ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Pyropia haitanensis voucher PH-38 chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021189	AT	7	5584	5598	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_021189	TA	7	8623	8636	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_021189	AT	6	10845	10855	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_021189	TA	6	11353	11363	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_021189	TA	6	25464	25474	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50100014
6	NC_021189	AT	6	27478	27488	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50100014
7	NC_021189	CT	6	35015	35025	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	50100016
8	NC_021189	AT	6	38374	38385	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_021189	AT	6	40101	40111	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50100016
10	NC_021189	AG	6	42675	42685	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	50100016
11	NC_021189	AT	7	59430	59443	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	50100018
12	NC_021189	AT	6	71059	71070	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_021189	TA	7	76510	76522	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_021189	TA	6	82574	82584	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_021189	TA	6	82589	82599	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_021189	TA	6	83597	83607	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_021189	TA	6	83916	83926	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50100020
18	NC_021189	TA	6	85717	85727	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_021189	TA	6	94338	94348	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50100022
20	NC_021189	TA	6	101837	101850	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_021189	TA	6	112038	112049	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50100024
22	NC_021189	AG	6	115824	115834	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_021189	AG	6	118207	118217	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_021189	TA	6	125934	125945	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_021189	AT	6	128330	128340	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_021189	TC	6	128539	128550	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
27	NC_021189	TA	6	145724	145734	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_021189	TA	6	166715	166726	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50100030
29	NC_021189	TA	6	173062	173073	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Pyropia haitanensis voucher PH-38 chloroplast