ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Liriodendron tulipifera mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021152	GATC	3	856	866	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_021152	GAAA	3	1486	1497	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	48475993
3	NC_021152	GCCG	3	2143	2155	13	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	48475993
4	NC_021152	TCGA	3	3458	3468	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_021152	CAAC	4	3643	3658	16	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
6	NC_021152	TGAA	3	4422	4433	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_021152	TCAA	3	4441	4452	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
8	NC_021152	AGCA	4	6304	6318	15	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
9	NC_021152	TGCT	4	6811	6825	15	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
10	NC_021152	AATT	3	7940	7950	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_021152	CTTA	3	9213	9223	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_021152	CCTT	3	13259	13269	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
13	NC_021152	GGAT	3	13785	13796	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_021152	AAAT	3	15626	15637	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_021152	AACT	3	15814	15826	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
16	NC_021152	CCAA	3	16600	16612	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
17	NC_021152	TAAA	3	19399	19410	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_021152	AGTC	3	19815	19826	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
19	NC_021152	TTCC	3	19893	19903	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
20	NC_021152	GGTG	3	25780	25790	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_021152	ACGG	3	26771	26783	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	48475994
22	NC_021152	TCAT	3	27711	27721	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	48475994
23	NC_021152	TCTT	3	31390	31401	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	48475994
24	NC_021152	AGCA	3	32605	32616	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	48475994
25	NC_021152	AAGC	3	32665	32676	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	48475994
26	NC_021152	AATG	3	34783	34795	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	48475994
27	NC_021152	GTCC	3	35700	35710	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	48475994
28	NC_021152	GGAA	3	36500	36512	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	48475994
29	NC_021152	GCTA	3	37756	37767	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	48475994
30	NC_021152	TCCC	3	38064	38074	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	48475994
31	NC_021152	AGAT	3	39793	39805	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	48475994
32	NC_021152	CGCC	3	39884	39894	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	48475994
33	NC_021152	TTCT	3	44332	44342	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	48475994
34	NC_021152	CTTC	3	47497	47508	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	48475994
35	NC_021152	AAAG	3	48936	48947	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	48475994
36	NC_021152	GATC	3	49919	49929	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	48475994
37	NC_021152	AGCT	3	51537	51548	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	48475994
38	NC_021152	ATTC	3	51753	51764	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	48475994
39	NC_021152	TATC	3	59122	59133	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	48475994
40	NC_021152	GGGT	3	59818	59828	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	48475994
41	NC_021152	GCAA	4	59837	59852	16	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	48475994
42	NC_021152	TTTC	3	62935	62946	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	48475994
43	NC_021152	AAAT	3	64661	64672	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	48475994
44	NC_021152	GGGT	3	66136	66146	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	48475994
45	NC_021152	CTTC	3	66956	66968	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	48475994
46	NC_021152	GGCA	3	68588	68598	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	48475994
47	NC_021152	GGCA	3	71694	71704	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	48475994
48	NC_021152	AAGC	3	75387	75397	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	48475994
49	NC_021152	ATTG	3	76669	76679	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	48475994
50	NC_021152	AGCC	3	76751	76761	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	48475994
51	NC_021152	GGAA	3	77973	77985	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	48475994
52	NC_021152	GGGC	3	79481	79492	12	0 %	0 %	75 %	25 %	8 %	48475994
53	NC_021152	ATTC	4	79594	79609	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	48475994
54	NC_021152	TTCT	4	79781	79796	16	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	48475994
55	NC_021152	CCAA	3	80420	80431	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	48475994
56	NC_021152	CTAA	3	81486	81496	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	48475994
57	NC_021152	GAAA	3	82235	82245	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	48475994
58	NC_021152	AGGA	4	82712	82727	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	48475994
59	NC_021152	GATC	3	84564	84574	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	48475994
60	NC_021152	TTGT	3	87565	87576	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	48475994
61	NC_021152	TATT	3	88228	88239	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	48475994
62	NC_021152	AAAG	3	90883	90894	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	48475994
63	NC_021152	AAAT	3	98254	98264	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	48475994
64	NC_021152	GAAA	3	99158	99169	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	48475994
65	NC_021152	GAAA	3	101756	101767	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	48475994
66	NC_021152	TTGA	3	101879	101889	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	48475994
67	NC_021152	AAGC	3	104769	104780	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	48475994
68	NC_021152	GTTT	5	106550	106568	19	0 %	75 %	25 %	0 %	10 %	48475994
69	NC_021152	GAAC	3	107998	108008	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	48475994
70	NC_021152	CAAG	3	108441	108452	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	48475994
71	NC_021152	TTCC	3	114460	114471	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	48475994
72	NC_021152	ACTC	3	114576	114586	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	48475994
73	NC_021152	TAAC	3	116084	116094	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	48475994
74	NC_021152	AACC	3	116947	116958	12	50 %	0 %	0 %	50 %	0 %	48475994
75	NC_021152	GAAC	3	117231	117241	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	48475994
76	NC_021152	GTCG	3	120046	120057	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	48475994
77	NC_021152	CTCA	3	120673	120684	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	48475994
78	NC_021152	CTTC	4	120861	120877	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	48475994
79	NC_021152	GGAA	3	121236	121248	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	48475994
80	NC_021152	AGAA	3	121651	121662	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	48475994
81	NC_021152	CCAG	3	127875	127885	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	48475994
82	NC_021152	GGAA	3	129910	129920	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
83	NC_021152	CTTT	3	130350	130361	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	48475994
84	NC_021152	AATG	3	130824	130834	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	48475994
85	NC_021152	TTCC	3	131655	131666	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	48475994
86	NC_021152	CTTA	3	132736	132747	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	48475994
87	NC_021152	CCAT	3	132765	132776	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	48475994
88	NC_021152	CAGA	3	134426	134437	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	48475994
89	NC_021152	GCTG	3	134598	134609	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	48475994
90	NC_021152	ATTC	3	135042	135053	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	48475994
91	NC_021152	TTTG	3	136494	136504	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	48475994
92	NC_021152	CCTT	3	138292	138303	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	48475994
93	NC_021152	CAGG	3	138623	138635	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	48475994
94	NC_021152	GTTT	3	144767	144777	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	48475994
95	NC_021152	TGAG	3	145988	145998	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	48475994
96	NC_021152	ACCA	3	147294	147304	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	48475994
97	NC_021152	CCGA	3	147688	147699	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	48475994
98	NC_021152	AGAA	4	148465	148480	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	48475994
99	NC_021152	GCTT	3	149302	149313	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	48475994
100	NC_021152	TTCA	3	149648	149658	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	48475994
101	NC_021152	GTCT	3	153532	153542	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	48475994
102	NC_021152	AACC	3	154136	154147	12	50 %	0 %	0 %	50 %	0 %	48475994
103	NC_021152	AGCT	3	157695	157705	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	48475994
104	NC_021152	AGTG	3	161076	161087	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	48475994
105	NC_021152	AAGC	3	162938	162949	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	48475994
106	NC_021152	CAGC	3	168649	168660	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	48475994
107	NC_021152	ATTC	3	169331	169342	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	48475994
108	NC_021152	CCGA	3	171061	171071	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	48475994
109	NC_021152	GAAA	3	172097	172108	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	48475994
110	NC_021152	CTAT	3	172784	172795	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	48475994
111	NC_021152	CCTT	3	174229	174240	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	48475994
112	NC_021152	AAAT	3	174359	174370	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	48475994
113	NC_021152	TTTC	4	174973	174988	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	48475994
114	NC_021152	TTTA	3	177251	177262	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	48475994
115	NC_021152	CTAA	3	178516	178527	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	48475994
116	NC_021152	CTTT	3	179245	179255	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	48475994
117	NC_021152	GGAA	3	179510	179520	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
118	NC_021152	ACGC	3	187680	187690	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	48475994
119	NC_021152	TTTC	3	189837	189847	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	48475994
120	NC_021152	TTCA	3	192349	192359	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	48475994
121	NC_021152	GCAA	3	193216	193227	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	48475994
122	NC_021152	TGGT	4	193377	193392	16	0 %	50 %	50 %	0 %	6 %	48475994
123	NC_021152	AAGC	3	194808	194819	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	48475994
124	NC_021152	AACG	3	197992	198004	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	48475994
125	NC_021152	TTTC	3	200127	200137	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	48475994
126	NC_021152	CCCT	3	200345	200355	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	48475994
127	NC_021152	GGTT	5	200385	200404	20	0 %	50 %	50 %	0 %	10 %	48475994
128	NC_021152	AAGC	3	202724	202734	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	48475994
129	NC_021152	AAGC	3	204179	204190	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	48475994
130	NC_021152	GCTT	3	204387	204397	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	48475994
131	NC_021152	TCCA	3	204415	204425	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	48475994
132	NC_021152	CTTC	3	208797	208809	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	48475994
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Liriodendron tulipifera mitochondrion