ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Timelaea maculata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021090	TAAA	3	65	75	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_021090	TTTAT	3	128	142	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_021090	TTTTA	3	283	296	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	48266033
4	NC_021090	TTTTA	4	877	895	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	48266033
5	NC_021090	TTTAAT	3	927	944	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	48266033
6	NC_021090	T	14	1247	1260	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	48266033
7	NC_021090	AATT	3	1957	1967	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48266033
8	NC_021090	GGA	4	2111	2121	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	48266033
9	NC_021090	ATTT	4	2470	2485	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	48266033
10	NC_021090	ATTTAT	3	2680	2697	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	48266033
11	NC_021090	TAA	5	2838	2852	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	48266033
12	NC_021090	ATT	4	2882	2893	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48266033
13	NC_021090	AAT	4	3430	3441	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48266034
14	NC_021090	A	17	3978	3994	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	48266034
15	NC_021090	ATT	4	4099	4111	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	48266034
16	NC_021090	TCATTA	4	4322	4345	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	48266034
17	NC_021090	ATT	4	4601	4611	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	48266034
18	NC_021090	T	15	4967	4981	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	48266034
19	NC_021090	TATTTA	3	5483	5501	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
20	NC_021090	ATT	4	5549	5559	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	48266034
21	NC_021090	TTTAAT	4	5572	5595	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48266034
22	NC_021090	T	14	5827	5840	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	48266034
23	NC_021090	TTAA	3	6136	6147	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_021090	TATT	3	6148	6159	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_021090	TAAA	3	6332	6343	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	48266034
26	NC_021090	AATT	3	6350	6360	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48266034
27	NC_021090	AAAT	3	6878	6889	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	48266034
28	NC_021090	ATA	4	7262	7273	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48266034
29	NC_021090	ATAA	3	7626	7636	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	48266034
30	NC_021090	TAA	4	7700	7712	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	48266034
31	NC_021090	AAAAAT	3	7972	7989	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	48266034
32	NC_021090	ATC	4	8293	8304	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	48266034
33	NC_021090	AT	6	8462	8472	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48266034
34	NC_021090	TAA	5	8877	8890	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	48266034
35	NC_021090	AAAAT	3	9082	9095	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	48266034
36	NC_021090	TAT	6	9332	9349	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	48266034
37	NC_021090	TAT	5	9398	9412	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	48266034
38	NC_021090	AT	7	9537	9551	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	48266034
39	NC_021090	TTA	8	9545	9569	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48266034
40	NC_021090	TAT	4	9546	9560	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	48266034
41	NC_021090	AT	6	9671	9681	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48266034
42	NC_021090	ATT	4	9831	9842	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_021090	TAA	4	10296	10307	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48266034
44	NC_021090	TTTA	3	10308	10319	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	48266034
45	NC_021090	T	14	10656	10669	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	48266034
46	NC_021090	ATT	5	10741	10754	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	48266034
47	NC_021090	ATTT	3	10937	10947	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48266034
48	NC_021090	TAT	8	11086	11108	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48266034
49	NC_021090	A	14	11742	11755	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	48266035
50	NC_021090	AT	7	12541	12553	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	48266035
51	NC_021090	AT	12	12566	12588	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_021090	TAT	4	12626	12637	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_021090	T	14	12837	12850	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_021090	AT	6	13009	13020	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_021090	ATT	4	13513	13524	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_021090	TAAT	4	13569	13584	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_021090	ATTTAA	3	13594	13611	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_021090	TAAA	3	13738	13748	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_021090	AAATT	3	13958	13971	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_021090	AT	6	14410	14421	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_021090	TAATT	3	14590	14604	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021090	ATT	4	14703	14715	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_021090	ATTT	3	14788	14799	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021090	T	24	14819	14842	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_021090	ATT	4	14970	14982	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_021090	ATTA	3	14993	15004	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021090	TA	7	15030	15044	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_021090	ATTA	5	15044	15064	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_021090	AT	18	15069	15105	37	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Timelaea maculata mitochondrion