ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Flammulina velutipes strain 4019-20 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021373	ATA	8	731	756	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134763
2	NC_021373	TAT	4	2671	2682	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134763
3	NC_021373	TAA	4	3040	3051	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134763
4	NC_021373	TAT	6	3206	3224	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	51134763
5	NC_021373	ATT	7	3409	3429	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134763
6	NC_021373	TAA	4	4363	4373	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134763
7	NC_021373	ATA	4	4449	4460	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134763
8	NC_021373	TAA	4	5133	5146	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134763
9	NC_021373	TTA	4	5260	5272	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134763
10	NC_021373	ATT	4	5269	5280	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134763
11	NC_021373	ATT	4	5422	5432	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134763
12	NC_021373	ATT	4	5557	5569	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134763
13	NC_021373	TTC	11	6202	6234	33	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51134763
14	NC_021373	TAG	4	6783	6794	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51134763
15	NC_021373	TAT	4	7242	7252	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134763
16	NC_021373	TAT	4	8177	8187	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134763
17	NC_021373	AAT	4	8701	8712	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134763
18	NC_021373	ATT	4	9247	9257	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134763
19	NC_021373	AAT	4	11082	11093	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134763
20	NC_021373	TAA	4	12061	12072	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134764
21	NC_021373	ATT	5	12359	12373	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	51134764
22	NC_021373	TAT	4	12447	12457	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134764
23	NC_021373	ATT	4	13072	13084	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134764
24	NC_021373	TAA	4	13264	13275	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134764
25	NC_021373	AAT	4	13620	13631	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134764
26	NC_021373	AAT	4	13689	13700	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134764
27	NC_021373	TAA	4	13831	13843	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134764
28	NC_021373	TAA	4	14126	14137	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134764
29	NC_021373	TAA	7	14350	14371	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134764
30	NC_021373	AAT	4	15136	15147	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_021373	TTA	4	15190	15200	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_021373	ATA	4	16855	16866	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_021373	ATA	4	17176	17187	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_021373	ATA	4	17192	17202	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_021373	ATA	9	17359	17384	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_021373	ATA	4	17388	17399	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_021373	TTA	4	20861	20872	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_021373	TAA	4	23033	23043	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_021373	ATT	4	23608	23618	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_021373	ATT	4	24293	24304	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_021373	TAA	4	24362	24373	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_021373	TAT	4	24589	24600	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_021373	TAA	4	24758	24770	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_021373	ATT	4	25530	25540	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_021373	ATA	4	26325	26335	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_021373	TTA	4	26631	26642	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_021373	TAA	4	26943	26954	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_021373	TAA	4	27328	27340	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_021373	ATA	4	27716	27726	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134764
50	NC_021373	TAC	4	28032	28042	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51134764
51	NC_021373	ATA	5	28079	28093	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51134764
52	NC_021373	ATA	4	28100	28110	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134764
53	NC_021373	ATA	4	28166	28177	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134764
54	NC_021373	TAA	4	28247	28259	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134764
55	NC_021373	TAA	7	28350	28370	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134764
56	NC_021373	ATA	4	28430	28441	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134764
57	NC_021373	ATA	4	28673	28683	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134764
58	NC_021373	ATA	8	28919	28942	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	51134764
59	NC_021373	AAT	4	28996	29007	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134764
60	NC_021373	TAA	4	29043	29053	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134764
61	NC_021373	ATA	5	29408	29421	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134764
62	NC_021373	TAA	4	29700	29711	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	51134764
63	NC_021373	TAA	17	29879	29930	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	51134764
64	NC_021373	TAA	10	30020	30050	31	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134764
65	NC_021373	ATA	4	30074	30085	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134764
66	NC_021373	ATA	7	30326	30346	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134764
67	NC_021373	TAA	4	30378	30389	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134764
68	NC_021373	AAT	4	30393	30405	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134764
69	NC_021373	TAA	5	30423	30437	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	51134764
70	NC_021373	AAT	4	30904	30915	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134764
71	NC_021373	ATA	8	30929	30952	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134764
72	NC_021373	TAA	4	31115	31127	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134764
73	NC_021373	TAT	5	31215	31229	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	51134764
74	NC_021373	ATA	4	31301	31311	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134764
75	NC_021373	TAA	8	31782	31805	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134764
76	NC_021373	ATA	7	31823	31843	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134764
77	NC_021373	ATT	4	32147	32158	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_021373	TAA	9	32904	32930	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_021373	TTA	5	32931	32944	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_021373	ATT	5	33474	33488	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_021373	GTA	4	33577	33588	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_021373	ATT	4	33708	33718	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_021373	TTA	4	35016	35028	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_021373	TTG	4	35453	35464	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_021373	ATA	4	35489	35500	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_021373	TAC	5	36069	36082	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
87	NC_021373	TAT	4	36275	36285	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_021373	TAT	5	38277	38290	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_021373	TAT	4	38706	38717	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_021373	TTA	4	39104	39116	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_021373	AAT	4	39147	39157	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_021373	TTA	4	39401	39412	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134765
93	NC_021373	ATT	4	40144	40155	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_021373	ATT	4	40430	40440	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_021373	TAA	4	40535	40547	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_021373	ATT	5	40693	40706	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_021373	AAT	4	40994	41005	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_021373	TAT	4	42890	42901	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_021373	TAT	4	43087	43098	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_021373	TAA	4	43093	43104	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_021373	TAA	4	43107	43118	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_021373	ATT	4	43724	43735	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134765
103	NC_021373	TAA	4	45248	45259	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_021373	TTA	4	45640	45650	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134765
105	NC_021373	ATA	4	46021	46031	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134765
106	NC_021373	ATA	4	48039	48050	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_021373	ATA	4	48344	48355	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_021373	TAA	4	48449	48460	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_021373	TAT	4	49519	49530	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_021373	ATA	4	50219	50231	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_021373	TTA	4	50249	50260	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_021373	TAA	4	50272	50282	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_021373	AAT	4	50664	50674	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_021373	TAT	4	51246	51257	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134765
115	NC_021373	TAT	4	52617	52628	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134765
116	NC_021373	TAT	4	54433	54443	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134765
117	NC_021373	TAT	4	54531	54543	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134765
118	NC_021373	TAA	4	54767	54777	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134765
119	NC_021373	TAT	4	55748	55759	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134765
120	NC_021373	TAA	4	56328	56338	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134765
121	NC_021373	ATT	4	56606	56617	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	51134765
122	NC_021373	ATT	4	57120	57131	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134765
123	NC_021373	TTC	4	57269	57280	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51134765
124	NC_021373	ATA	4	57551	57562	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134765
125	NC_021373	TAA	4	58128	58139	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134765
126	NC_021373	ATA	5	58148	58161	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134765
127	NC_021373	CTG	4	59229	59240	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51134765
128	NC_021373	TAA	4	59680	59691	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134765
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Flammulina velutipes strain 4019-20 mitochondrion