ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Flammulina velutipes strain 4019-20 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021373	TTTA	3	302	313	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	51134763
2	NC_021373	TTAA	3	346	356	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134763
3	NC_021373	AAAT	3	2083	2093	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134763
4	NC_021373	ATTA	3	2311	2322	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134763
5	NC_021373	ATAG	3	2550	2562	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	51134763
6	NC_021373	AAAG	3	2913	2924	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51134763
7	NC_021373	TTAA	5	3157	3178	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134763
8	NC_021373	AAAT	3	3826	3836	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134763
9	NC_021373	AAAT	3	5330	5341	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51134763
10	NC_021373	TCCT	3	6331	6341	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	51134763
11	NC_021373	AAAT	3	7187	7197	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134763
12	NC_021373	TTTA	3	9547	9557	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134763
13	NC_021373	TTAA	3	9667	9677	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134763
14	NC_021373	ATTT	4	10853	10868	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	51134763
15	NC_021373	TTAA	3	11121	11132	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134763
16	NC_021373	AATT	3	11578	11588	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134764
17	NC_021373	TTTA	3	11849	11859	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134764
18	NC_021373	AATT	3	12345	12356	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134764
19	NC_021373	TTTA	3	12708	12719	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51134764
20	NC_021373	TTAA	3	13792	13803	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134764
21	NC_021373	TAAT	4	13928	13943	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	51134764
22	NC_021373	AATT	3	14577	14587	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134764
23	NC_021373	TTAA	3	14975	14985	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_021373	TTTA	3	15058	15069	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_021373	ATGT	3	15114	15124	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_021373	TTTA	3	15710	15720	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_021373	TTTA	3	15939	15950	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_021373	ATTA	4	16822	16837	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_021373	TTAA	3	17312	17323	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_021373	TCAA	3	17425	17436	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
31	NC_021373	ATTT	3	17792	17802	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_021373	GATA	3	18573	18583	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_021373	TAAA	3	19290	19300	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_021373	TTTA	3	19449	19460	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_021373	TTAA	3	20593	20604	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_021373	ATTA	3	20917	20928	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_021373	TTAA	3	20950	20960	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_021373	AATT	3	22029	22040	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021373	ATTT	3	22839	22849	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_021373	GTTA	4	23067	23082	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_021373	AATT	3	23552	23563	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_021373	TTAA	4	23847	23861	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_021373	AAAT	3	24526	24537	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_021373	TAAA	5	24817	24836	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
45	NC_021373	TTTA	3	24844	24854	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_021373	TAAA	3	25322	25333	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_021373	ATTT	3	25442	25453	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_021373	ATTT	3	25542	25553	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_021373	TTAA	3	25674	25684	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_021373	TAAT	5	26477	26496	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_021373	AAAT	3	27410	27420	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134764
52	NC_021373	ATAA	3	27748	27758	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134764
53	NC_021373	TAAA	3	29732	29742	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134764
54	NC_021373	AATT	3	30173	30184	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134764
55	NC_021373	TAAA	3	30554	30564	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134764
56	NC_021373	CATT	3	30626	30637	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	51134764
57	NC_021373	ATTT	4	32277	32291	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_021373	TTTA	5	32608	32627	20	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
59	NC_021373	TTTA	3	32741	32752	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_021373	ATTA	3	32967	32978	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_021373	ATAA	3	34280	34291	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_021373	GAAA	3	34788	34798	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	51134765
63	NC_021373	TTAA	3	34998	35009	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_021373	TAAT	4	35232	35247	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_021373	TTAA	3	35688	35699	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021373	TATT	3	35796	35807	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_021373	AAAT	3	35831	35841	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_021373	AATT	3	36711	36722	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_021373	TTTA	3	37464	37475	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021373	ATTT	3	37540	37551	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_021373	TATT	5	37639	37659	21	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_021373	AAAT	4	37802	37816	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_021373	TAAA	3	37988	37999	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021373	TTAA	3	38312	38322	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_021373	ATTA	3	38729	38740	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021373	TATT	3	38776	38788	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_021373	TTTA	3	39158	39169	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_021373	TTTA	3	39301	39311	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_021373	ATTT	4	39501	39516	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	51134765
80	NC_021373	TATT	4	39520	39535	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_021373	ATTT	5	39547	39567	21	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_021373	AATA	3	40062	40073	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_021373	TTAA	3	40375	40385	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_021373	TAAA	3	40396	40407	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021373	AATT	3	41076	41087	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_021373	AAAT	3	41294	41305	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_021373	TAAA	3	41476	41487	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_021373	ATTT	3	42138	42149	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_021373	TTTA	3	42332	42343	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_021373	TTAA	3	43005	43015	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_021373	TATT	3	43783	43795	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	51134765
92	NC_021373	AATT	4	44239	44254	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	51134765
93	NC_021373	ATTA	3	44453	44464	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_021373	TAAT	3	44703	44713	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_021373	AAAT	3	45958	45969	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	51134765
96	NC_021373	ATAA	3	48167	48178	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_021373	AATT	3	48610	48621	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_021373	AATT	4	48822	48836	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_021373	TAAA	3	49122	49132	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_021373	TAAA	3	49812	49822	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_021373	TTAA	4	49823	49837	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_021373	TTTA	4	50139	50154	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_021373	AATT	3	52152	52163	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_021373	TTAA	3	54549	54560	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134765
105	NC_021373	TTTA	3	54877	54887	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134765
106	NC_021373	AAAC	3	55238	55248	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	51134765
107	NC_021373	AATA	3	55887	55898	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51134765
108	NC_021373	ATTT	5	56161	56179	19	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	51134765
109	NC_021373	TAAT	4	56196	56210	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	51134765
110	NC_021373	ATTT	3	56314	56325	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51134765
111	NC_021373	ACAT	3	56924	56934	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	51134765
112	NC_021373	AAAG	3	57715	57725	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	51134765
113	NC_021373	TTTA	3	58014	58024	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134765
114	NC_021373	TATT	3	60061	60072	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51134765
115	NC_021373	TTAA	3	61137	61147	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_021373	ATTT	3	61261	61273	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_021373	TTAA	3	61313	61323	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_021373	AATT	3	61483	61494	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_021373	AAAT	4	62401	62415	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	51134765
120	NC_021373	TTAA	3	63487	63498	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51134765
121	NC_021373	TTAA	3	63531	63541	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134765
122	NC_021373	TAAT	3	64760	64770	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_021373	ATTA	3	64917	64928	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_021373	TTTA	3	65191	65202	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_021373	AATT	3	66129	66139	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_021373	AATT	3	66904	66914	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_021373	ATTT	3	68879	68889	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_021373	TTAA	3	68977	68987	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_021373	TTAA	3	70747	70757	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134766
130	NC_021373	AATT	3	71631	71642	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_021373	TTTA	3	71994	72004	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134766
132	NC_021373	AATT	3	72657	72668	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_021373	ATTA	4	75512	75527	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
134	NC_021373	ATTT	4	75544	75559	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
135	NC_021373	TAAA	3	75869	75880	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021373	TAAA	4	77003	77018	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
137	NC_021373	TTAA	3	78804	78815	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_021373	TTAA	3	79056	79067	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_021373	AATT	3	80937	80948	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_021373	CATT	3	81214	81224	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
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142	NC_021373	TAAA	3	82115	82125	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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160	NC_021373	TTAA	3	88111	88123	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Flammulina velutipes strain 4019-20 mitochondrion