ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Vigna angularis chloroplast DNA

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021091	AT	6	257	267	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50159491
2	NC_021091	ATTT	3	784	795	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_021091	AATT	3	823	833	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_021091	A	15	888	902	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	50159491
5	NC_021091	AAAG	3	987	997	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50159491
6	NC_021091	AATA	3	1002	1013	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50159491
7	NC_021091	A	14	1194	1207	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	50159491
8	NC_021091	TA	6	1211	1221	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50159491
9	NC_021091	GAAA	3	1285	1295	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50159491
10	NC_021091	TTG	4	2503	2514	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50159491
11	NC_021091	ATG	4	2626	2637	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50159491
12	NC_021091	AAAT	3	2796	2807	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_021091	ATT	4	2845	2855	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_021091	AAGT	3	3998	4008	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	50159491
15	NC_021091	TTCA	3	4564	4575	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
16	NC_021091	ATAA	3	5629	5640	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50159491
17	NC_021091	ATAA	3	6869	6880	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_021091	AAAT	3	6957	6967	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_021091	AATAA	3	7333	7347	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_021091	TA	6	7430	7440	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_021091	TA	6	7479	7490	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_021091	AAAT	3	7849	7860	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_021091	GAAA	3	8043	8054	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_021091	ATA	4	9838	9849	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_021091	A	14	13107	13120	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_021091	ATA	7	13287	13307	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_021091	CAAA	3	13941	13952	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	50159492
28	NC_021091	AAATAC	3	14606	14624	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
29	NC_021091	TA	22	15504	15546	43	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_021091	TAAA	3	15616	15627	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_021091	AAAT	3	16097	16107	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_021091	TAA	4	16446	16456	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_021091	TAT	4	16869	16879	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_021091	T	16	17102	17117	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_021091	AT	6	17358	17368	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_021091	AAAT	3	17780	17790	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_021091	AAT	4	18541	18553	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50159492
38	NC_021091	ATTA	3	19147	19159	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_021091	AATA	3	20290	20301	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50159492
40	NC_021091	TAAA	3	20312	20322	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	50159492
41	NC_021091	AT	6	20331	20342	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50159492
42	NC_021091	AAAG	3	20612	20623	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	50159492
43	NC_021091	TA	7	20719	20731	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	50159492
44	NC_021091	TTTC	3	21190	21201	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
45	NC_021091	TCTT	3	23918	23929	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	50159492
46	NC_021091	TA	7	26411	26424	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_021091	AGA	4	26548	26558	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	50159492
48	NC_021091	TTTTAT	3	27053	27070	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
49	NC_021091	TCTA	3	27412	27423	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_021091	TTCAAA	3	27678	27694	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
51	NC_021091	T	15	27825	27839	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021091	CT	6	28561	28571	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
53	NC_021091	GAT	4	28629	28640	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_021091	AAGC	3	29332	29342	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	50159492
55	NC_021091	TA	6	31307	31318	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_021091	T	13	33031	33043	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_021091	TTTCT	3	33547	33560	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
58	NC_021091	A	12	33651	33662	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_021091	TTCA	3	33670	33681	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
60	NC_021091	TAA	4	33699	33710	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_021091	AAAGG	3	34077	34090	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_021091	T	13	34119	34131	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021091	AT	13	34674	34699	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_021091	TCT	4	34778	34789	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_021091	TAGAA	3	34898	34912	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_021091	ATT	4	35466	35476	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_021091	TTA	4	35497	35508	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_021091	CTTT	3	35624	35635	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
69	NC_021091	AT	6	37477	37487	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50159493
70	NC_021091	AAC	4	40496	40507	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	50159493
71	NC_021091	AAAC	3	40616	40627	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	50159493
72	NC_021091	AATT	3	41400	41411	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50159493
73	NC_021091	GAA	4	41962	41974	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	50159493
74	NC_021091	ACAA	3	43182	43193	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	50159493
75	NC_021091	ATTC	3	45228	45238	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	50159493
76	NC_021091	A	13	45643	45655	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	50159493
77	NC_021091	ATCT	3	46602	46614	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	50159493
78	NC_021091	GAAA	3	47851	47863	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_021091	AAT	4	48788	48799	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_021091	TACT	3	48954	48964	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	50159493
81	NC_021091	GTT	5	49439	49453	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	50159493
82	NC_021091	ATAGAT	4	49669	49692	24	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_021091	ATTCA	3	49829	49844	16	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
84	NC_021091	AATT	3	52292	52304	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	50159493
85	NC_021091	AAAT	3	52505	52516	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50159493
86	NC_021091	TGT	4	52807	52818	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50159493
87	NC_021091	TA	6	54208	54218	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_021091	AAATA	3	54627	54641	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_021091	TTGATT	3	54705	54723	19	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
90	NC_021091	AAAT	3	55333	55344	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_021091	TA	8	55454	55469	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_021091	AT	6	55731	55743	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_021091	ATT	4	56282	56292	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_021091	CTTAT	3	56491	56505	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
95	NC_021091	AAAG	3	56620	56630	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50159494
96	NC_021091	TAA	4	56786	56796	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_021091	T	16	56809	56824	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_021091	CTAT	3	57069	57080	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021091	ATTT	3	57835	57846	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_021091	TA	6	58783	58794	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_021091	ATTT	3	59023	59034	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_021091	TTA	5	59043	59056	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_021091	TTAT	3	59111	59123	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_021091	ATTTT	3	59203	59216	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_021091	TAT	4	60406	60416	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50159494
106	NC_021091	AAAT	3	60733	60743	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	50159494
107	NC_021091	AT	6	60817	60827	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_021091	ATT	4	61241	61252	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_021091	AAAG	3	61578	61588	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50159494
110	NC_021091	A	13	62370	62382	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	50159494
111	NC_021091	ATCT	3	64112	64122	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	50159494
112	NC_021091	AT	9	64295	64312	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
113	NC_021091	A	13	64547	64559	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_021091	AG	6	64726	64736	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	50159494
115	NC_021091	AT	11	64961	64981	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_021091	TTG	4	66041	66052	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_021091	TGAAA	3	66093	66107	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
118	NC_021091	TTTTTC	3	66144	66160	17	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
119	NC_021091	TGAT	3	66346	66357	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_021091	GAAAGA	3	67667	67685	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
121	NC_021091	TTA	4	68274	68285	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_021091	AAAAAT	3	68626	68644	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	50159495
123	NC_021091	ATT	4	69855	69866	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_021091	TA	6	69931	69941	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_021091	T	14	70029	70042	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_021091	TA	6	70191	70201	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50159497
127	NC_021091	CTG	4	70445	70456	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	50159497
128	NC_021091	TTTC	3	70894	70905	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	50159497
129	NC_021091	AAAG	3	70910	70920	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50159497
130	NC_021091	T	13	70990	71002	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	50159497
131	NC_021091	T	14	71076	71089	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	50159497
132	NC_021091	TA	7	71319	71331	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	50159497
133	NC_021091	GATA	4	71328	71343	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	50159497
134	NC_021091	AGAA	3	72569	72579	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50159497
135	NC_021091	ATTT	3	72640	72651	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50159497
136	NC_021091	TCTTT	3	74473	74486	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	50159497
137	NC_021091	TAAA	3	74943	74954	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50159497
138	NC_021091	AAT	4	75784	75795	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50159497
139	NC_021091	AAAT	3	75834	75845	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50159497
140	NC_021091	ATAAA	3	76858	76872	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	50159497
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209	NC_021091	A	15	141309	141323	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
210	NC_021091	TCAA	3	142112	142124	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	50159498
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212	NC_021091	AAAG	3	145738	145748	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50159498
213	NC_021091	ATC	4	148891	148901	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
214	NC_021091	AGTC	3	150101	150112	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	50159499
215	NC_021091	ATC	4	150261	150271	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	50159499
216	NC_021091	GAA	5	150727	150741	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	50159499
217	NC_021091	AATTC	3	151220	151233	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
218	NC_021091	AAT	4	151245	151256	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
219	NC_021091	TCAAT	3	151280	151293	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Vigna angularis chloroplast DNA