ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Jakoba libera strain ATCC 50422 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021127	AAAAAG	3	9650	9667	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_021127	ATAAAA	3	11388	11406	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	50159524
3	NC_021127	AAAAGG	3	12978	12996	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
4	NC_021127	CTTGTA	5	20372	20401	30	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	6 %	50159525
5	NC_021127	TAGATG	6	22653	22688	36	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_021127	GAAAAA	3	26068	26085	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	50159526
7	NC_021127	ATTAGA	3	27013	27031	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
8	NC_021127	TTCTTT	3	27102	27120	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
9	NC_021127	CTCTTC	3	28580	28597	18	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	50159526
10	NC_021127	TCCTTG	6	30365	30400	36	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	8 %	50159526
11	NC_021127	AGAAAA	3	33546	33564	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	50159527
12	NC_021127	AAAAGA	3	35491	35509	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
13	NC_021127	GTTTAG	3	36599	36616	18	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	0 %	50159527
14	NC_021127	ATAGGA	12	41898	41969	72	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_021127	CAAGAG	5	43464	43493	30	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	6 %	Non-Coding
16	NC_021127	ATAGTA	7	48696	48737	42	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_021127	TTGGAA	3	55161	55179	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10 %	50159529
18	NC_021127	ATGATA	4	56219	56242	24	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_021127	ACTTTC	3	64893	64910	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	50159529
20	NC_021127	ATTTTG	4	66837	66860	24	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_021127	CTTTTC	3	78138	78156	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	50159530
22	NC_021127	CTTTTC	3	80297	80314	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
23	NC_021127	CTTATA	3	84774	84791	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
24	NC_021127	ATTCTA	10	85988	86047	60	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	50159531
25	NC_021127	TACTTC	10	95508	95567	60	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	8 %	50159532
26	NC_021127	CTTCTA	10	95585	95644	60	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	6 %	50159532
27	NC_021127	TGGTAT	3	96393	96410	18	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	5 %	50159532
28	NC_021127	TTCCTT	3	96773	96791	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	50159532
29	NC_021127	ACCATT	3	98401	98419	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	50159532

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Jakoba libera strain ATCC 50422 mitochondrion