Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Calliarthron tuberculosum chloroplast
Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
| S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Start | End | Tract Length | A% | T% | G% | C% | Imperfection % | Protein ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | NC_021075 | TAAA | 3 | 1135 | 1145 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
| 2 | NC_021075 | TTAA | 3 | 2092 | 2103 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167312 |
| 3 | NC_021075 | TAAA | 5 | 3574 | 3594 | 21 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167313 |
| 4 | NC_021075 | AGAT | 3 | 4199 | 4210 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 8 % | 50167313 |
| 5 | NC_021075 | AAAT | 3 | 9986 | 9997 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 0 % | Non-Coding |
| 6 | NC_021075 | CAAA | 3 | 11383 | 11394 | 12 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 8 % | 50167314 |
| 7 | NC_021075 | ATTA | 3 | 11537 | 11549 | 13 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 7 % | 50167314 |
| 8 | NC_021075 | AAGA | 3 | 11677 | 11687 | 11 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 9 % | 50167314 |
| 9 | NC_021075 | TAAA | 4 | 15468 | 15483 | 16 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 6 % | Non-Coding |
| 10 | NC_021075 | TTGA | 3 | 18374 | 18385 | 12 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 8 % | 50167315 |
| 11 | NC_021075 | AATT | 3 | 20033 | 20044 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167315 |
| 12 | NC_021075 | CTAC | 3 | 24725 | 24736 | 12 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 0 % | Non-Coding |
| 13 | NC_021075 | CTTA | 3 | 26349 | 26360 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 0 % | Non-Coding |
| 14 | NC_021075 | AAAT | 3 | 28187 | 28197 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
| 15 | NC_021075 | ATAA | 3 | 29546 | 29557 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 16 | NC_021075 | TTTA | 3 | 32168 | 32178 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
| 17 | NC_021075 | ACTT | 3 | 34061 | 34071 | 11 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 9 % | 50167316 |
| 18 | NC_021075 | AATA | 3 | 34309 | 34320 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 0 % | Non-Coding |
| 19 | NC_021075 | AATT | 3 | 39048 | 39059 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167317 |
| 20 | NC_021075 | TATC | 3 | 42471 | 42482 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 8 % | 50167317 |
| 21 | NC_021075 | CTTT | 3 | 42523 | 42534 | 12 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 8 % | 50167317 |
| 22 | NC_021075 | AATT | 3 | 42575 | 42585 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167317 |
| 23 | NC_021075 | TAAA | 3 | 42684 | 42695 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167317 |
| 24 | NC_021075 | TTAA | 3 | 44648 | 44659 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167317 |
| 25 | NC_021075 | TTAA | 3 | 45393 | 45404 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167317 |
| 26 | NC_021075 | GAAA | 3 | 46948 | 46958 | 11 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 9 % | 50167318 |
| 27 | NC_021075 | AGTA | 3 | 48719 | 48730 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 28 | NC_021075 | TCAA | 3 | 49751 | 49761 | 11 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 9 % | 50167318 |
| 29 | NC_021075 | AATG | 3 | 50536 | 50546 | 11 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 9 % | 50167318 |
| 30 | NC_021075 | TTTA | 3 | 53681 | 53691 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167318 |
| 31 | NC_021075 | TAAA | 4 | 54064 | 54078 | 15 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 6 % | Non-Coding |
| 32 | NC_021075 | TTAA | 3 | 56000 | 56010 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
| 33 | NC_021075 | TTTA | 3 | 56021 | 56032 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167318 |
| 34 | NC_021075 | ATTT | 3 | 57816 | 57827 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 35 | NC_021075 | TTAT | 3 | 60408 | 60419 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 36 | NC_021075 | TTAA | 3 | 62981 | 62991 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167319 |
| 37 | NC_021075 | TTAA | 3 | 63609 | 63621 | 13 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 7 % | Non-Coding |
| 38 | NC_021075 | TTAG | 3 | 67154 | 67165 | 12 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 8 % | 50167320 |
| 39 | NC_021075 | ATTA | 3 | 67200 | 67210 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167320 |
| 40 | NC_021075 | ATTT | 3 | 67845 | 67855 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167320 |
| 41 | NC_021075 | TAAT | 3 | 68053 | 68064 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167320 |
| 42 | NC_021075 | CCTT | 3 | 72816 | 72826 | 11 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 9 % | 50167321 |
| 43 | NC_021075 | AATT | 3 | 73192 | 73203 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167321 |
| 44 | NC_021075 | TTTA | 3 | 73599 | 73609 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167321 |
| 45 | NC_021075 | TTTA | 3 | 76429 | 76440 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167322 |
| 46 | NC_021075 | TTTA | 3 | 78605 | 78616 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167322 |
| 47 | NC_021075 | ATTG | 3 | 78894 | 78905 | 12 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 48 | NC_021075 | ATTT | 3 | 78950 | 78961 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 49 | NC_021075 | TTAA | 3 | 81373 | 81383 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
| 50 | NC_021075 | ATTC | 3 | 84010 | 84020 | 11 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 9 % | 50167323 |
| 51 | NC_021075 | ATAA | 3 | 86544 | 86555 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167323 |
| 52 | NC_021075 | TATT | 3 | 87318 | 87328 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167323 |
| 53 | NC_021075 | TTAA | 3 | 87502 | 87513 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 54 | NC_021075 | AAAT | 3 | 89193 | 89203 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167323 |
| 55 | NC_021075 | AAAT | 3 | 89219 | 89229 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167323 |
| 56 | NC_021075 | TAAG | 3 | 90292 | 90304 | 13 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 7 % | 50167323 |
| 57 | NC_021075 | TTTA | 3 | 90483 | 90494 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 58 | NC_021075 | TTTA | 3 | 91543 | 91553 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167323 |
| 59 | NC_021075 | TTTA | 3 | 95465 | 95476 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 0 % | Non-Coding |
| 60 | NC_021075 | AGCT | 3 | 96711 | 96722 | 12 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 8 % | Non-Coding |
| 61 | NC_021075 | TATT | 3 | 96770 | 96781 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 62 | NC_021075 | TTAA | 3 | 96944 | 96956 | 13 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 7 % | 50167324 |
| 63 | NC_021075 | AATT | 3 | 97938 | 97948 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167324 |
| 64 | NC_021075 | AATT | 3 | 98251 | 98261 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167324 |
| 65 | NC_021075 | TTTA | 4 | 98783 | 98798 | 16 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 6 % | 50167324 |
| 66 | NC_021075 | TTAT | 4 | 100125 | 100140 | 16 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 6 % | 50167324 |
| 67 | NC_021075 | CAAT | 3 | 100177 | 100188 | 12 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 8 % | 50167324 |
| 68 | NC_021075 | TAAT | 3 | 102557 | 102568 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167325 |
| 69 | NC_021075 | TCAT | 3 | 104043 | 104053 | 11 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 9 % | 50167325 |
| 70 | NC_021075 | ATTG | 3 | 105525 | 105536 | 12 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 8 % | 50167325 |
| 71 | NC_021075 | AAAT | 3 | 106120 | 106131 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 0 % | 50167325 |
| 72 | NC_021075 | ATGC | 3 | 107897 | 107907 | 11 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 9 % | 50167325 |
| 73 | NC_021075 | AATT | 3 | 110134 | 110145 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 74 | NC_021075 | AAAG | 3 | 111111 | 111121 | 11 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 9 % | 50167325 |
| 75 | NC_021075 | CAAT | 3 | 111419 | 111430 | 12 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 0 % | 50167325 |
| 76 | NC_021075 | AAAG | 3 | 112925 | 112936 | 12 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 8 % | 50167325 |
| 77 | NC_021075 | TGTT | 3 | 114011 | 114021 | 11 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
| 78 | NC_021075 | ATCT | 3 | 116288 | 116298 | 11 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 9 % | 50167326 |
| 79 | NC_021075 | AATA | 3 | 123742 | 123752 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167326 |
| 80 | NC_021075 | AATA | 3 | 131921 | 131932 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167327 |
| 81 | NC_021075 | TTTG | 3 | 132348 | 132359 | 12 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 50167327 |
| 82 | NC_021075 | TAAA | 3 | 132581 | 132593 | 13 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 7 % | Non-Coding |
| 83 | NC_021075 | AAAT | 3 | 134385 | 134396 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167327 |
| 84 | NC_021075 | TCTG | 3 | 135511 | 135521 | 11 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 9 % | 50167328 |
| 85 | NC_021075 | TTAA | 3 | 135649 | 135660 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167328 |
| 86 | NC_021075 | TTTA | 3 | 138067 | 138078 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 87 | NC_021075 | AAAT | 3 | 138168 | 138178 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
| 88 | NC_021075 | AATT | 3 | 138381 | 138392 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167328 |
| 89 | NC_021075 | TTTA | 3 | 138781 | 138791 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167328 |
| 90 | NC_021075 | AAGA | 3 | 140404 | 140414 | 11 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 9 % | 50167328 |
| 91 | NC_021075 | CAAT | 3 | 143395 | 143407 | 13 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 7 % | 50167328 |
| 92 | NC_021075 | TAAA | 3 | 144179 | 144189 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167329 |
| 93 | NC_021075 | AATT | 3 | 147575 | 147585 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167329 |
| 94 | NC_021075 | TAAA | 3 | 147706 | 147716 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167329 |
| 95 | NC_021075 | AATT | 3 | 147910 | 147921 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167329 |
| 96 | NC_021075 | TTAG | 3 | 149165 | 149175 | 11 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
| 97 | NC_021075 | AATC | 3 | 149488 | 149498 | 11 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 9 % | Non-Coding |
| 98 | NC_021075 | TAAA | 3 | 149748 | 149760 | 13 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 7 % | Non-Coding |
| 99 | NC_021075 | TAAA | 3 | 151871 | 151883 | 13 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 7 % | Non-Coding |
| 100 | NC_021075 | AAAT | 3 | 152220 | 152232 | 13 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 7 % | Non-Coding |
| 101 | NC_021075 | GTAG | 3 | 153006 | 153016 | 11 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 9 % | 50167330 |
| 102 | NC_021075 | AAAT | 3 | 153813 | 153824 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167330 |
| 103 | NC_021075 | ATCA | 3 | 154730 | 154741 | 12 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 8 % | 50167330 |
| 104 | NC_021075 | TTTG | 3 | 155055 | 155065 | 11 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 9 % | 50167330 |
| 105 | NC_021075 | TAAA | 3 | 158429 | 158440 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 106 | NC_021075 | ATAA | 3 | 158516 | 158526 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
| 107 | NC_021075 | AAAT | 3 | 159566 | 159577 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167330 |
| 108 | NC_021075 | TCTA | 3 | 160581 | 160591 | 11 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 9 % | 50167330 |
| 109 | NC_021075 | CTAT | 3 | 162247 | 162257 | 11 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 9 % | 50167330 |
| 110 | NC_021075 | AGAT | 3 | 163498 | 163508 | 11 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 9 % | 50167330 |
| 111 | NC_021075 | TAGA | 3 | 164069 | 164079 | 11 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 9 % | 50167331 |
| 112 | NC_021075 | AATA | 3 | 164845 | 164856 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 113 | NC_021075 | ATAA | 3 | 167022 | 167033 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 0 % | Non-Coding |
| 114 | NC_021075 | AATA | 3 | 167175 | 167186 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 0 % | Non-Coding |
| 115 | NC_021075 | AAAC | 3 | 167606 | 167616 | 11 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 9 % | 50167331 |
| 116 | NC_021075 | AAAC | 4 | 168083 | 168098 | 16 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 6 % | 50167331 |
| 117 | NC_021075 | TAAA | 3 | 168099 | 168109 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167331 |
| 118 | NC_021075 | AAAG | 3 | 168437 | 168447 | 11 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 9 % | 50167331 |
| 119 | NC_021075 | TTAA | 3 | 170591 | 170601 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 50167331 |
| 120 | NC_021075 | GGAT | 3 | 172695 | 172706 | 12 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 0 % | 50167331 |
| 121 | NC_021075 | AAAG | 3 | 173009 | 173019 | 11 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
| 122 | NC_021075 | TTAA | 3 | 174631 | 174642 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 123 | NC_021075 | ATTA | 3 | 175994 | 176005 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 50167332 |