ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sepia pharaonis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021146	ATAGGT	3	223	240	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	48265163
2	NC_021146	TAT	4	657	669	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	48265163
3	NC_021146	ACA	4	1117	1128	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	48265163
4	NC_021146	TTTTA	3	1659	1672	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	48265163
5	NC_021146	TTAA	3	1763	1774	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48265163
6	NC_021146	TAT	4	1869	1880	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48265163
7	NC_021146	TATAA	3	2347	2360	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	48265163
8	NC_021146	TTTA	4	3089	3104	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	48265163
9	NC_021146	TTTTAT	3	3453	3471	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	48265163
10	NC_021146	TAT	5	3693	3707	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	48265163
11	NC_021146	TA	6	3717	3728	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48265163
12	NC_021146	ACTA	3	3882	3892	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	48265163
13	NC_021146	AATT	3	4281	4292	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	48265163
14	NC_021146	TA	6	4448	4458	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48265163
15	NC_021146	ATT	4	4581	4592	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48265164
16	NC_021146	ATT	4	4672	4683	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48265164
17	NC_021146	AATT	3	4752	4762	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48265164
18	NC_021146	TTA	5	5210	5224	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_021146	TAA	4	5480	5492	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	48265164
20	NC_021146	CTAA	3	5509	5519	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	48265164
21	NC_021146	ATA	4	5915	5925	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	48265164
22	NC_021146	ATT	4	7050	7061	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_021146	TATT	3	7126	7137	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021146	ATA	5	8283	8297	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_021146	ATA	4	8470	8482	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_021146	ATT	4	8497	8507	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_021146	TAA	4	8561	8572	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021146	ATATT	3	8652	8667	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_021146	TTAATA	3	8668	8686	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
30	NC_021146	ATA	4	8704	8714	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_021146	AT	14	8998	9025	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_021146	ATAAA	4	9258	9276	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
33	NC_021146	AT	6	9366	9377	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_021146	AT	18	9541	9576	36	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_021146	ATA	4	10081	10092	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_021146	ATA	4	10191	10201	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	48265164
37	NC_021146	TTA	4	10327	10338	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48265164
38	NC_021146	ATTT	3	10391	10402	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	48265164
39	NC_021146	TAT	4	11006	11017	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48265164
40	NC_021146	TTAA	3	11149	11160	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48265164
41	NC_021146	ATTT	3	11452	11462	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48265164
42	NC_021146	ATA	4	11815	11825	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	48265164
43	NC_021146	ATA	4	11995	12007	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	48265164
44	NC_021146	TA	6	12142	12153	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48265164
45	NC_021146	AAT	4	12162	12172	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	48265164
46	NC_021146	TAT	4	12359	12370	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48265164
47	NC_021146	TA	6	12857	12867	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48265164
48	NC_021146	ATA	4	13000	13011	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	48265164
49	NC_021146	AAT	4	13387	13398	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48265164
50	NC_021146	TA	6	13536	13547	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48265164
51	NC_021146	AAAT	3	14028	14038	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	48265164
52	NC_021146	ATA	5	14141	14155	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	48265164
53	NC_021146	A	13	14583	14595	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	48265164
54	NC_021146	ATA	5	14928	14941	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	48265164
55	NC_021146	ATT	4	15020	15030	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	48265164
56	NC_021146	AT	6	15158	15168	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48265164
57	NC_021146	AT	6	15443	15453	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_021146	TA	7	15652	15665	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_021146	ATAAA	4	15901	15919	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
60	NC_021146	AT	6	16009	16020	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_021146	AT	13	16184	16208	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Sepia pharaonis mitochondrion