ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Liriodendron tulipifera mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021152	CAAC	3	3643	3654	12	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021152	AGCA	3	6307	6318	12	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021152	T	13	8610	8622	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021152	TAA	4	22796	22807	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021152	CCCTT	3	31648	31662	15	0 %	40 %	0 %	60 %	48475994
6	NC_021152	AGCA	3	32605	32616	12	50 %	0 %	25 %	25 %	48475994
7	NC_021152	AAGC	3	32665	32676	12	50 %	0 %	25 %	25 %	48475994
8	NC_021152	C	19	34735	34753	19	0 %	0 %	0 %	100 %	48475994
9	NC_021152	GCTA	3	37756	37767	12	25 %	25 %	25 %	25 %	48475994
10	NC_021152	AAC	4	40385	40396	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	48475994
11	NC_021152	TGC	4	40856	40867	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	48475994
12	NC_021152	AGGAC	3	42282	42296	15	40 %	0 %	40 %	20 %	48475994
13	NC_021152	C	19	43645	43663	19	0 %	0 %	0 %	100 %	48475994
14	NC_021152	ATGAA	3	44257	44271	15	60 %	20 %	20 %	0 %	48475994
15	NC_021152	GGGGT	3	46015	46029	15	0 %	20 %	80 %	0 %	48475994
16	NC_021152	AAAG	3	48936	48947	12	75 %	0 %	25 %	0 %	48475994
17	NC_021152	CTT	4	50735	50746	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	48475994
18	NC_021152	ATTC	3	51753	51764	12	25 %	50 %	0 %	25 %	48475994
19	NC_021152	AAAT	3	64661	64672	12	75 %	25 %	0 %	0 %	48475994
20	NC_021152	A	12	68842	68853	12	100 %	0 %	0 %	0 %	48475994
21	NC_021152	C	17	75985	76001	17	0 %	0 %	0 %	100 %	48475994
22	NC_021152	ATTC	3	79598	79609	12	25 %	50 %	0 %	25 %	48475994
23	NC_021152	TTCT	4	79781	79796	16	0 %	75 %	0 %	25 %	48475994
24	NC_021152	GGAGG	3	81503	81517	15	20 %	0 %	80 %	0 %	48475994
25	NC_021152	AGGA	3	82712	82723	12	50 %	0 %	50 %	0 %	48475994
26	NC_021152	GAATA	3	82742	82756	15	60 %	20 %	20 %	0 %	48475994
27	NC_021152	CTG	4	85123	85134	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	48475994
28	NC_021152	TATT	3	88228	88239	12	25 %	75 %	0 %	0 %	48475994
29	NC_021152	AAAG	3	90883	90894	12	75 %	0 %	25 %	0 %	48475994
30	NC_021152	CT	6	92224	92235	12	0 %	50 %	0 %	50 %	48475994
31	NC_021152	T	14	92312	92325	14	0 %	100 %	0 %	0 %	48475994
32	NC_021152	T	13	99980	99992	13	0 %	100 %	0 %	0 %	48475994
33	NC_021152	GAAA	3	101756	101767	12	75 %	0 %	25 %	0 %	48475994
34	NC_021152	AT	6	103167	103178	12	50 %	50 %	0 %	0 %	48475994
35	NC_021152	CAAG	3	108441	108452	12	50 %	0 %	25 %	25 %	48475994
36	NC_021152	TTCC	3	114460	114471	12	0 %	50 %	0 %	50 %	48475994
37	NC_021152	ACCA	3	116948	116959	12	50 %	0 %	0 %	50 %	48475994
38	NC_021152	AT	9	118601	118618	18	50 %	50 %	0 %	0 %	48475994
39	NC_021152	CTTC	3	120866	120877	12	0 %	50 %	0 %	50 %	48475994
40	NC_021152	AGAA	3	121651	121662	12	75 %	0 %	25 %	0 %	48475994
41	NC_021152	GAATA	3	124715	124729	15	60 %	20 %	20 %	0 %	48475994
42	NC_021152	C	17	127229	127245	17	0 %	0 %	0 %	100 %	48475994
43	NC_021152	CTTA	3	132736	132747	12	25 %	50 %	0 %	25 %	48475994
44	NC_021152	GAAAT	3	134128	134142	15	60 %	20 %	20 %	0 %	48475994
45	NC_021152	ATTC	3	135042	135053	12	25 %	50 %	0 %	25 %	48475994
46	NC_021152	CCTT	3	138292	138303	12	0 %	50 %	0 %	50 %	48475994
47	NC_021152	CCACT	3	141360	141374	15	20 %	20 %	0 %	60 %	48475994
48	NC_021152	CGAC	3	148002	148013	12	25 %	0 %	25 %	50 %	48475994
49	NC_021152	AGAA	3	148465	148476	12	75 %	0 %	25 %	0 %	48475994
50	NC_021152	GCTT	3	149302	149313	12	0 %	50 %	25 %	25 %	48475994
51	NC_021152	GTAAT	3	149493	149507	15	40 %	40 %	20 %	0 %	48475994
52	NC_021152	AACC	3	154136	154147	12	50 %	0 %	0 %	50 %	48475994
53	NC_021152	GTTGAG	3	161230	161247	18	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	48475994
54	NC_021152	GT	6	161679	161690	12	0 %	50 %	50 %	0 %	48475994
55	NC_021152	A	14	171657	171670	14	100 %	0 %	0 %	0 %	48475994
56	NC_021152	CTATA	6	172479	172508	30	40 %	40 %	0 %	20 %	48475994
57	NC_021152	CCTT	3	174229	174240	12	0 %	50 %	0 %	50 %	48475994
58	NC_021152	G	19	177517	177535	19	0 %	0 %	100 %	0 %	48475994
59	NC_021152	C	20	184026	184045	20	0 %	0 %	0 %	100 %	48475994
60	NC_021152	A	12	191633	191644	12	100 %	0 %	0 %	0 %	48475994
61	NC_021152	TGGT	3	193377	193388	12	0 %	50 %	50 %	0 %	48475994
62	NC_021152	TTGG	3	200395	200406	12	0 %	50 %	50 %	0 %	48475994
63	NC_021152	TCT	5	218820	218834	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	48475994
64	NC_021152	TCT	5	218856	218870	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	48475994
65	NC_021152	AGGA	3	225742	225753	12	50 %	0 %	50 %	0 %	48475994
66	NC_021152	GAA	4	231651	231662	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	48475994
67	NC_021152	TTAT	3	235882	235893	12	25 %	75 %	0 %	0 %	48475994
68	NC_021152	TA	7	239494	239507	14	50 %	50 %	0 %	0 %	48475994
69	NC_021152	GGCC	3	249614	249625	12	0 %	0 %	50 %	50 %	48475994
70	NC_021152	TAGC	3	252052	252063	12	25 %	25 %	25 %	25 %	48475994
71	NC_021152	TCGC	3	252930	252941	12	0 %	25 %	25 %	50 %	48475994
72	NC_021152	TA	6	258830	258841	12	50 %	50 %	0 %	0 %	48475994
73	NC_021152	ATCT	4	260954	260969	16	25 %	50 %	0 %	25 %	48475994
74	NC_021152	CTTT	3	262257	262268	12	0 %	75 %	0 %	25 %	48475994
75	NC_021152	TCGA	3	263306	263317	12	25 %	25 %	25 %	25 %	48475994
76	NC_021152	ACTG	3	264821	264832	12	25 %	25 %	25 %	25 %	48475994
77	NC_021152	ATTT	3	270796	270807	12	25 %	75 %	0 %	0 %	48475994
78	NC_021152	G	18	279353	279370	18	0 %	0 %	100 %	0 %	48475994
79	NC_021152	GA	6	283673	283684	12	50 %	0 %	50 %	0 %	48475994
80	NC_021152	CTTTG	3	290984	290998	15	0 %	60 %	20 %	20 %	48475994
81	NC_021152	TAAG	3	291004	291015	12	50 %	25 %	25 %	0 %	48475994
82	NC_021152	CTA	4	291965	291976	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48475994
83	NC_021152	G	24	293251	293274	24	0 %	0 %	100 %	0 %	48475994
84	NC_021152	TTGAT	3	297856	297870	15	20 %	60 %	20 %	0 %	48475994
85	NC_021152	TCAT	3	299618	299629	12	25 %	50 %	0 %	25 %	48475994
86	NC_021152	ATCA	3	299815	299826	12	50 %	25 %	0 %	25 %	48475994
87	NC_021152	TTAT	4	299948	299963	16	25 %	75 %	0 %	0 %	48475994
88	NC_021152	TAC	5	308431	308445	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48475994
89	NC_021152	AGAT	3	312437	312448	12	50 %	25 %	25 %	0 %	48475994
90	NC_021152	AAGC	3	318820	318831	12	50 %	0 %	25 %	25 %	48475994
91	NC_021152	TCAT	3	318983	318994	12	25 %	50 %	0 %	25 %	48475994
92	NC_021152	ACTAG	4	319370	319389	20	40 %	20 %	20 %	20 %	48475994
93	NC_021152	C	19	323602	323620	19	0 %	0 %	0 %	100 %	48475994
94	NC_021152	TTA	4	324487	324498	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48475994
95	NC_021152	AAC	4	327398	327409	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	48475994
96	NC_021152	G	18	327698	327715	18	0 %	0 %	100 %	0 %	48475994
97	NC_021152	TTCC	3	331632	331643	12	0 %	50 %	0 %	50 %	48475994
98	NC_021152	AGTAT	5	332568	332592	25	40 %	40 %	20 %	0 %	48475994
99	NC_021152	TTTG	3	335887	335898	12	0 %	75 %	25 %	0 %	48475994
100	NC_021152	T	13	354737	354749	13	0 %	100 %	0 %	0 %	48475994
101	NC_021152	AGA	4	357471	357482	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	48475994
102	NC_021152	TGG	4	369261	369272	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	48475994
103	NC_021152	CGC	4	375079	375090	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	48475994
104	NC_021152	AG	8	378584	378599	16	50 %	0 %	50 %	0 %	48475994
105	NC_021152	ATGG	3	381188	381199	12	25 %	25 %	50 %	0 %	48475994
106	NC_021152	ACTTT	4	394584	394603	20	20 %	60 %	0 %	20 %	48475994
107	NC_021152	GGTAGG	3	400591	400608	18	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	48475994
108	NC_021152	GCGA	3	402874	402885	12	25 %	0 %	50 %	25 %	48475994
109	NC_021152	C	23	404470	404492	23	0 %	0 %	0 %	100 %	48475994
110	NC_021152	GA	6	407176	407187	12	50 %	0 %	50 %	0 %	48475994
111	NC_021152	ATGC	4	407665	407680	16	25 %	25 %	25 %	25 %	48475994
112	NC_021152	G	16	411975	411990	16	0 %	0 %	100 %	0 %	48475994
113	NC_021152	TGTTT	3	413935	413949	15	0 %	80 %	20 %	0 %	48475994
114	NC_021152	AGCA	3	415432	415443	12	50 %	0 %	25 %	25 %	48475994
115	NC_021152	AT	6	415592	415603	12	50 %	50 %	0 %	0 %	48475994
116	NC_021152	CAAG	3	420866	420877	12	50 %	0 %	25 %	25 %	48475994
117	NC_021152	TTCC	3	426886	426897	12	0 %	50 %	0 %	50 %	48475994
118	NC_021152	GCCG	3	431963	431974	12	0 %	0 %	50 %	50 %	48475994
119	NC_021152	C	15	432173	432187	15	0 %	0 %	0 %	100 %	48475994
120	NC_021152	T	17	432602	432618	17	0 %	100 %	0 %	0 %	48475994
121	NC_021152	TTGA	3	435203	435214	12	25 %	50 %	25 %	0 %	48475994
122	NC_021152	CTTGA	3	441991	442005	15	20 %	40 %	20 %	20 %	48475994
123	NC_021152	CAAG	3	442769	442780	12	50 %	0 %	25 %	25 %	48475994
124	NC_021152	T	12	451637	451648	12	0 %	100 %	0 %	0 %	48475994
125	NC_021152	CAG	4	452436	452447	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	48475994
126	NC_021152	AGAT	3	454125	454136	12	50 %	25 %	25 %	0 %	48475994
127	NC_021152	T	12	456135	456146	12	0 %	100 %	0 %	0 %	48475994
128	NC_021152	AG	6	459838	459849	12	50 %	0 %	50 %	0 %	48475994
129	NC_021152	AG	6	463887	463898	12	50 %	0 %	50 %	0 %	48475994
130	NC_021152	G	14	465552	465565	14	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021152	CAGTAG	3	472113	472130	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_021152	AATG	3	473143	473154	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021152	G	19	477487	477505	19	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021152	TA	6	482993	483004	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021152	GAA	4	483304	483315	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021152	G	12	483602	483613	12	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021152	ATG	4	484910	484921	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021152	GA	6	489226	489237	12	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021152	GGCG	3	492012	492023	12	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021152	T	13	499468	499480	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021152	AACG	3	504918	504929	12	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021152	GGAT	3	511311	511322	12	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021152	AATG	3	513657	513668	12	50 %	25 %	25 %	0 %	48475996
144	NC_021152	AG	6	519945	519956	12	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021152	GGA	4	527319	527330	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021152	CTATTT	3	530014	530031	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_021152	CTTG	3	530108	530119	12	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021152	GTGAG	3	530494	530508	15	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021152	AGCC	3	533131	533142	12	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021152	AAAT	3	533706	533717	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021152	TTA	6	542125	542142	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021152	TA	7	543967	543980	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021152	GATA	3	545103	545114	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021152	TAGA	3	545150	545161	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021152	TGA	5	546266	546280	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021152	ATCG	3	546496	546507	12	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_021152	AAAG	3	553595	553606	12	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Liriodendron tulipifera mitochondrion