ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cephalotaxus oliveri chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021110	ATA	4	4306	4318	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50159508
2	NC_021110	GAG	4	4365	4375	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	50159508
3	NC_021110	GGA	4	8722	8733	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_021110	TTA	4	11204	11215	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50159503
5	NC_021110	CTT	4	11732	11742	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_021110	ATA	4	14172	14183	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_021110	CTT	4	15284	15294	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_021110	ATA	4	16467	16477	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_021110	ATT	4	17843	17854	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50159511
10	NC_021110	ATA	4	18759	18769	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50159511
11	NC_021110	TGT	4	18923	18933	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	50159511
12	NC_021110	ATA	4	19475	19486	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50159511
13	NC_021110	TTC	4	20472	20483	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50159511
14	NC_021110	TCT	4	22306	22317	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50159511
15	NC_021110	ATA	4	27999	28010	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50159511
16	NC_021110	GTT	4	31724	31735	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50159511
17	NC_021110	TCT	4	40353	40363	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	50159511
18	NC_021110	TTA	4	40799	40811	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50159511
19	NC_021110	GTT	4	41786	41797	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50159511
20	NC_021110	TAA	4	50253	50264	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50159511
21	NC_021110	TTG	4	52542	52552	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	50159511
22	NC_021110	ATG	4	56171	56181	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50159511
23	NC_021110	AAG	4	57262	57272	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	50159511
24	NC_021110	ATG	4	58392	58402	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50159511
25	NC_021110	ATC	4	62476	62486	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	50159511
26	NC_021110	TTA	4	62714	62726	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50159511
27	NC_021110	TCT	4	69241	69252	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50159511
28	NC_021110	TTC	4	74240	74252	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	50159511
29	NC_021110	GAT	4	75567	75577	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50159511
30	NC_021110	TTA	4	76502	76513	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50159511
31	NC_021110	CAG	4	77473	77484	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	50159511
32	NC_021110	TAA	4	79590	79602	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50159511
33	NC_021110	GAA	4	82668	82679	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50159511
34	NC_021110	AAG	4	82839	82850	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50159511
35	NC_021110	GAA	4	83559	83570	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50159511
36	NC_021110	ATG	4	84640	84651	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50159511
37	NC_021110	AGA	4	84665	84676	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50159511
38	NC_021110	AAT	4	85190	85201	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50159511
39	NC_021110	GAA	4	87219	87230	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50159511
40	NC_021110	ATT	4	91808	91820	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50159511
41	NC_021110	AGA	5	93105	93119	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	50159511
42	NC_021110	TAT	4	94351	94363	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50159511
43	NC_021110	TAA	4	100206	100218	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50159511
44	NC_021110	TAT	4	100419	100429	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50159511
45	NC_021110	TAG	4	100478	100489	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50159511
46	NC_021110	GAG	4	102585	102595	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	50159511
47	NC_021110	GTG	4	104016	104027	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	50159511
48	NC_021110	AAT	4	104490	104500	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50159511
49	NC_021110	ATT	4	110952	110963	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50159511
50	NC_021110	TAT	4	110967	110978	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50159511
51	NC_021110	TAT	4	111006	111020	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	50159511
52	NC_021110	TAT	5	111029	111043	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	50159511
53	NC_021110	TCT	4	111199	111209	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	50159511
54	NC_021110	ATA	5	113563	113576	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50159511
55	NC_021110	GTA	4	114715	114726	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50159511
56	NC_021110	ATA	4	115941	115951	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_021110	TCT	4	116312	116322	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	50159506
58	NC_021110	TAT	4	117951	117961	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50159506
59	NC_021110	AAT	4	118332	118344	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50159506
60	NC_021110	TCT	4	119860	119871	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50159511
61	NC_021110	TCT	4	124241	124251	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	50159511
62	NC_021110	AAT	5	124808	124821	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50159511
63	NC_021110	TTC	4	125359	125370	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50159511
64	NC_021110	TAA	4	126597	126608	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_021110	ATA	4	126884	126894	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_021110	ATA	4	128821	128833	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50159507
67	NC_021110	AGA	4	129538	129548	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	50159507
68	NC_021110	ATA	4	130326	130336	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50159507
69	NC_021110	ATG	8	133834	133857	24	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50159507
70	NC_021110	TAA	5	134201	134214	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cephalotaxus oliveri chloroplast