ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Vigna angularis mitochondrial DNA

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021092	GCTT	3	3060	3070	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_021092	CTTT	3	3084	3094	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
3	NC_021092	TCTT	4	5878	5893	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
4	NC_021092	ATTC	3	6641	6651	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_021092	CCAT	3	16110	16120	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
6	NC_021092	ACTT	3	21767	21778	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_021092	CATT	3	29362	29372	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
8	NC_021092	AGAA	3	29788	29799	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_021092	AAAC	3	32486	32498	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
10	NC_021092	TCCA	3	34046	34057	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
11	NC_021092	CAAG	3	36120	36131	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
12	NC_021092	AAAT	3	39431	39443	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_021092	GCCC	3	42610	42620	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
14	NC_021092	ATTC	3	42764	42776	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
15	NC_021092	TCGA	3	44667	44677	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
16	NC_021092	ATAA	3	46036	46047	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_021092	CAAG	3	49569	49579	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
18	NC_021092	TCTT	3	50782	50792	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_021092	CTTT	5	52452	52471	20	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
20	NC_021092	TTCC	3	53093	53104	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
21	NC_021092	CCAA	3	53362	53372	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
22	NC_021092	GGAA	3	54301	54311	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_021092	TGAA	3	56213	56223	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_021092	AAGG	3	65161	65171	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_021092	GATC	3	67121	67131	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	50159499
26	NC_021092	TGAC	3	70831	70841	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_021092	GACA	3	72219	72229	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
28	NC_021092	AAAG	3	73056	73067	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_021092	TTCA	3	73713	73725	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
30	NC_021092	TTTC	3	74274	74284	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_021092	ATAA	3	83004	83015	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021092	GCGG	3	88153	88164	12	0 %	0 %	75 %	25 %	8 %	50159499
33	NC_021092	GCAA	3	90524	90534	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	50159499
34	NC_021092	AGGG	3	91707	91717	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	50159499
35	NC_021092	TTCC	3	92324	92336	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	50159499
36	NC_021092	AAAG	3	92607	92617	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50159499
37	NC_021092	GGAC	3	93181	93191	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	50159499
38	NC_021092	AACC	3	100972	100983	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	50159500
39	NC_021092	AAAG	3	101665	101676	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	50159500
40	NC_021092	GATG	3	102577	102587	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	50159500
41	NC_021092	AAGG	3	102916	102927	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	50159500
42	NC_021092	ACCA	3	103521	103531	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	50159500
43	NC_021092	CAAG	3	103729	103740	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	50159500
44	NC_021092	TGAG	3	107677	107688	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	50159500
45	NC_021092	CTTT	3	108677	108688	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	50159500
46	NC_021092	ACTA	3	109266	109276	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	50159500
47	NC_021092	AAAG	3	115459	115469	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50159500
48	NC_021092	AGCA	3	116518	116529	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	50159500
49	NC_021092	GTCA	3	116755	116765	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	50159500
50	NC_021092	AAGG	3	117845	117855	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	50159500
51	NC_021092	GACC	3	134352	134363	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	50159500
52	NC_021092	GCTT	3	136403	136414	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	50159500
53	NC_021092	AGCT	3	137381	137391	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	50159500
54	NC_021092	TAAG	3	137588	137598	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	50159500
55	NC_021092	GAAA	3	138913	138923	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50159500
56	NC_021092	TTCT	3	140387	140398	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	50159500
57	NC_021092	ATCC	3	140691	140701	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	50159500
58	NC_021092	GATC	3	141962	141973	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	50159500
59	NC_021092	TTTG	3	144121	144132	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	50159500
60	NC_021092	AGAA	3	145190	145201	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	50159500
61	NC_021092	CTGG	3	147374	147384	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	50159500
62	NC_021092	GTCT	4	150239	150255	17	0 %	50 %	25 %	25 %	5 %	Non-Coding
63	NC_021092	AGCC	3	151346	151356	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
64	NC_021092	TTTA	3	152891	152901	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_021092	TTGC	4	160864	160878	15	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
66	NC_021092	TTAG	3	161357	161367	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_021092	TGCT	3	161952	161963	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
68	NC_021092	AAGT	3	162095	162106	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_021092	ATAA	3	162181	162193	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_021092	AGCT	3	162401	162411	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_021092	ACAA	3	162638	162649	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
72	NC_021092	AGCA	4	162804	162819	16	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
73	NC_021092	TAAG	3	163756	163766	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_021092	TCAC	3	164933	164943	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
75	NC_021092	CGAG	3	166309	166320	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
76	NC_021092	CAAG	3	166439	166450	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
77	NC_021092	CTTC	3	168914	168925	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
78	NC_021092	AAGA	3	170457	170469	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	50159500
79	NC_021092	TTTC	3	171681	171692	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
80	NC_021092	CTTT	4	171717	171733	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
81	NC_021092	TGTT	3	171830	171841	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_021092	CTTT	3	172250	172260	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
83	NC_021092	GAAT	3	172512	172522	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_021092	GTTG	3	175044	175054	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_021092	TCAT	3	185745	185755	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
86	NC_021092	CCAA	3	186339	186350	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
87	NC_021092	CGAA	3	189735	189745	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
88	NC_021092	AGGT	3	191408	191418	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_021092	AAAG	3	191715	191726	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021092	CATT	3	195737	195747	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	50159500
91	NC_021092	ATAA	3	196595	196607	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	50159500
92	NC_021092	CTTG	3	198309	198320	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021092	AAAG	4	199973	199988	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_021092	AAGA	3	200589	200599	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_021092	AGGC	3	202420	202430	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
96	NC_021092	CAAG	3	203587	203597	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
97	NC_021092	TTCC	3	210734	210745	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
98	NC_021092	CCGG	3	210897	210907	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
99	NC_021092	TTCT	3	214545	214557	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
100	NC_021092	GGGT	3	215245	215255	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	50159500
101	NC_021092	TCTA	3	216265	216275	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
102	NC_021092	GAAA	3	216630	216641	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_021092	GCCG	3	219149	219161	13	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
104	NC_021092	ATAA	3	219677	219688	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_021092	GGTG	3	222784	222795	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_021092	TCAT	3	224950	224960	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
107	NC_021092	CTAG	4	225815	225831	17	25 %	25 %	25 %	25 %	5 %	Non-Coding
108	NC_021092	AAAG	3	226858	226868	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50159501
109	NC_021092	AAGC	3	227157	227167	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	50159501
110	NC_021092	GAAA	3	227549	227560	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	50159501
111	NC_021092	CATT	3	227732	227743	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	50159501
112	NC_021092	TTCC	3	230262	230273	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
113	NC_021092	CTTC	3	232419	232431	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
114	NC_021092	GTAA	3	232826	232836	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_021092	GATA	3	233587	233598	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_021092	TTTG	3	233705	233715	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_021092	TAAG	3	238273	238284	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_021092	TATC	3	243154	243165	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
119	NC_021092	ACTT	3	245118	245129	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
120	NC_021092	ATAG	3	248858	248869	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021092	CCTT	3	252986	252998	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
122	NC_021092	AAGA	3	254616	254628	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_021092	TGGA	3	255424	255434	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_021092	CAAG	3	258263	258274	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
125	NC_021092	CCAA	3	258561	258572	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
126	NC_021092	GAAA	3	258594	258606	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_021092	CCCA	3	260742	260752	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
128	NC_021092	AGGT	3	264230	264241	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_021092	TTCG	3	268714	268725	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021092	ATAC	3	271854	271865	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
131	NC_021092	AGGC	3	273540	273551	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
132	NC_021092	TTGC	5	281752	281771	20	0 %	50 %	25 %	25 %	10 %	Non-Coding
133	NC_021092	CTTT	3	283359	283370	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021092	AAGC	3	284478	284489	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
135	NC_021092	TTCC	3	284907	284919	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
136	NC_021092	CAGC	3	285043	285054	12	25 %	0 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021092	CCTC	3	287217	287228	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
138	NC_021092	TCGC	3	288308	288318	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
139	NC_021092	CCTG	3	289958	289969	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
140	NC_021092	ACTA	3	294143	294153	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
141	NC_021092	TTAA	3	296336	296346	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_021092	TTCT	3	297793	297804	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
143	NC_021092	GCAA	3	298046	298057	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
144	NC_021092	GAAG	3	298294	298305	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
145	NC_021092	TAAT	3	301831	301842	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
146	NC_021092	CCGA	3	302153	302165	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
147	NC_021092	TGTA	3	303469	303479	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
148	NC_021092	CTTT	3	304843	304854	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
149	NC_021092	AAAG	3	305270	305281	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
150	NC_021092	AAAT	3	305538	305549	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_021092	CACC	3	307507	307518	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
152	NC_021092	TGAA	3	308302	308313	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
153	NC_021092	CAGA	3	312849	312860	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
154	NC_021092	TCTT	3	313261	313272	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
155	NC_021092	ATTC	3	318029	318040	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
156	NC_021092	CTTT	3	320040	320051	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
157	NC_021092	GCGA	3	320152	320162	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
158	NC_021092	GGGA	3	322490	322501	12	25 %	0 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021092	CTTT	3	333480	333492	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
160	NC_021092	TAGG	3	337120	337131	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
161	NC_021092	TAAA	3	337157	337169	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
162	NC_021092	CCAT	3	339750	339761	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
163	NC_021092	TTTC	3	341518	341529	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
164	NC_021092	AAGC	3	341619	341629	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
165	NC_021092	ATAG	3	344685	344695	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
166	NC_021092	TTTG	3	344736	344746	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
167	NC_021092	GGGC	3	346159	346171	13	0 %	0 %	75 %	25 %	7 %	Non-Coding
168	NC_021092	TGGA	3	346314	346324	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
169	NC_021092	GCTT	3	346509	346519	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
170	NC_021092	GATA	4	346675	346690	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
171	NC_021092	GAAT	3	347661	347673	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
172	NC_021092	AGCA	3	351259	351269	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
173	NC_021092	CAAG	3	353048	353058	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
174	NC_021092	CAAC	3	354935	354946	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
175	NC_021092	AGCG	3	355063	355073	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
176	NC_021092	TTCA	3	355869	355880	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	50159501
177	NC_021092	TGGC	3	360807	360817	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	50159501
178	NC_021092	CAAG	3	361135	361146	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	50159501
179	NC_021092	GATA	3	364149	364159	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
180	NC_021092	CCTT	3	364282	364293	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
181	NC_021092	CTCG	3	365995	366005	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
182	NC_021092	TCTT	3	374700	374711	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
183	NC_021092	ACTG	3	375629	375640	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
184	NC_021092	TTCG	4	381322	381336	15	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
185	NC_021092	AAAC	3	381548	381559	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
186	NC_021092	AAAT	3	382867	382878	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021092	GTGG	3	384198	384210	13	0 %	25 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
188	NC_021092	GCTT	3	385314	385324	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
189	NC_021092	AAGT	3	386931	386942	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
190	NC_021092	ATGA	3	388348	388359	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
191	NC_021092	ACTT	3	388790	388800	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
192	NC_021092	GAAG	4	391689	391704	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
193	NC_021092	TTCC	3	391852	391862	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
194	NC_021092	AGTC	3	391864	391875	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
195	NC_021092	AAGA	3	398623	398634	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
196	NC_021092	AACG	3	403904	403914	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Vigna angularis mitochondrial DNA