ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Liriodendron tulipifera mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021152	GA	6	3258	3268	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_021152	TC	6	15526	15536	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_021152	CT	6	30224	30234	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475994
4	NC_021152	TA	6	41185	41195	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48475994
5	NC_021152	TC	6	42063	42074	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	48475994
6	NC_021152	AG	6	51030	51041	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	48475994
7	NC_021152	GA	6	70554	70565	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	48475994
8	NC_021152	GA	6	75844	75854	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
9	NC_021152	AG	6	80017	80027	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
10	NC_021152	AG	6	80380	80390	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
11	NC_021152	CG	6	80958	80969	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	48475994
12	NC_021152	TC	6	92125	92135	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475994
13	NC_021152	CT	7	92223	92235	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	48475994
14	NC_021152	TA	6	96708	96719	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48475994
15	NC_021152	AT	7	103167	103179	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	48475994
16	NC_021152	AG	6	114596	114606	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
17	NC_021152	CT	6	114698	114708	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475994
18	NC_021152	AT	12	118597	118621	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48475994
19	NC_021152	CT	6	121423	121433	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475994
20	NC_021152	CT	6	121599	121609	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475994
21	NC_021152	TA	11	125728	125748	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48475994
22	NC_021152	AG	6	138032	138042	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
23	NC_021152	CT	6	139844	139855	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	48475994
24	NC_021152	CA	6	140850	140861	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	48475994
25	NC_021152	GT	7	161679	161693	15	0 %	50 %	50 %	0 %	6 %	48475994
26	NC_021152	GA	6	166630	166640	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
27	NC_021152	GA	6	188391	188401	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
28	NC_021152	AG	6	192255	192265	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
29	NC_021152	CT	6	210270	210280	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475994
30	NC_021152	GA	6	214115	214125	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
31	NC_021152	AG	6	216777	216787	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
32	NC_021152	AT	6	230498	230508	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48475994
33	NC_021152	AG	6	231199	231210	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	48475994
34	NC_021152	AT	9	238882	238899	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	48475994
35	NC_021152	TA	12	239493	239515	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48475994
36	NC_021152	TA	7	258830	258842	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	48475994
37	NC_021152	CG	6	264921	264932	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	48475994
38	NC_021152	CT	6	274492	274503	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	48475994
39	NC_021152	GA	8	283673	283688	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	48475994
40	NC_021152	AC	6	285894	285904	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	48475994
41	NC_021152	CT	6	302661	302671	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475994
42	NC_021152	TA	11	302861	302882	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48475994
43	NC_021152	GA	6	305554	305564	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
44	NC_021152	AC	7	306856	306869	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	48475994
45	NC_021152	AG	6	323794	323804	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
46	NC_021152	GA	6	328260	328270	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
47	NC_021152	TC	6	331311	331321	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475994
48	NC_021152	TC	6	337552	337562	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475994
49	NC_021152	GA	6	345730	345740	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
50	NC_021152	AG	6	353661	353671	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
51	NC_021152	AT	6	360474	360485	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48475994
52	NC_021152	TC	7	374400	374412	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	48475994
53	NC_021152	TA	6	376395	376407	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	48475994
54	NC_021152	GA	6	376591	376601	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
55	NC_021152	AG	9	378584	378601	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	48475994
56	NC_021152	GA	6	404809	404819	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
57	NC_021152	GA	7	407176	407188	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	48475994
58	NC_021152	AT	7	415592	415604	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	48475994
59	NC_021152	AG	6	427022	427032	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	48475994
60	NC_021152	CT	6	427124	427134	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475994
61	NC_021152	TC	6	453596	453606	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475994
62	NC_021152	AT	6	454448	454459	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48475994
63	NC_021152	AG	7	459838	459851	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	48475994
64	NC_021152	AT	7	461376	461389	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	48475994
65	NC_021152	AG	8	463887	463901	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	48475994
66	NC_021152	TA	8	482993	483008	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_021152	GA	6	487040	487050	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_021152	GA	6	489226	489239	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_021152	GA	7	489629	489641	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_021152	TA	6	508985	508995	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_021152	AG	8	519945	519959	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_021152	CT	6	529469	529480	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
73	NC_021152	GA	6	531214	531225	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_021152	AC	6	532671	532682	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
75	NC_021152	AT	6	537455	537466	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48475997
76	NC_021152	AG	6	543092	543102	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_021152	TA	6	543953	543964	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_021152	TA	11	543965	543986	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Liriodendron tulipifera mitochondrion