ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Histiona aroides mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021125	GTA	4	435	445	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_021125	AGA	4	4614	4626	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	51094900
3	NC_021125	ATA	4	7848	7858	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51094900
4	NC_021125	TAA	4	9736	9747	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51094900
5	NC_021125	TAG	4	10600	10610	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51094900
6	NC_021125	TAA	4	10990	11001	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51094900
7	NC_021125	TAT	4	11460	11470	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51094900
8	NC_021125	ATA	4	12960	12971	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51094900
9	NC_021125	ATG	4	18334	18346	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	51094900
10	NC_021125	AAG	4	20979	20991	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	51094901
11	NC_021125	TAC	4	21018	21029	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_021125	TCA	4	23114	23124	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51094901
13	NC_021125	TGG	4	23629	23639	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	51094901
14	NC_021125	GTG	4	25611	25621	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	51094901
15	NC_021125	GAA	5	32599	32612	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	51094902
16	NC_021125	TAA	5	33467	33481	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51094903
17	NC_021125	AAT	5	34065	34080	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51094903
18	NC_021125	TAT	4	34994	35004	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_021125	TAT	5	36203	36216	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_021125	AAG	4	39054	39065	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51094903
21	NC_021125	CTG	4	39752	39763	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51094903
22	NC_021125	TCA	4	40952	40962	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51094903
23	NC_021125	ACC	4	44831	44843	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	51094904
24	NC_021125	ATA	5	45547	45561	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51094904
25	NC_021125	TAT	4	48412	48422	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_021125	TTG	4	50363	50373	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	51094905
27	NC_021125	TTG	4	52543	52555	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	51094905
28	NC_021125	ATT	4	58558	58569	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51094906
29	NC_021125	TAA	4	61438	61449	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51094906
30	NC_021125	TAC	4	62771	62781	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51094906
31	NC_021125	TTG	4	63161	63173	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	51094906
32	NC_021125	ACT	4	64256	64267	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51094906
33	NC_021125	TAG	4	64282	64293	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51094906
34	NC_021125	CTA	4	67757	67768	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51094906

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Histiona aroides mitochondrion