Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Jakoba libera strain ATCC 50422 mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_021127TGT4133143110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
2NC_021127TGT4304314110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
3NC_021127TGT4475485110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
4NC_021127TGT4646656110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
5NC_021127TGT4817827110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
6NC_021127TGT4988998110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
7NC_021127TTCT310831093110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
8NC_021127TCT413271337110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
9NC_021127AATGA4151915382060 %20 %20 %0 %5 %Non-Coding
10NC_021127AATGC4161416332040 %20 %20 %20 %5 %50159524
11NC_021127TTG425212531110 %66.67 %33.33 %0 %9 %50159524
12NC_021127AGA4602660361166.67 %0 %33.33 %0 %9 %50159524
13NC_021127TTTC363256336120 %75 %0 %25 %8 %50159524
14NC_021127TTAG3662366331125 %50 %25 %0 %9 %50159524
15NC_021127GAAA3695469651275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
16NC_021127AGT4758575951133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %50159524
17NC_021127AAG4773677471266.67 %0 %33.33 %0 %8 %50159524
18NC_021127AAG4799480041166.67 %0 %33.33 %0 %9 %50159524
19NC_021127AAAG3910391131175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
20NC_021127AAAAAG3965096671883.33 %0 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
21NC_021127GAAAA3967496881580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
22NC_021127ATAAA310255102691580 %20 %0 %0 %0 %50159524
23NC_021127ATA410312103231266.67 %33.33 %0 %0 %8 %50159524
24NC_021127ATAAAA311388114061983.33 %16.67 %0 %0 %5 %50159524
25NC_021127GAAAT612647126813560 %20 %20 %0 %8 %Non-Coding
26NC_021127AAAAGG312978129961966.67 %0 %33.33 %0 %5 %Non-Coding
27NC_021127AGA413467134771166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
28NC_021127CTAA315130151411250 %25 %0 %25 %8 %50159525
29NC_021127TCA516869168821433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %50159525
30NC_021127TCA516887169011533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %50159525
31NC_021127AAG417043170551366.67 %0 %33.33 %0 %7 %50159525
32NC_021127ATGA318197182071150 %25 %25 %0 %9 %50159525
33NC_021127AAAG318585185961275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
34NC_021127AAAG318604186151275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
35NC_021127TTTC41880818823160 %75 %0 %25 %6 %50159525
36NC_021127CTTGTA520372204013016.67 %50 %16.67 %16.67 %6 %50159525
37NC_021127ACA420758207681166.67 %0 %0 %33.33 %9 %50159525
38NC_021127GAAT621520215432450 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
39NC_021127TCT42259522605110 %66.67 %0 %33.33 %9 %50159525
40NC_021127TAGATG622653226883633.33 %33.33 %33.33 %0 %5 %Non-Coding
41NC_021127TAA424061240721266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
42NC_021127AAAG324200242101175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
43NC_021127AAGA324307243181275 %0 %25 %0 %0 %50159526
44NC_021127ATA424324243351266.67 %33.33 %0 %0 %8 %50159526
45NC_021127GAAAAA326068260851883.33 %0 %16.67 %0 %5 %50159526
46NC_021127AAG726106261252066.67 %0 %33.33 %0 %10 %50159526
47NC_021127ATTAGA327013270311950 %33.33 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
48NC_021127TTCTTT32710227120190 %83.33 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
49NC_021127AAAG327270272811275 %0 %25 %0 %8 %50159526
50NC_021127GAAAA327657276701480 %0 %20 %0 %7 %50159526
51NC_021127GTT42821028221120 %66.67 %33.33 %0 %8 %50159526
52NC_021127CTCTTC32858028597180 %50 %0 %50 %5 %50159526
53NC_021127TGT42868628697120 %66.67 %33.33 %0 %8 %50159526
54NC_021127GAAAA329555295691580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
55NC_021127AAAGA329676296891480 %0 %20 %0 %7 %Non-Coding
56NC_021127GTAA330111301221250 %25 %25 %0 %8 %50159526
57NC_021127TCCTTG63036530400360 %50 %16.67 %33.33 %8 %50159526
58NC_021127TAA430654306661366.67 %33.33 %0 %0 %7 %50159526
59NC_021127AAG431264312751266.67 %0 %33.33 %0 %8 %50159526
60NC_021127TAAA331907319191375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
61NC_021127TAA432045320561266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
62NC_021127GAA432296323071266.67 %0 %33.33 %0 %8 %50159527
63NC_021127AGT432588325991233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %50159527
64NC_021127TAAA332834328441175 %25 %0 %0 %9 %50159527
65NC_021127AAAG332987329981275 %0 %25 %0 %8 %50159527
66NC_021127AAGA333239332501275 %0 %25 %0 %8 %50159527
67NC_021127AAGA533258332761975 %0 %25 %0 %10 %50159527
68NC_021127AGAAAA333546335641983.33 %0 %16.67 %0 %5 %50159527
69NC_021127AGGAA333876338911660 %0 %40 %0 %6 %50159527
70NC_021127TTCT33509135103130 %75 %0 %25 %7 %50159527
71NC_021127AAAAGA335491355091983.33 %0 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
72NC_021127AGAA336084360941175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
73NC_021127GAAAA436138361572080 %0 %20 %0 %5 %Non-Coding
74NC_021127GTTTAG336599366161816.67 %50 %33.33 %0 %0 %50159527
75NC_021127AAAG337013370231175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
76NC_021127CATG337588375981125 %25 %25 %25 %9 %50159527
77NC_021127TTGAT337804378191620 %60 %20 %0 %6 %50159527
78NC_021127ATA438772387821166.67 %33.33 %0 %0 %9 %50159528
79NC_021127GAT439355393651133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %50159528
80NC_021127TCA439835398451133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
81NC_021127AAAG339860398701175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
82NC_021127TAAG341360413701150 %25 %25 %0 %9 %50159528
83NC_021127ATAGGA1241898419697250 %16.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
84NC_021127AAGT342359423701250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
85NC_021127GAA443284432941166.67 %0 %33.33 %0 %9 %50159528
86NC_021127CAAGAG543464434933050 %0 %33.33 %16.67 %6 %Non-Coding
87NC_021127AAGA343640436501175 %0 %25 %0 %9 %50159528
88NC_021127CTTT34383443846130 %75 %0 %25 %7 %50159528
89NC_021127AGTA346144461551250 %25 %25 %0 %8 %50159528
90NC_021127CATT346513465231125 %50 %0 %25 %9 %50159528
91NC_021127ATAA346691467021275 %25 %0 %0 %8 %50159528
92NC_021127ATA547669476821466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
93NC_021127TTTC34793747947110 %75 %0 %25 %9 %50159529
94NC_021127TAAT348643486541250 %50 %0 %0 %8 %50159529
95NC_021127ATAGTA748696487374250 %33.33 %16.67 %0 %7 %Non-Coding
96NC_021127AATC350599506091150 %25 %0 %25 %9 %50159529
97NC_021127AGA450756507671266.67 %0 %33.33 %0 %8 %50159529
98NC_021127AAT451653516631166.67 %33.33 %0 %0 %9 %50159529
99NC_021127TAAT351847518581250 %50 %0 %0 %8 %50159529
100NC_021127AAAT352031520411175 %25 %0 %0 %9 %50159529
101NC_021127ATT452088520991233.33 %66.67 %0 %0 %8 %50159529
102NC_021127ATTT352529525391125 %75 %0 %0 %9 %50159529
103NC_021127AATC352663526741250 %25 %0 %25 %8 %50159529
104NC_021127CTT45357653586110 %66.67 %0 %33.33 %9 %50159529
105NC_021127CTTT45359053605160 %75 %0 %25 %6 %50159529
106NC_021127TTTGT35412354137150 %80 %20 %0 %6 %50159529
107NC_021127TTCT35436354373110 %75 %0 %25 %9 %50159529
108NC_021127TTTA354416544261125 %75 %0 %0 %9 %50159529
109NC_021127CTTT35458554595110 %75 %0 %25 %9 %50159529
110NC_021127TTGGAA355161551791933.33 %33.33 %33.33 %0 %10 %50159529
111NC_021127TAAA355851558611175 %25 %0 %0 %9 %50159529
112NC_021127TAAA356080560901175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
113NC_021127ATGATA456219562422450 %33.33 %16.67 %0 %8 %Non-Coding
114NC_021127CAA457229572391166.67 %0 %0 %33.33 %9 %50159529
115NC_021127AATA358010580211275 %25 %0 %0 %8 %50159529
116NC_021127AATT358042580531250 %50 %0 %0 %8 %50159529
117NC_021127ATT458526585371233.33 %66.67 %0 %0 %8 %50159529
118NC_021127TTCT36042660437120 %75 %0 %25 %8 %50159529
119NC_021127ATTT360720607311225 %75 %0 %0 %8 %50159529
120NC_021127AAGT362341623521250 %25 %25 %0 %8 %50159529
121NC_021127ATAA362658626691275 %25 %0 %0 %8 %50159529
122NC_021127TTTC36312763137110 %75 %0 %25 %9 %50159529
123NC_021127TGT46442364433110 %66.67 %33.33 %0 %9 %50159529
124NC_021127TAA464556645671266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
125NC_021127ACTTTC364893649101816.67 %50 %0 %33.33 %5 %50159529
126NC_021127AAAT366447664581275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
127NC_021127ATTTTG466837668602416.67 %66.67 %16.67 %0 %8 %Non-Coding
128NC_021127TTAG366886668961125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
129NC_021127GTTT36772067731120 %75 %25 %0 %8 %50159529
130NC_021127TAC468461684721233.33 %33.33 %0 %33.33 %0 %50159529
131NC_021127ATTG368749687601225 %50 %25 %0 %8 %50159529
132NC_021127AAAC369454694651275 %0 %0 %25 %8 %50159529
133NC_021127TTCTC37080670819140 %60 %0 %40 %7 %50159530
134NC_021127AAGT371316713271250 %25 %25 %0 %8 %50159530
135NC_021127ATCT371911719221225 %50 %0 %25 %8 %50159530
136NC_021127CTG47428574296120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %50159530
137NC_021127TTTG37534575355110 %75 %25 %0 %9 %50159530
138NC_021127ATTT375830758411225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
139NC_021127TGTT37597975989110 %75 %25 %0 %9 %50159530
140NC_021127ATT476990770001133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
141NC_021127CTT47756977580120 %66.67 %0 %33.33 %8 %50159530
142NC_021127TAA477759777691166.67 %33.33 %0 %0 %9 %50159530
143NC_021127GCTTG37796177976160 %40 %40 %20 %6 %50159530
144NC_021127CTTTTC37813878156190 %66.67 %0 %33.33 %10 %50159530
145NC_021127TTTCT37909079104150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
146NC_021127ATTT379340793501125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
147NC_021127TTTC38025180261110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
148NC_021127CTTT38026880278110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
149NC_021127CTTTTC38029780314180 %66.67 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
150NC_021127TTTA380614806251225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
151NC_021127TTCT38148481495120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
152NC_021127AGA482676826871266.67 %0 %33.33 %0 %8 %50159531
153NC_021127TCT48286082870110 %66.67 %0 %33.33 %9 %50159531
154NC_021127GTT48334083351120 %66.67 %33.33 %0 %8 %50159531
155NC_021127TTCT38359383604120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
156NC_021127TAT483727837371133.33 %66.67 %0 %0 %9 %50159531
157NC_021127AGTT383891839011125 %50 %25 %0 %9 %50159531
158NC_021127TAAAG384050840631460 %20 %20 %0 %7 %50159531
159NC_021127ATTTG384637846511520 %60 %20 %0 %6 %Non-Coding
160NC_021127CTAC384655846661225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
161NC_021127ACT484740847501133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
162NC_021127CTTATA384774847911833.33 %50 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
163NC_021127TAC484861848721233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
164NC_021127CTT48495984970120 %66.67 %0 %33.33 %8 %50159531
165NC_021127ATTCTA1085988860476033.33 %50 %0 %16.67 %8 %50159531
166NC_021127TTTA386376863861125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
167NC_021127AAGA387921879321275 %0 %25 %0 %8 %50159531
168NC_021127TAGA388712887221150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
169NC_021127CATTT389909899241620 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
170NC_021127CTT49143091440110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
171NC_021127TCT49207492084110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
172NC_021127TTTC59276692786210 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
173NC_021127TCTT39314193151110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
174NC_021127CTTTT39327693289140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
175NC_021127TTACA393921939351540 %40 %0 %20 %6 %50159531
176NC_021127ATTT394041940511125 %75 %0 %0 %9 %50159531
177NC_021127CTTTA394121941351520 %60 %0 %20 %6 %50159531
178NC_021127TCT49439694406110 %66.67 %0 %33.33 %9 %50159532
179NC_021127TCT49530595317130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
180NC_021127TTTCT49531395332200 %80 %0 %20 %5 %Non-Coding
181NC_021127TTCAT595349953732520 %60 %0 %20 %8 %Non-Coding
182NC_021127TAAA395477954871175 %25 %0 %0 %9 %50159532
183NC_021127TACTTC1095508955676016.67 %50 %0 %33.33 %8 %50159532
184NC_021127CTTCTA1095585956446016.67 %50 %0 %33.33 %6 %50159532
185NC_021127TAAC395772957831250 %25 %0 %25 %8 %50159532
186NC_021127TTC49604196052120 %66.67 %0 %33.33 %8 %50159532
187NC_021127TGGTAT396393964101816.67 %50 %33.33 %0 %5 %50159532
188NC_021127ATC496459964691133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %50159532
189NC_021127TTC59649896512150 %66.67 %0 %33.33 %6 %50159532
190NC_021127TTCCTT39677396791190 %66.67 %0 %33.33 %10 %50159532
191NC_021127TTTCC79710097134350 %60 %0 %40 %8 %Non-Coding
192NC_021127TACAC398083980971540 %20 %0 %40 %6 %Non-Coding
193NC_021127ACCATT398401984191933.33 %33.33 %0 %33.33 %5 %50159532
194NC_021127TTGAC398589986031520 %40 %20 %20 %6 %50159532
195NC_021127GCATT498620986392020 %40 %20 %20 %5 %50159532
196NC_021127CATT398707987191325 %50 %0 %25 %7 %50159532
197NC_021127AGA498918989281166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
198NC_021127AGAA399160991701175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding