ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Andalucia godoyi strain ATCC PRA-185 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021124	GA	6	54	64	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_021124	TCTG	3	1226	1237	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_021124	TTC	4	1489	1500	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_021124	TCT	4	2763	2773	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_021124	TCT	4	3077	3087	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_021124	GA	6	3144	3155	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_021124	AAGA	6	3194	3215	22	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_021124	AATG	3	3540	3551	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	48475985
9	NC_021124	AAAC	3	6051	6062	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	48475985
10	NC_021124	GAA	4	6064	6074	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	48475985
11	NC_021124	CAG	5	6198	6211	14	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	48475985
12	NC_021124	TA	7	6858	6870	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	48475986
13	NC_021124	AAGC	3	7774	7785	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	48475986
14	NC_021124	CTG	5	9322	9336	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	48475986
15	NC_021124	CTTT	3	11284	11295	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
16	NC_021124	AATG	3	12584	12594	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	48475986
17	NC_021124	TTCT	3	13013	13024	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	48475986
18	NC_021124	CTT	4	13030	13040	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	48475986
19	NC_021124	GAAAG	3	14617	14631	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	48475986
20	NC_021124	CTT	4	15099	15110	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	48475986
21	NC_021124	TTCT	3	16173	16183	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	48475986
22	NC_021124	ATC	4	16933	16943	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	48475986
23	NC_021124	TC	6	17102	17112	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475986
24	NC_021124	GAC	4	17995	18005	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	48475986
25	NC_021124	ATG	4	18570	18581	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	48475986
26	NC_021124	GTTG	3	20423	20434	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	48475986
27	NC_021124	AAAG	3	20523	20533	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	48475986
28	NC_021124	AATG	3	21360	21370	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	48475987
29	NC_021124	TCTT	3	21954	21965	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	48475987
30	NC_021124	ACTT	3	22119	22130	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	48475987
31	NC_021124	ATG	4	22393	22404	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	48475987
32	NC_021124	CTGAT	3	24040	24055	16	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	48475987
33	NC_021124	GAA	4	25265	25275	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_021124	TG	6	28987	28997	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	48475987
35	NC_021124	AAAG	3	32103	32113	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	48475988
36	NC_021124	AATC	3	32796	32808	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	48475988
37	NC_021124	TA	7	33284	33296	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_021124	CTT	4	34112	34122	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	48475988
39	NC_021124	TCT	4	34434	34445	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	48475989
40	NC_021124	TA	6	35410	35421	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_021124	TA	6	35802	35813	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_021124	ATGG	3	35835	35846	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021124	TC	6	36351	36361	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475989
44	NC_021124	TTCT	3	36449	36459	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	48475989
45	NC_021124	CTTT	6	36485	36507	23	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	48475989
46	NC_021124	ATC	4	36690	36700	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	48475989
47	NC_021124	TTTTCT	3	36824	36841	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	48475989
48	NC_021124	AGA	4	37125	37135	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	48475989
49	NC_021124	AAAG	3	37150	37160	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	48475989
50	NC_021124	AAG	5	37233	37247	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	48475989
51	NC_021124	AGAGA	4	37298	37316	19	60 %	0 %	40 %	0 %	10 %	48475989
52	NC_021124	GAA	4	37718	37728	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	48475989
53	NC_021124	AGA	4	38407	38418	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	48475989
54	NC_021124	CTT	4	39078	39088	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	48475989
55	NC_021124	TTC	4	39171	39181	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	48475989
56	NC_021124	GATAAT	3	40162	40178	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
57	NC_021124	AAAAAG	3	40233	40251	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_021124	TCT	4	40608	40618	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	48475989
59	NC_021124	CAAT	3	40768	40778	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	48475989
60	NC_021124	TGTCC	3	41785	41799	15	0 %	40 %	20 %	40 %	6 %	48475989
61	NC_021124	TCAA	3	42851	42862	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	48475989
62	NC_021124	AAATG	3	42874	42887	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	48475989
63	NC_021124	TTTA	3	43063	43073	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475989
64	NC_021124	GAA	4	43363	43374	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021124	GCA	4	43518	43529	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	0 %	48475989
66	NC_021124	TCT	4	45441	45452	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
67	NC_021124	TTTC	3	45465	45476	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
68	NC_021124	TCT	4	46436	46447	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	48475990
69	NC_021124	TC	6	46640	46650	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475990
70	NC_021124	CT	6	47055	47065	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475990
71	NC_021124	TTTC	3	47203	47214	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	48475990
72	NC_021124	TCTT	3	47524	47535	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	48475990
73	NC_021124	TTC	4	48276	48287	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	48475990
74	NC_021124	TCT	5	48402	48416	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	48475990
75	NC_021124	TC	6	49152	49162	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475990
76	NC_021124	TTC	7	49295	49315	21	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	48475990
77	NC_021124	TC	6	49626	49636	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48475990
78	NC_021124	TTTC	3	49639	49649	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	48475990
79	NC_021124	TTTC	3	49780	49790	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	48475990
80	NC_021124	TTTC	4	50247	50261	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
81	NC_021124	ATAC	3	50594	50604	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	48475990
82	NC_021124	GAA	4	50693	50704	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	48475990
83	NC_021124	AAG	5	50763	50777	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	48475990
84	NC_021124	GAA	4	51136	51146	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	48475990
85	NC_021124	GAA	4	51166	51177	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	48475990
86	NC_021124	AG	7	51210	51223	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	48475990
87	NC_021124	GAAAA	3	51860	51874	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	48475990
88	NC_021124	TTTA	3	52256	52267	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	48475990
89	NC_021124	AAGA	5	52936	52956	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_021124	TTTG	3	54056	54066	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	48475991
91	NC_021124	ACA	4	54597	54608	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	48475991
92	NC_021124	AAAG	3	54684	54694	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	48475991
93	NC_021124	AGA	4	55046	55056	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	48475991
94	NC_021124	TGC	4	55884	55895	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	48475991
95	NC_021124	AG	7	57202	57215	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	48475991
96	NC_021124	ATC	4	57926	57936	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	48475991
97	NC_021124	AAT	4	58334	58345	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48475991
98	NC_021124	AAAG	5	59017	59037	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	48475991
99	NC_021124	ATG	4	59604	59615	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	48475991
100	NC_021124	AAAG	3	60676	60686	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	48475991
101	NC_021124	CGAA	3	61104	61115	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	48475991
102	NC_021124	AAAAT	3	61136	61150	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	48475991
103	NC_021124	AG	6	61165	61176	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	48475991
104	NC_021124	AT	7	61355	61367	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_021124	AACA	3	61392	61403	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
106	NC_021124	ACA	4	62898	62908	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	48475992
107	NC_021124	AGTTT	3	64529	64542	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	48475992
108	NC_021124	AATG	3	64696	64708	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	48475992

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Andalucia godoyi strain ATCC PRA-185 mitochondrion