ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Seculamonas ecuadoriensis strain ATCC 50688 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021128	AGT	4	1350	1361	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_021128	TAT	4	3731	3741	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167347
3	NC_021128	AAT	4	3941	3952	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167347
4	NC_021128	AAG	4	4711	4722	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_021128	ACA	4	4775	4785	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_021128	TTC	4	5447	5458	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50167347
7	NC_021128	TAC	4	6646	6657	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50167348
8	NC_021128	TAT	4	10875	10887	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_021128	TAA	4	11001	11012	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167348
10	NC_021128	ATA	4	12065	12077	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50167348
11	NC_021128	AAT	4	12098	12109	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167348
12	NC_021128	TAA	4	13139	13149	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167348
13	NC_021128	ATT	4	18140	18151	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167349
14	NC_021128	TTC	4	18275	18287	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	50167349
15	NC_021128	TGG	4	18482	18493	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	50167349
16	NC_021128	TAT	4	22101	22111	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167349
17	NC_021128	ATA	4	23098	23108	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167349
18	NC_021128	ATT	4	23639	23650	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167349
19	NC_021128	TAG	4	23794	23805	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50167349
20	NC_021128	ACC	4	24105	24117	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	50167349
21	NC_021128	TTA	4	25740	25750	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167349
22	NC_021128	GAT	4	35527	35538	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50167350
23	NC_021128	ATT	5	36666	36680	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	50167350
24	NC_021128	TAT	4	41755	41765	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_021128	ATT	4	41767	41777	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167351
26	NC_021128	TCA	4	41879	41890	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50167351
27	NC_021128	CAT	4	42652	42663	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50167351
28	NC_021128	AAT	4	44686	44697	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167351
29	NC_021128	TGT	4	44993	45004	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50167351
30	NC_021128	ATA	4	45006	45016	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167351
31	NC_021128	TAT	4	46695	46706	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	50167351
32	NC_021128	ATT	4	47030	47041	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_021128	TTG	4	55045	55056	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50167352
34	NC_021128	TGG	4	55086	55096	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	50167352
35	NC_021128	AGC	4	60925	60937	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	50167353
36	NC_021128	TAT	4	60989	60999	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_021128	TTA	4	62173	62183	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167353
38	NC_021128	TAA	4	65981	65993	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50167354

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Seculamonas ecuadoriensis strain ATCC 50688 mitochondrion