ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Seculamonas ecuadoriensis strain ATCC 50688 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021128	TGTA	3	1184	1194	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_021128	AGT	4	1350	1361	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_021128	TATT	3	3451	3462	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	50167347
4	NC_021128	TAT	4	3731	3741	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167347
5	NC_021128	AAT	4	3941	3952	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167347
6	NC_021128	TA	7	4375	4387	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_021128	AT	6	4390	4402	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_021128	AT	6	4404	4414	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_021128	AAG	4	4711	4722	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_021128	ACA	4	4775	4785	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
11	NC_021128	TTTA	3	5186	5197	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_021128	TACA	3	5198	5209	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
13	NC_021128	TTC	4	5447	5458	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50167347
14	NC_021128	GTAA	3	6444	6454	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	50167348
15	NC_021128	TAC	4	6646	6657	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50167348
16	NC_021128	TA	10	7401	7420	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_021128	TACA	3	10188	10199	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	50167348
18	NC_021128	TAT	4	10875	10887	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_021128	TAA	4	11001	11012	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167348
20	NC_021128	ATA	4	12065	12077	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50167348
21	NC_021128	AAT	4	12098	12109	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167348
22	NC_021128	AT	6	12329	12339	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167348
23	NC_021128	TAA	4	13139	13149	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167348
24	NC_021128	TA	12	15003	15024	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_021128	ATTTT	3	15570	15583	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_021128	TTAGA	3	15600	15614	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	50167348
27	NC_021128	AT	8	15843	15859	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_021128	TA	6	16197	16207	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_021128	TTATTT	3	17208	17226	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	50167349
30	NC_021128	ATT	4	18140	18151	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167349
31	NC_021128	TTC	4	18275	18287	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	50167349
32	NC_021128	CTAT	3	18288	18298	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	50167349
33	NC_021128	TGG	4	18482	18493	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	50167349
34	NC_021128	TAGA	3	20039	20049	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	50167349
35	NC_021128	TAATT	3	20855	20869	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	50167349
36	NC_021128	AT	6	21093	21104	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_021128	TTAC	3	21112	21123	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
38	NC_021128	CCAA	3	21629	21640	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
39	NC_021128	TAATA	3	21763	21777	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_021128	TAT	4	22101	22111	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167349
41	NC_021128	TAGA	3	22372	22382	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	50167349
42	NC_021128	ATA	4	23098	23108	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167349
43	NC_021128	AATA	3	23489	23500	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	50167349
44	NC_021128	ATT	4	23639	23650	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167349
45	NC_021128	TAG	4	23794	23805	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50167349
46	NC_021128	ACC	4	24105	24117	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	50167349
47	NC_021128	GCTAA	3	24934	24948	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	50167349
48	NC_021128	TA	6	25525	25536	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50167349
49	NC_021128	TTA	4	25740	25750	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167349
50	NC_021128	AT	6	26852	26863	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50167350
51	NC_021128	TTAT	3	27744	27754	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_021128	ATAG	3	31121	31131	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	50167350
53	NC_021128	GAT	4	35527	35538	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50167350
54	NC_021128	ATT	5	36666	36680	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	50167350
55	NC_021128	TAGA	3	37322	37333	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_021128	AT	6	38982	38992	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_021128	ATTT	3	41661	41671	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50167351
58	NC_021128	TAT	4	41755	41765	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_021128	ATT	4	41767	41777	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167351
60	NC_021128	TCA	4	41879	41890	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50167351
61	NC_021128	CAT	4	42652	42663	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50167351
62	NC_021128	CATT	3	43692	43702	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	50167351
63	NC_021128	ATAA	3	43870	43881	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50167351
64	NC_021128	AAT	4	44686	44697	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167351
65	NC_021128	TGT	4	44993	45004	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50167351
66	NC_021128	ATA	4	45006	45016	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167351
67	NC_021128	ACTA	3	45058	45068	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
68	NC_021128	CTTA	3	45143	45155	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
69	NC_021128	AAAT	3	45323	45333	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	50167351
70	NC_021128	AT	9	46078	46094	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_021128	TTAA	3	46581	46592	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_021128	TAT	4	46695	46706	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	50167351
73	NC_021128	ATT	4	47030	47041	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_021128	CATG	3	47269	47279	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	50167351
75	NC_021128	AT	6	49578	49588	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167352
76	NC_021128	CTTT	3	49589	49600	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	50167352
77	NC_021128	TA	6	50100	50110	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167352
78	NC_021128	TTTA	3	52150	52160	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50167352
79	NC_021128	TTG	4	55045	55056	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50167352
80	NC_021128	TGG	4	55086	55096	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	50167352
81	NC_021128	AAAAAG	3	55297	55315	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
82	NC_021128	GAAG	3	56271	56281	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	50167352
83	NC_021128	AT	6	58161	58171	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167352
84	NC_021128	ATAAA	3	59623	59637	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_021128	AAAT	3	60635	60646	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_021128	AGC	4	60925	60937	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	50167353
87	NC_021128	TAT	4	60989	60999	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_021128	TTA	4	62173	62183	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167353
89	NC_021128	CAAA	3	63001	63011	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	50167353
90	NC_021128	AAAG	3	64293	64303	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50167354
91	NC_021128	AAAT	3	64770	64780	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	50167354
92	NC_021128	TAAA	3	65080	65091	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50167354
93	NC_021128	TAA	4	65981	65993	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50167354
94	NC_021128	AGAAA	3	66003	66017	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	50167354
95	NC_021128	TA	12	66459	66481	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_021128	TA	7	66704	66716	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	50167354
97	NC_021128	TAAA	3	67506	67516	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	50167354

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