ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Naegleria fowleri mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021104	AGA	4	2924	2935	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	48475971
2	NC_021104	CAG	4	3237	3247	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	48475971
3	NC_021104	ATA	4	4936	4947	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48475971
4	NC_021104	GTT	4	5694	5706	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	48475971
5	NC_021104	TTA	4	7545	7556	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475971
6	NC_021104	TTA	4	7913	7924	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475971
7	NC_021104	TAT	4	8421	8432	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475971
8	NC_021104	ATT	5	8886	8900	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	48475971
9	NC_021104	TAG	4	10204	10215	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	48475971
10	NC_021104	ATT	4	10244	10255	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	48475971
11	NC_021104	AGG	4	10292	10303	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	48475971
12	NC_021104	TAT	4	10685	10695	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	48475971
13	NC_021104	ATA	4	10964	10974	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	48475971
14	NC_021104	CTA	4	11435	11445	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	48475971
15	NC_021104	TAG	4	11959	11970	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	48475972
16	NC_021104	TAA	5	12766	12779	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	48475972
17	NC_021104	TAA	4	13208	13219	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_021104	ATT	4	18032	18043	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475972
19	NC_021104	TAT	4	19961	19972	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475972
20	NC_021104	GAA	4	22100	22111	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	48475972
21	NC_021104	ATA	7	22402	22425	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48475972
22	NC_021104	TTA	4	24499	24510	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_021104	GGA	4	26088	26098	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	48475973
24	NC_021104	AAT	4	26447	26458	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	48475973
25	NC_021104	TTA	4	27035	27047	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	48475973
26	NC_021104	ATT	4	27125	27136	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475973
27	NC_021104	ATT	4	27190	27201	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475973
28	NC_021104	AAG	5	27621	27635	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	48475973
29	NC_021104	TAG	5	28947	28961	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	48475973
30	NC_021104	ATT	4	29171	29183	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	48475973
31	NC_021104	ATT	4	30309	30320	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	48475974
32	NC_021104	ATT	4	33023	33034	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475974
33	NC_021104	AAT	4	33086	33097	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48475974
34	NC_021104	TAA	4	33850	33861	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48475974
35	NC_021104	ATT	4	34819	34831	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	48475974
36	NC_021104	TTA	5	34927	34940	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	48475974
37	NC_021104	TAT	4	35030	35041	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475974
38	NC_021104	TTA	4	35346	35356	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	48475974
39	NC_021104	TAT	4	36050	36061	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475974
40	NC_021104	TAT	4	36078	36088	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	48475974
41	NC_021104	ATA	4	38626	38636	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	48475975
42	NC_021104	TAT	4	39272	39283	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475975
43	NC_021104	ATA	4	39369	39380	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48475975
44	NC_021104	AGA	4	40171	40182	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	48475975
45	NC_021104	TAT	4	41708	41718	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	48475975
46	NC_021104	TAT	4	41749	41761	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	48475975
47	NC_021104	ATT	4	42284	42295	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475975
48	NC_021104	TAA	4	42419	42430	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48475975
49	NC_021104	CCA	4	42533	42544	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	48475975
50	NC_021104	TAA	4	42988	42999	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48475975
51	NC_021104	TAT	4	44103	44114	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475975
52	NC_021104	ATT	4	45173	45183	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	48475975
53	NC_021104	TAT	4	45765	45777	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	48475975
54	NC_021104	TAA	7	46598	46618	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_021104	TAT	6	46863	46879	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_021104	ATA	4	46936	46947	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_021104	ATA	4	49367	49378	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_021104	AAT	4	49507	49519	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Naegleria fowleri mitochondrion