ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Jakoba bahamiensis strain ATCC 50695 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021126	GCCA	3	1083	1094	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
2	NC_021126	TTA	4	4603	4613	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50159516
3	NC_021126	ATTT	3	4620	4632	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	50159516
4	NC_021126	TAA	4	5035	5046	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50159516
5	NC_021126	TGC	4	6266	6277	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	50159516
6	NC_021126	TC	6	8305	8316	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	50159516
7	NC_021126	ATTT	3	8672	8683	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50159517
8	NC_021126	TAT	4	10507	10517	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50159517
9	NC_021126	TTCA	3	11397	11408	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	50159517
10	NC_021126	A	12	11851	11862	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	50159517
11	NC_021126	AT	6	12315	12325	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_021126	AT	6	12329	12339	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_021126	ATGT	3	12586	12597	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_021126	TTTA	3	12830	12841	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50159517
15	NC_021126	TTAT	3	12902	12913	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	50159517
16	NC_021126	TTTAT	3	12981	12996	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	50159517
17	NC_021126	ATTT	3	13846	13857	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50159517
18	NC_021126	T	13	15121	15133	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	50159517
19	NC_021126	TTTA	3	16409	16420	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50159517
20	NC_021126	T	12	16434	16445	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	50159517
21	NC_021126	TAT	4	16565	16575	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50159517
22	NC_021126	TTAAA	3	16730	16744	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	50159517
23	NC_021126	TTGT	3	17981	17991	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	50159517
24	NC_021126	TA	8	18064	18078	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_021126	ATT	4	18080	18090	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_021126	ATTT	3	18833	18843	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50159518
27	NC_021126	CTT	4	18908	18919	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50159518
28	NC_021126	TA	6	19432	19442	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50159518
29	NC_021126	AT	6	19514	19525	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50159518
30	NC_021126	ATTTT	3	20236	20249	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	50159518
31	NC_021126	GGTT	3	20896	20906	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	50159518
32	NC_021126	TAT	4	21988	21999	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50159518
33	NC_021126	TATT	4	22417	22432	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_021126	AATTT	3	22450	22464	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_021126	AAAT	3	22858	22868	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_021126	AT	6	23358	23370	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	50159518
37	NC_021126	ATT	4	23685	23696	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50159518
38	NC_021126	AT	7	25100	25113	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	50159518
39	NC_021126	AT	6	25926	25936	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50159519
40	NC_021126	ATT	4	27775	27786	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50159519
41	NC_021126	TTTG	3	29392	29402	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	50159519
42	NC_021126	TTTG	3	29449	29460	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	50159519
43	NC_021126	T	14	29517	29530	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	50159519
44	NC_021126	CTA	4	30517	30529	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	50159519
45	NC_021126	TATT	3	30955	30966	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50159519
46	NC_021126	AGC	4	31727	31737	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
47	NC_021126	ATTT	3	32788	32798	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50159519
48	NC_021126	AGA	5	33561	33575	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	50159519
49	NC_021126	AATA	3	33765	33776	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_021126	TGT	4	34518	34529	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50159519
51	NC_021126	TTA	4	35663	35675	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50159520
52	NC_021126	GAATT	3	36416	36431	16	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_021126	TAA	4	37331	37342	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50159520
54	NC_021126	TA	6	37377	37387	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50159520
55	NC_021126	AGAAA	3	37508	37521	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	50159520
56	NC_021126	ATT	4	38067	38077	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_021126	ATT	4	38344	38355	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50159520
58	NC_021126	AAG	4	39435	39446	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50159520
59	NC_021126	TTTC	3	39481	39491	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	50159520
60	NC_021126	ATC	4	40580	40590	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	50159520
61	NC_021126	TTA	4	42761	42773	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50159520
62	NC_021126	TAAA	3	44365	44377	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	50159520
63	NC_021126	TAT	4	44580	44590	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50159520
64	NC_021126	TCATT	3	46540	46555	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	50159520
65	NC_021126	ATT	4	46583	46594	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50159520
66	NC_021126	TAT	5	46785	46799	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	50159520
67	NC_021126	TGT	4	50022	50033	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50159520
68	NC_021126	TAA	4	50357	50368	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50159520
69	NC_021126	TGTT	3	51859	51869	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	50159521
70	NC_021126	TTG	4	52315	52326	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50159521
71	NC_021126	GTTC	3	53911	53921	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	50159521
72	NC_021126	ATAGAG	3	54110	54126	17	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	50159521
73	NC_021126	TAA	4	55086	55097	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50159521
74	NC_021126	AAG	4	55267	55278	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50159521
75	NC_021126	CAAAA	3	56281	56294	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	50159521
76	NC_021126	ACAG	3	56394	56405	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	50159521
77	NC_021126	GTATTA	3	57222	57240	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	50159521
78	NC_021126	TGT	4	58147	58158	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50159522
79	NC_021126	GTAT	3	58368	58379	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	50159522
80	NC_021126	GTAAG	3	58449	58463	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	50159522
81	NC_021126	TTG	4	58980	58990	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	50159522
82	NC_021126	ATT	4	59490	59501	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50159522
83	NC_021126	T	12	59557	59568	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	50159522
84	NC_021126	TTTA	3	59677	59687	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50159522
85	NC_021126	TTTGT	3	59769	59783	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	50159522
86	NC_021126	TTAA	3	60434	60446	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_021126	TTTG	3	62810	62821	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_021126	TATT	3	62859	62869	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50159522
89	NC_021126	AT	7	63163	63175	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	50159522
90	NC_021126	ATTT	3	63721	63732	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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