ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Histiona aroides mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021125	GTA	4	435	445	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_021125	TA	7	3927	3939	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51094900
3	NC_021125	CA	6	3956	3966	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	51094900
4	NC_021125	TA	6	4059	4072	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_021125	AGA	4	4614	4626	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	51094900
6	NC_021125	AAGC	3	5058	5069	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	51094900
7	NC_021125	TTAA	3	6118	6129	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51094900
8	NC_021125	AATAA	3	7388	7402	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_021125	ATA	4	7848	7858	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51094900
10	NC_021125	TAA	4	9736	9747	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51094900
11	NC_021125	AAAG	3	10048	10059	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51094900
12	NC_021125	AT	6	10074	10084	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51094900
13	NC_021125	TAG	4	10600	10610	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51094900
14	NC_021125	TAA	4	10990	11001	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51094900
15	NC_021125	TAT	4	11460	11470	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51094900
16	NC_021125	GCGT	3	12621	12632	12	0 %	25 %	50 %	25 %	0 %	51094900
17	NC_021125	ATA	4	12960	12971	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51094900
18	NC_021125	CAAA	3	13657	13667	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	51094900
19	NC_021125	CATA	3	16084	16095	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	51094900
20	NC_021125	AAAC	3	16800	16811	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	51094900
21	NC_021125	AAAAGT	3	17448	17465	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	51094900
22	NC_021125	ATG	4	18334	18346	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	51094900
23	NC_021125	AAAT	5	18801	18819	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
24	NC_021125	AAG	4	20979	20991	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	51094901
25	NC_021125	TAC	4	21018	21029	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_021125	CATT	3	21622	21632	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	51094901
27	NC_021125	TA	7	22666	22679	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_021125	TCA	4	23114	23124	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51094901
29	NC_021125	TGG	4	23629	23639	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	51094901
30	NC_021125	GTG	4	25611	25621	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	51094901
31	NC_021125	TAAT	3	26291	26302	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_021125	AT	6	28960	28971	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51094902
33	NC_021125	GAAA	3	28990	29002	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	51094902
34	NC_021125	GAA	5	32599	32612	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	51094902
35	NC_021125	TAA	5	33467	33481	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51094903
36	NC_021125	AAT	5	34065	34080	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51094903
37	NC_021125	TAT	4	34994	35004	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_021125	TAT	5	36203	36216	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_021125	GCAGGT	3	36408	36425	18	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	0 %	51094903
40	NC_021125	AATT	3	37129	37139	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51094903
41	NC_021125	TA	6	38830	38841	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51094903
42	NC_021125	AAG	4	39054	39065	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51094903
43	NC_021125	CTG	4	39752	39763	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51094903
44	NC_021125	AT	6	40266	40277	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51094903
45	NC_021125	TCA	4	40952	40962	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51094903
46	NC_021125	AATA	3	42201	42213	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	51094904
47	NC_021125	TA	6	42890	42900	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_021125	T	12	43623	43634	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_021125	AT	6	44419	44429	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51094904
50	NC_021125	ACC	4	44831	44843	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	51094904
51	NC_021125	TA	6	45431	45442	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51094904
52	NC_021125	ATA	5	45547	45561	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51094904
53	NC_021125	CA	6	46373	46383	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	51094904
54	NC_021125	TG	7	47081	47093	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	51094904
55	NC_021125	TA	7	47733	47746	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_021125	AAAT	3	47748	47758	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_021125	AAAG	3	47784	47794	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	51094905
58	NC_021125	AGAA	3	47806	47816	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	51094905
59	NC_021125	AT	8	48092	48106	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_021125	TTTA	3	48219	48229	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_021125	TAT	4	48412	48422	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_021125	TTTC	3	48803	48813	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	51094905
63	NC_021125	TTG	4	50363	50373	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	51094905
64	NC_021125	AT	6	50965	50975	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51094905
65	NC_021125	TTAT	3	51348	51358	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51094905
66	NC_021125	TTG	4	52543	52555	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	51094905
67	NC_021125	TTGCT	3	52567	52580	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
68	NC_021125	TTAA	3	52611	52622	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_021125	AGAT	3	53552	53563	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	51094905
70	NC_021125	TTCT	3	57435	57446	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	51094905
71	NC_021125	ATT	4	58558	58569	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51094906
72	NC_021125	TCTA	3	59031	59042	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	51094906
73	NC_021125	AAGA	3	59476	59487	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	51094906
74	NC_021125	TAA	4	61438	61449	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51094906
75	NC_021125	TAC	4	62771	62781	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51094906
76	NC_021125	TTG	4	63161	63173	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	51094906
77	NC_021125	TAAA	3	63718	63729	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51094906
78	NC_021125	TA	6	63976	63986	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51094906
79	NC_021125	ACT	4	64256	64267	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51094906
80	NC_021125	TAG	4	64282	64293	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51094906
81	NC_021125	AAAT	3	65508	65519	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	51094906
82	NC_021125	ATAC	3	66807	66818	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	51094906
83	NC_021125	CTA	4	67757	67768	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51094906
84	NC_021125	ACTTA	3	70017	70031	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding

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