ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pharus latifolius chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021372	CAG	4	690	701	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51134756
2	NC_021372	TTG	4	5143	5154	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51134756
3	NC_021372	TTG	4	11428	11438	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	51134756
4	NC_021372	TAT	4	12496	12506	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_021372	TAT	4	18250	18260	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_021372	ATT	5	19134	19149	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_021372	CCA	4	20130	20141	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
8	NC_021372	ATA	4	20640	20650	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_021372	CTA	4	20980	20991	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_021372	AAC	4	24779	24790	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51134757
11	NC_021372	AAT	4	26467	26478	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134757
12	NC_021372	ATT	4	31655	31667	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_021372	AGA	4	32135	32145	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	51134757
14	NC_021372	GTT	5	33355	33369	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	51134757
15	NC_021372	ATT	4	35740	35751	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134757
16	NC_021372	AGG	4	37198	37209	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	51134757
17	NC_021372	TCC	4	39028	39039	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
18	NC_021372	ATG	4	40474	40484	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51134758
19	NC_021372	GCA	4	42372	42383	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51134758
20	NC_021372	AAG	4	44560	44571	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51134758
21	NC_021372	AGT	4	44962	44972	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51134758
22	NC_021372	AGT	4	47564	47575	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51134758
23	NC_021372	TTA	5	49900	49915	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_021372	CAT	4	50803	50813	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51134758
25	NC_021372	TAT	4	59523	59534	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_021372	GAA	4	61464	61474	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_021372	TTC	4	71020	71031	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51134763
28	NC_021372	TTC	4	71080	71091	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51134763
29	NC_021372	AGA	4	76973	76984	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51134763
30	NC_021372	TAT	4	78057	78067	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134763
31	NC_021372	ATT	4	78633	78643	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134763
32	NC_021372	ATA	4	92210	92220	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134763
33	NC_021372	TAC	4	94027	94038	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51134763
34	NC_021372	AAG	4	94425	94436	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51134759
35	NC_021372	TAA	4	110015	110026	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134759
36	NC_021372	TAT	4	114021	114031	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134759
37	NC_021372	TCT	4	116940	116950	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51134759
38	NC_021372	TCT	4	130983	130994	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51134759
39	NC_021372	GTA	4	131379	131390	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51134759

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pharus latifolius chloroplast