ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Pleodorina starrii plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021109	AAAT	3	424	434	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_021109	TTCT	3	2216	2228	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	48475977
3	NC_021109	TGTT	3	2812	2822	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	48475977
4	NC_021109	AATT	3	2995	3006	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_021109	TACT	3	3911	3922	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021109	TTGG	3	4163	4173	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_021109	ATAA	3	4801	4812	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	48475977
8	NC_021109	AGGG	3	5893	5903	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_021109	GTAT	3	7073	7084	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_021109	ATGG	3	10545	10556	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_021109	AGCT	3	10901	10911	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_021109	ACGT	3	13400	13410	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_021109	AATT	3	13510	13521	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_021109	TTTA	3	13930	13940	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_021109	TATT	3	21342	21352	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475977
16	NC_021109	AAAT	3	22660	22670	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	48475977
17	NC_021109	TTAA	3	23482	23493	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48475977
18	NC_021109	TCAA	3	23894	23904	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	48475977
19	NC_021109	TCAA	3	24801	24812	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	48475977
20	NC_021109	TATT	3	25226	25237	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	48475977
21	NC_021109	GTAA	3	26934	26944	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	48475977
22	NC_021109	AAAT	3	28334	28345	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	48475977
23	NC_021109	ATTT	3	30173	30183	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_021109	CCAA	3	31726	31736	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	48475977
25	NC_021109	TTAT	3	32165	32175	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475977
26	NC_021109	ATTT	3	32507	32519	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	48475977
27	NC_021109	TTGC	3	32523	32534	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	48475977
28	NC_021109	AATT	3	38193	38205	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	48475978
29	NC_021109	CAAA	3	39762	39772	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_021109	TAAT	5	41485	41504	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_021109	CAAA	3	43181	43191	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	48475978
32	NC_021109	ACAA	3	46492	46502	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	48475978
33	NC_021109	AAGT	3	47170	47181	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	48475978
34	NC_021109	CTAC	3	51597	51608	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
35	NC_021109	ATCT	3	54741	54751	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_021109	GTTA	3	56679	56690	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_021109	GTAA	3	58490	58500	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_021109	TAAA	3	58586	58596	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_021109	CAAA	3	59512	59523	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	48475978
40	NC_021109	TTAC	3	61348	61358	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_021109	ATTC	3	62422	62434	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
42	NC_021109	TACT	3	63678	63688	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
43	NC_021109	TAAA	3	68034	68045	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_021109	ATTT	3	68111	68121	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_021109	TAAC	3	69879	69890	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021109	TTAA	3	70189	70201	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_021109	ATAA	4	72214	72229	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_021109	AATA	6	74840	74863	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_021109	AAAG	3	74864	74874	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_021109	TAAA	3	78472	78484	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	48475979
51	NC_021109	AAAC	3	80149	80160	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
52	NC_021109	CCAA	3	84586	84597	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	48475979
53	NC_021109	TTTA	5	90088	90106	19	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
54	NC_021109	TAAA	3	93036	93046	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_021109	CTAC	3	94013	94024	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
56	NC_021109	ATAA	3	95495	95505	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_021109	AGCG	3	96552	96562	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
58	NC_021109	ACAA	3	97154	97166	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
59	NC_021109	AAGA	3	102021	102031	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	48475980
60	NC_021109	TTTG	3	102202	102214	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	48475980
61	NC_021109	TTTG	3	106537	106547	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	48475980
62	NC_021109	ATTT	3	106932	106943	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	48475980
63	NC_021109	GTTT	3	113469	113479	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	48475980
64	NC_021109	TTAA	3	113646	113657	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48475980
65	NC_021109	ATTT	3	115520	115530	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475980
66	NC_021109	TGAA	3	116246	116261	16	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	48475980
67	NC_021109	AATG	3	118509	118520	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	48475980
68	NC_021109	TCAT	3	118714	118725	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	48475980
69	NC_021109	TAGG	3	118940	118951	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	48475980
70	NC_021109	CCGA	3	120633	120645	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	48475980
71	NC_021109	ATGA	5	123023	123043	21	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	48475980
72	NC_021109	ACGT	3	124184	124194	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	48475980
73	NC_021109	TACA	3	124466	124477	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	48475980
74	NC_021109	AAAG	3	126348	126358	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	48475980
75	NC_021109	AGAA	3	128131	128142	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	48475980
76	NC_021109	TATT	3	129415	129425	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475980
77	NC_021109	AATC	3	130645	130655	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	48475980
78	NC_021109	TTAA	3	131724	131736	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	48475980
79	NC_021109	TTCA	3	131778	131789	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	48475980
80	NC_021109	TTTA	3	132934	132944	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475980
81	NC_021109	TTAA	3	133926	133937	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48475980
82	NC_021109	GTTT	3	136921	136931	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	48475980
83	NC_021109	AGAT	3	141763	141773	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	48475980
84	NC_021109	TTTA	3	142842	142853	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	48475980
85	NC_021109	CCTT	3	145475	145486	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	48475980
86	NC_021109	TTAA	3	145752	145763	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48475980
87	NC_021109	AAAC	3	146500	146510	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	48475980
88	NC_021109	ACGT	3	148324	148334	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	48475980
89	NC_021109	TAAA	3	149105	149115	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	48475980
90	NC_021109	ATTC	3	149614	149625	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	48475980
91	NC_021109	CCAA	3	150416	150426	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	48475980
92	NC_021109	TAAA	3	151090	151101	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	48475980
93	NC_021109	ATTT	3	152972	152983	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	48475980
94	NC_021109	AAAT	3	157538	157549	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	48475980
95	NC_021109	TCTT	3	159696	159706	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	48475980
96	NC_021109	TGTT	3	161325	161335	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	48475980
97	NC_021109	GAAT	3	162395	162406	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	48475980
98	NC_021109	TTTG	3	163262	163272	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	48475980
99	NC_021109	TGTT	3	163639	163649	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	48475980
100	NC_021109	ATTT	3	163873	163883	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475980
101	NC_021109	TTTA	3	164039	164049	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475980
102	NC_021109	TTGT	3	164081	164091	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	48475980
103	NC_021109	TTTA	3	164558	164568	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475980
104	NC_021109	ATTT	3	165529	165539	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475980
105	NC_021109	TGTT	3	165987	165998	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	48475980
106	NC_021109	TATT	3	167681	167692	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	48475980
107	NC_021109	AAAT	3	171400	171410	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	48475980
108	NC_021109	TTTA	3	171520	171532	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	48475980
109	NC_021109	TAAA	3	173076	173086	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	48475980
110	NC_021109	TAAC	3	178657	178667	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	48475980
111	NC_021109	CAAG	3	184554	184564	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	48475980
112	NC_021109	TAAA	3	186181	186192	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	48475980
113	NC_021109	TAAA	4	187143	187158	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	48475980
114	NC_021109	CGTG	3	191284	191294	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	48475980
115	NC_021109	TAAA	3	196908	196918	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	48475980
116	NC_021109	AGGG	3	200421	200432	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_021109	ACGT	3	205925	205935	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
118	NC_021109	AAAT	3	206805	206816	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	48475983
119	NC_021109	TGAA	3	210224	210235	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_021109	CTCC	3	214653	214664	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
121	NC_021109	GTTT	4	220076	220090	15	0 %	75 %	25 %	0 %	6 %	48475983
122	NC_021109	AAGG	3	220841	220852	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_021109	CTAC	3	223954	223965	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
124	NC_021109	TTTA	3	227496	227506	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_021109	ATTT	3	229195	229205	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_021109	TTTG	3	231993	232004	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_021109	TAAA	3	233493	233503	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	48475984
128	NC_021109	ATAG	3	233660	233670	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	48475984
129	NC_021109	AAAC	3	234038	234048	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	48475984
130	NC_021109	ATTT	3	235048	235059	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_021109	ACGT	3	235429	235439	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
132	NC_021109	ACGT	3	235449	235459	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
133	NC_021109	TTTA	3	237461	237471	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_021109	TAAA	3	240813	240824	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	48475984
135	NC_021109	CTTT	3	245887	245898	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
136	NC_021109	TTTC	3	248242	248253	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	48475985
137	NC_021109	AAAT	3	253302	253313	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_021109	TAAA	3	253350	253360	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_021109	GATT	3	253609	253619	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	48475985
140	NC_021109	AATA	3	254839	254849	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	48475985
141	NC_021109	GGTT	3	256995	257005	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	48475985
142	NC_021109	TGTA	3	259787	259798	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	48475985
143	NC_021109	ACGT	3	260070	260080	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	48475985
144	NC_021109	TCAT	5	261226	261245	20	25 %	50 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
145	NC_021109	TACC	3	262723	262734	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
146	NC_021109	TACC	3	265311	265322	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
147	NC_021109	GAAT	4	265537	265552	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
148	NC_021109	TCAT	3	265743	265758	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
149	NC_021109	TCAT	4	268004	268019	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Pleodorina starrii plastid