ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cistanche deserticola chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021111	CTT	4	53	64	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50159512
2	NC_021111	GAT	4	521	531	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50159512
3	NC_021111	GAT	4	1904	1914	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_021111	GAT	4	4895	4906	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50159512
5	NC_021111	TGA	4	7078	7089	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50159512
6	NC_021111	TTC	4	12308	12319	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50159513
7	NC_021111	TTA	4	12837	12847	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50159513
8	NC_021111	ATT	4	22966	22976	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50159513
9	NC_021111	ATA	4	25501	25512	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50159513
10	NC_021111	ATT	4	27989	28000	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50159513
11	NC_021111	TAA	4	29309	29319	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50159513
12	NC_021111	GAA	4	41209	41220	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50159513
13	NC_021111	TCA	4	45143	45154	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50159512
14	NC_021111	CAT	4	46440	46451	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50159512
15	NC_021111	ATC	4	48622	48633	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50159512
16	NC_021111	ATC	4	51614	51624	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	50159512
17	NC_021111	ATC	4	52997	53007	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	50159512
18	NC_021111	GAA	5	53463	53477	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	50159512
19	NC_021111	TTA	4	53926	53938	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50159512
20	NC_021111	ATA	4	55595	55605	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50159512
21	NC_021111	TAA	4	55993	56005	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50159512
22	NC_021111	GTT	4	56773	56784	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50159512
23	NC_021111	TAT	4	64374	64385	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_021111	ATT	4	65558	65568	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_021111	TTA	5	67108	67122	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_021111	ATA	4	68208	68220	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_021111	TAA	4	71633	71645	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_021111	GTT	4	77060	77072	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_021111	ATT	4	77656	77666	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_021111	ATT	4	82168	82178	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_021111	ATA	4	85306	85316	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_021111	TTA	4	93525	93535	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_021111	CTT	4	95331	95342	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_021111	ATA	4	96381	96391	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cistanche deserticola chloroplast