTAT	3	12880	12897	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	51134764
8	NC_021373	ATTTTA	3	13566	13584	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	51134764
9	NC_021373	TGAACT	4	16618	16641	24	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
10	NC_021373	TTAACT	9	16624	16677	54	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	9 %	Non-Coding
11	NC_021373	AAATAA	4	16798	16821	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
12	NC_021373	TACTAA	14	22507	22590	84	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	7 %	Non-Coding
13	NC_021373	TTTATT	4	22746	22769	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_021373	CTTATT	10	22746	22805	60	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
15	NC_021373	TAATTA	3	23513	23531	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
16	NC_021373	AAAAAT	3	24459	24476	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_021373	ACTAAA	5	24672	24702	31	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	9 %	Non-Coding
18	NC_021373	TACTAA	3	24703	24721	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
19	NC_021373	ATTTAG	3	24981	24998	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_021373	TATAAA	5	25167	25196	30	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_021373	TTTTAA	8	27086	27131	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_021373	TAAATT	3	27279	27297	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
23	NC_021373	AAATAA	3	27957	27974	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	51134764
24	NC_021373	ATCTAA	4	29163	29186	24	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	51134764
25	NC_021373	AATATT	3	29764	29781	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51134764
26	NC_021373	TTAATT	3	32376	32392	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_021373	AAAATT	3	33189	33207	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
28	NC_021373	TAAATT	3	33281	33298	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_021373	ATTGTA	6	33523	33558	36	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_021373	GTTGAA	4	33553	33576	24	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_021373	TTAAAC	4	34494	34523	30	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	3 %	Non-Coding
32	NC_021373	AATTTA	3	35098	35116	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_021373	AATATT	3	35470	35488	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
34	NC_021373	TAATTT	3	36675	36693	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
35	NC_021373	TTTTTA	3	36956	36974	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
36	NC_021373	TATTTA	7	37498	37539	42	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_021373	ATAATT	3	38488	38505	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021373	TTTATT	3	39740	39757	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_021373	TGTAAT	7	39979	40020	42	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_021373	TTAATT	3	40452	40469	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
41	NC_021373	TAATTA	3	42417	42434	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
42	NC_021373	TCTAAA	3	42447	42464	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
43	NC_021373	ATTAAT	3	49002	49018	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_021373	AAATAA	3	49082	49100	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_021373	TCTAGA	3	49344	49361	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
46	NC_021373	ATCTTT	3	49539	49557	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
47	NC_021373	ATTTTT	6	49909	49944	36	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_021373	TAATTT	3	50302	50320	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
49	NC_021373	ATTAAT	3	50341	50357	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
50	NC_021373	TAATCT	7	50763	50804	42	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	7 %	Non-Coding
51	NC_021373	TTTAAT	7	51881	51922	42	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_021373	TGAAGA	3	52073	52090	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
53	NC_021373	TTTAAA	3	54987	55004	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51134765
54	NC_021373	ATTTTT	3	55172	55190	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	51134765
55	NC_021373	TTATTT	3	55323	55340	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	51134765
56	NC_021373	AGGTTT	3	56714	56731	18	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	5 %	51134765
57	NC_021373	ATTTTT	3	60287	60304	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_021373	TTTTTA	3	60416	60434	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_021373	TAATAT	3	60734	60750	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
60	NC_021373	GATTAA	9	60941	60994	54	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_021373	GTTTAT	3	67065	67083	19	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
62	NC_021373	ATTTAG	4	71556	71579	24	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_021373	TAAAAT	3	73022	73039	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_021373	AATAAA	3	73561	73578	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	51134766
65	NC_021373	TTTTTA	4	74991	75014	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	51134766
66	NC_021373	TATTGT	3	77659	77676	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	51134766
67	NC_021373	TTAATT	3	80868	80885	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_021373	AATTTT	3	81900	81917	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_021373	TTTTTA	3	83009	83025	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
70	NC_021373	ATAAAA	3	83810	83827	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_021373	ATTTTA	4	84181	84204	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_021373	TTAGTT	3	84766	84783	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021373	TTTTAA	3	85896	85913	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_021373	TTTATT	3	86565	86582	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
75	NC_021373	TAAATT	4	86921	86944	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_021373	TTTATT	3	87151	87168	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Flammulina velutipes strain 4019-20 mitochondrion