Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Liriodendron tulipifera mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_021152TTC4507518120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
2NC_021152GAG45355461233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
3NC_021152CTC41964319653110 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
4NC_021152ATG422173221841233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %48475993
5NC_021152TAA422285222961266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_021152TAA522796228101566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
7NC_021152GCT43465534665110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %48475994
8NC_021152CAT435839358491133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %48475994
9NC_021152GCT43795337965130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %48475994
10NC_021152AAC640385404011766.67 %0 %0 %33.33 %5 %48475994
11NC_021152TGC54085640871160 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %48475994
12NC_021152GGT44163941651130 %33.33 %66.67 %0 %7 %48475994
13NC_021152CTA442150421611233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %48475994
14NC_021152TCC44242042430110 %33.33 %0 %66.67 %9 %48475994
15NC_021152ACG442912429241333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %48475994
16NC_021152CTA445984459951233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %48475994
17NC_021152TGA446037460481233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %48475994
18NC_021152ACG447537475481233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %48475994
19NC_021152TTC44957049581120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
20NC_021152GAG449598496091233.33 %0 %66.67 %0 %8 %48475994
21NC_021152CTT45073550746120 %66.67 %0 %33.33 %0 %48475994
22NC_021152CTT45280152811110 %66.67 %0 %33.33 %9 %48475994
23NC_021152CTT55611756131150 %66.67 %0 %33.33 %6 %48475994
24NC_021152GCA459161591721233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %48475994
25NC_021152GCT46255062562130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %48475994
26NC_021152AAT464063640751366.67 %33.33 %0 %0 %7 %48475994
27NC_021152GAT465263652731133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %48475994
28NC_021152AGA466163661731166.67 %0 %33.33 %0 %9 %48475994
29NC_021152ACT470056700661133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %48475994
30NC_021152TGG47437474385120 %33.33 %66.67 %0 %8 %48475994
31NC_021152ATC478278782881133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %48475994
32NC_021152CTG47920379214120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %48475994
33NC_021152ACT480981809911133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %48475994
34NC_021152CTG58512385137150 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %48475994
35NC_021152TGA490631906421233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %48475994
36NC_021152TTC49338493395120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
37NC_021152AGC495197952081233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %48475994
38NC_021152AGC495281952921233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %48475994
39NC_021152ATG498270982801133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %48475994
40NC_021152GAG41086031086141233.33 %0 %66.67 %0 %8 %48475994
41NC_021152GTA41087921088031233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %48475994
42NC_021152CTT4115285115296120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
43NC_021152GTA41176811176911133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %48475994
44NC_021152GTA41177201177301133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %48475994
45NC_021152TCC5120740120753140 %33.33 %0 %66.67 %7 %48475994
46NC_021152ATT41213011213121233.33 %66.67 %0 %0 %8 %48475994
47NC_021152TCC4121500121512130 %33.33 %0 %66.67 %7 %48475994
48NC_021152CTT4122144122155120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
49NC_021152TGC4127443127454120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %48475994
50NC_021152CAT41280881280981133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %48475994
51NC_021152TAT41282261282371233.33 %66.67 %0 %0 %8 %48475994
52NC_021152TTA41284071284171133.33 %66.67 %0 %0 %9 %48475994
53NC_021152GCA41289141289241133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %48475994
54NC_021152TAC41385251385351133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %48475994
55NC_021152TCC4141226141236110 %33.33 %0 %66.67 %9 %48475994
56NC_021152ATT41437221437321133.33 %66.67 %0 %0 %9 %48475994
57NC_021152AGA41439641439741166.67 %0 %33.33 %0 %9 %48475994
58NC_021152ATA41463721463841366.67 %33.33 %0 %0 %7 %48475994
59NC_021152GTG4149659149669110 %33.33 %66.67 %0 %9 %48475994
60NC_021152TGT4150475150486120 %66.67 %33.33 %0 %8 %48475994
61NC_021152TGC5150498150512150 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %48475994
62NC_021152CAG41505641505751233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %48475994
63NC_021152ATA41543521543621166.67 %33.33 %0 %0 %9 %48475994
64NC_021152ATG41581391581501233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %48475994
65NC_021152CAA41585431585541266.67 %0 %0 %33.33 %8 %48475994
66NC_021152GAC51609011609151533.33 %0 %33.33 %33.33 %6 %48475994
67NC_021152GAG41619881619991233.33 %0 %66.67 %0 %8 %48475994
68NC_021152TTG4163392163402110 %66.67 %33.33 %0 %9 %48475994
69NC_021152AGA41635911636021266.67 %0 %33.33 %0 %8 %48475994
70NC_021152GGT4166810166821120 %33.33 %66.67 %0 %8 %48475994
71NC_021152GAC41717511717621233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %48475994
72NC_021152CTG4177951177961110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %48475994
73NC_021152TTC4178630178641120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
74NC_021152GAT41814921815021133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %48475994
75NC_021152GGT4182099182110120 %33.33 %66.67 %0 %8 %48475994
76NC_021152AGA41832951833061266.67 %0 %33.33 %0 %8 %48475994
77NC_021152GAA41843291843401266.67 %0 %33.33 %0 %8 %48475994
78NC_021152TCC4184602184612110 %33.33 %0 %66.67 %9 %48475994
79NC_021152CTA41891591891701233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %48475994
80NC_021152GTT4189711189723130 %66.67 %33.33 %0 %7 %48475994
81NC_021152TTG4189823189834120 %66.67 %33.33 %0 %8 %48475994
82NC_021152GCT5190550190564150 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %48475994
83NC_021152CTT5191333191347150 %66.67 %0 %33.33 %6 %48475994
84NC_021152GTC4193770193781120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %48475994
85NC_021152TTC4195058195069120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
86NC_021152GCT4195968195978110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %48475994
87NC_021152GTT4199393199404120 %66.67 %33.33 %0 %8 %48475994
88NC_021152CTA42006832006941233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %48475994
89NC_021152GAT52051562051691433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %48475994
90NC_021152CTT4205777205788120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
91NC_021152CTG4208339208350120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %48475994
92NC_021152AGG42086162086261133.33 %0 %66.67 %0 %9 %48475994
93NC_021152ATT42176902177021333.33 %66.67 %0 %0 %7 %48475994
94NC_021152TCT4217791217801110 %66.67 %0 %33.33 %9 %48475994
95NC_021152TCT7218817218837210 %66.67 %0 %33.33 %9 %48475994
96NC_021152TCT7218850218870210 %66.67 %0 %33.33 %9 %48475994
97NC_021152GAT42196452196561233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %48475994
98NC_021152TGA42203052203161233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %48475994
99NC_021152TCT4222805222816120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
100NC_021152TCT4223950223960110 %66.67 %0 %33.33 %9 %48475994
101NC_021152GCT4224125224136120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %48475994
102NC_021152AAG42242412242521266.67 %0 %33.33 %0 %8 %48475994
103NC_021152CTT4225622225633120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
104NC_021152TCT4226221226231110 %66.67 %0 %33.33 %9 %48475994
105NC_021152CTT4230156230167120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
106NC_021152GAA42316512316651566.67 %0 %33.33 %0 %6 %48475994
107NC_021152TCT4236748236758110 %66.67 %0 %33.33 %9 %48475994
108NC_021152CAT42376402376501133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %48475994
109NC_021152GGA42409252409361233.33 %0 %66.67 %0 %8 %48475994
110NC_021152TCG5244931244945150 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %48475994
111NC_021152GGA42453532453651333.33 %0 %66.67 %0 %7 %48475994
112NC_021152GTA42474502474601133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %48475994
113NC_021152ACT72495192495382033.33 %33.33 %0 %33.33 %5 %48475994
114NC_021152GCT4252474252486130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %48475994
115NC_021152TGT4252607252618120 %66.67 %33.33 %0 %8 %48475994
116NC_021152ATT42582812582921233.33 %66.67 %0 %0 %8 %48475994
117NC_021152CTC4262918262928110 %33.33 %0 %66.67 %9 %48475994
118NC_021152TCC4263024263034110 %33.33 %0 %66.67 %9 %48475994
119NC_021152TCT4266994267004110 %66.67 %0 %33.33 %9 %48475994
120NC_021152TGA42738822738931233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %48475994
121NC_021152ACT42785522785631233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %48475994
122NC_021152GCT4281960281970110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %48475994
123NC_021152GCT4282675282686120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %48475994
124NC_021152AGA42846722846821166.67 %0 %33.33 %0 %9 %48475994
125NC_021152TCT4285102285112110 %66.67 %0 %33.33 %9 %48475994
126NC_021152TGG5288060288074150 %33.33 %66.67 %0 %6 %48475994
127NC_021152CTA52919622919761533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %48475994
128NC_021152CTC4296219296229110 %33.33 %0 %66.67 %9 %48475994
129NC_021152TCT4296465296475110 %66.67 %0 %33.33 %9 %48475994
130NC_021152CTC4296627296637110 %33.33 %0 %66.67 %9 %48475994
131NC_021152GTA43001043001151233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %48475994
132NC_021152TAC43001183001281133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %48475994
133NC_021152GAT43028493028601233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %48475994
134NC_021152TCT4305893305904120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
135NC_021152GAA43070033070131166.67 %0 %33.33 %0 %9 %48475994
136NC_021152TAC63084313084481833.33 %33.33 %0 %33.33 %5 %48475994
137NC_021152GCT4308551308561110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %48475994
138NC_021152TCT4311152311163120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
139NC_021152AGA43123183123301366.67 %0 %33.33 %0 %7 %48475994
140NC_021152AGG43129753129851133.33 %0 %66.67 %0 %9 %48475994
141NC_021152TTC4315015315026120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
142NC_021152CTC4316262316273120 %33.33 %0 %66.67 %8 %48475994
143NC_021152ATC43177103177201133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %48475994
144NC_021152AAG43240003240121366.67 %0 %33.33 %0 %7 %48475994
145NC_021152ATG43240193240301233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %48475994
146NC_021152TAT83244543244762333.33 %66.67 %0 %0 %8 %48475994
147NC_021152TAT53244883245021533.33 %66.67 %0 %0 %6 %48475994
148NC_021152TAT43245063245171233.33 %66.67 %0 %0 %8 %48475994
149NC_021152AGA43246693246791166.67 %0 %33.33 %0 %9 %48475994
150NC_021152GAG43249103249201133.33 %0 %66.67 %0 %9 %48475994
151NC_021152CAG43260113260231333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %48475994
152NC_021152AAC43273983274111466.67 %0 %0 %33.33 %7 %48475994
153NC_021152GGA43282333282441233.33 %0 %66.67 %0 %8 %48475994
154NC_021152TAA43309423309521166.67 %33.33 %0 %0 %9 %48475994
155NC_021152ACT43326153326261233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %48475994
156NC_021152ACC43332133332251333.33 %0 %0 %66.67 %7 %48475994
157NC_021152ATA43349103349211266.67 %33.33 %0 %0 %8 %48475994
158NC_021152CTT4347950347961120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
159NC_021152GAA43522263522371266.67 %0 %33.33 %0 %8 %48475994
160NC_021152GTT5352255352268140 %66.67 %33.33 %0 %7 %48475994
161NC_021152CGA43531543531641133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %48475994
162NC_021152CCG4356207356217110 %0 %33.33 %66.67 %9 %48475994
163NC_021152AGA53574713574851566.67 %0 %33.33 %0 %6 %48475994
164NC_021152ATG43581553581661233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %48475994
165NC_021152AGT43585703585801133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %48475994
166NC_021152AGA43601413601511166.67 %0 %33.33 %0 %9 %48475994
167NC_021152TGG4365773365784120 %33.33 %66.67 %0 %8 %48475994
168NC_021152TCT4368725368736120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
169NC_021152TGG5369261369275150 %33.33 %66.67 %0 %6 %48475994
170NC_021152CGC4375079375090120 %0 %33.33 %66.67 %0 %48475994
171NC_021152CTG4375776375787120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %48475994
172NC_021152TCT4380189380199110 %66.67 %0 %33.33 %9 %48475994
173NC_021152AGG43828403828511233.33 %0 %66.67 %0 %8 %48475994
174NC_021152AGC73908613908802033.33 %0 %33.33 %33.33 %10 %48475994
175NC_021152AGA43920223920331266.67 %0 %33.33 %0 %8 %48475994
176NC_021152AGG43952423952541333.33 %0 %66.67 %0 %7 %48475994
177NC_021152GTC4397138397149120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %48475994
178NC_021152GAA43986163986271266.67 %0 %33.33 %0 %8 %48475994
179NC_021152CTT4400528400538110 %66.67 %0 %33.33 %9 %48475994
180NC_021152CGG4400899400910120 %0 %66.67 %33.33 %8 %48475994
181NC_021152TCT4400934400947140 %66.67 %0 %33.33 %7 %48475994
182NC_021152TCT4401117401127110 %66.67 %0 %33.33 %9 %48475994
183NC_021152GCG4401778401788110 %0 %66.67 %33.33 %9 %48475994
184NC_021152AGA44038294038401266.67 %0 %33.33 %0 %8 %48475994
185NC_021152CAG44074514074621233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %48475994
186NC_021152GAA44143654143761266.67 %0 %33.33 %0 %8 %48475994
187NC_021152GGA44145274145381233.33 %0 %66.67 %0 %8 %48475994
188NC_021152AAT44151064151171266.67 %33.33 %0 %0 %8 %48475994
189NC_021152GAG44210284210391233.33 %0 %66.67 %0 %8 %48475994
190NC_021152GTA44212174212281233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %48475994
191NC_021152CTT4427711427722120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
192NC_021152GGC4438683438694120 %0 %66.67 %33.33 %8 %48475994
193NC_021152TCC4442267442278120 %33.33 %0 %66.67 %8 %48475994
194NC_021152ACC44429654429751133.33 %0 %0 %66.67 %9 %48475994
195NC_021152GGT4448158448168110 %33.33 %66.67 %0 %9 %48475994
196NC_021152AGG44494224494321133.33 %0 %66.67 %0 %9 %48475994
197NC_021152GGA44518684518781133.33 %0 %66.67 %0 %9 %48475994
198NC_021152CAG54524364524491433.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %48475994
199NC_021152TTC4453052453063120 %66.67 %0 %33.33 %8 %48475994
200NC_021152TGA44553434553531133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %48475994
201NC_021152TTG4457482457493120 %66.67 %33.33 %0 %8 %48475994
202NC_021152GTA44591304591411233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %48475994
203NC_021152TTC4460758460768110 %66.67 %0 %33.33 %9 %48475994
204NC_021152GTA44611414611511133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %48475994
205NC_021152AGA44624424624531266.67 %0 %33.33 %0 %8 %48475994
206NC_021152CGC4463481463491110 %0 %33.33 %66.67 %9 %48475994
207NC_021152TCC4467903467915130 %33.33 %0 %66.67 %7 %Non-Coding
208NC_021152TCC4471203471214120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
209NC_021152CAG44810064810171233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
210NC_021152TCT4482637482649130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
211NC_021152TTA44826634826731133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
212NC_021152TTA44828344828451233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
213NC_021152GAA44833044833151266.67 %0 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
214NC_021152TAA44833894834001266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
215NC_021152GTT4484100484111120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
216NC_021152ATG44849104849241533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
217NC_021152AGA54877444877581566.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
218NC_021152TCG4487895487906120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
219NC_021152AAC44907194907291166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
220NC_021152ACG44912034912141233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
221NC_021152GGT4491257491267110 %33.33 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
222NC_021152TCT4492711492721110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
223NC_021152AGA44927224927341366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
224NC_021152GGA44931424931521133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
225NC_021152GTT4500822500833120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
226NC_021152GAA45019675019781266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
227NC_021152GAA45029965030071266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
228NC_021152CTC4507340507351120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
229NC_021152AGT45077105077211233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
230NC_021152AAG45099375099481266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
231NC_021152GAA45100595100691166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
232NC_021152GTC4513630513641120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %48475996
233NC_021152ATA45137905138021366.67 %33.33 %0 %0 %7 %48475996
234NC_021152GCA45145845145961333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %48475996
235NC_021152AGC45146245146361333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %48475996
236NC_021152GCG4515278515289120 %0 %66.67 %33.33 %8 %48475996
237NC_021152CTC7519225519245210 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
238NC_021152GCT4519778519790130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %Non-Coding
239NC_021152AGG45202845202951233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
240NC_021152TGA45225225225321133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
241NC_021152AGA45237665237761166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
242NC_021152TGT4524433524445130 %66.67 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
243NC_021152AGA45249715249821266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
244NC_021152TTG4526183526193110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
245NC_021152ACT45264585264691233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
246NC_021152GGA55273195273321433.33 %0 %66.67 %0 %7 %Non-Coding
247NC_021152GCT4530323530333110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
248NC_021152CTC4532533532544120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
249NC_021152CTT4532783532793110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
250NC_021152CAG45365735365831133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
251NC_021152AAC45394505394601166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
252NC_021152TAT45417575417691333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
253NC_021152TTA65421255421421833.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
254NC_021152TAC45425395425491133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
255NC_021152GAG55432475432611533.33 %0 %66.67 %0 %6 %Non-Coding
256NC_021152GAA45440315440421266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
257NC_021152TAC45457465457571233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
258NC_021152TGA65462665462841933.33 %33.33 %33.33 %0 %5 %Non-Coding
259NC_021152GAA45520655520761266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding