ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Francoa sonchifolia plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021101	CAG	5	1030	1044	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	50177083
2	NC_021101	CTT	4	4610	4620	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_021101	TAT	4	4860	4870	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_021101	TCT	5	5733	5746	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	50177083
5	NC_021101	TAT	4	8251	8261	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_021101	TCT	4	13784	13795	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_021101	GTT	4	23573	23584	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50177084
8	NC_021101	ACA	4	29708	29719	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_021101	GGA	4	35032	35043	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	50177085
10	NC_021101	ATG	4	39317	39327	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50177085
11	NC_021101	GCA	4	41215	41226	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	50177085
12	NC_021101	ATA	6	44359	44377	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	50177085
13	NC_021101	TTG	4	44701	44711	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	50177085
14	NC_021101	TTA	4	47004	47016	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_021101	TAA	4	47990	48001	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_021101	ATG	4	49351	49362	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_021101	TAG	4	56052	56063	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50177086
18	NC_021101	ATA	4	56075	56085	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50177086
19	NC_021101	ATA	4	59120	59130	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50177086
20	NC_021101	AGA	4	60820	60831	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_021101	CTC	4	65500	65510	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
22	NC_021101	TTA	5	67138	67151	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_021101	ATA	4	68373	68383	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_021101	TCT	4	69128	69139	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_021101	GAA	4	70066	70077	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021101	ATA	4	71957	71968	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50177087
27	NC_021101	TAA	4	77071	77082	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50177087
28	NC_021101	CTT	4	86093	86104	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50177087
29	NC_021101	GAT	4	86561	86571	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50177087
30	NC_021101	GAT	4	87953	87963	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50177087
31	NC_021101	GAT	4	90986	90997	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50177087
32	NC_021101	GAA	4	94376	94387	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50177087
33	NC_021101	GAA	5	111563	111577	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	50177091
34	NC_021101	AAG	4	113873	113884	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50177091
35	NC_021101	TTG	4	120527	120538	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50177091
36	NC_021101	ATT	4	123248	123259	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50177091
37	NC_021101	ATA	5	125994	126007	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50177091
38	NC_021101	TTA	5	128309	128323	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	50177091
39	NC_021101	TAT	4	129837	129848	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50177091
40	NC_021101	GTA	4	130217	130228	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50177091
41	NC_021101	TTC	6	131708	131726	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	50177091
42	NC_021101	CCT	4	147630	147641	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
43	NC_021101	ACC	4	150816	150826	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
44	NC_021101	ATC	4	152292	152303	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_021101	ATC	4	155326	155336	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_021101	ATC	4	156718	156728	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
47	NC_021101	GAA	5	157184	157198	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Francoa sonchifolia plastid