ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Calliarthron tuberculosum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021075	TAT	4	1833	1845	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50167312
2	NC_021075	TAA	4	2129	2141	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50167313
3	NC_021075	AAT	4	3815	3826	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167313
4	NC_021075	TAA	5	4164	4179	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	50167313
5	NC_021075	AGT	4	4517	4527	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50167313
6	NC_021075	TAA	4	4642	4652	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167313
7	NC_021075	TAA	4	4944	4954	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_021075	AAG	4	5928	5939	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50167313
9	NC_021075	ATT	4	6382	6393	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167313
10	NC_021075	ATT	6	6613	6631	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	50167313
11	NC_021075	AAT	4	6841	6852	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167313
12	NC_021075	ACA	4	13723	13734	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	50167314
13	NC_021075	ACC	4	14875	14885	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	50167314
14	NC_021075	ATA	4	15880	15891	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167314
15	NC_021075	ATT	4	17100	17110	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167314
16	NC_021075	AAT	4	17983	17993	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167315
17	NC_021075	AAT	4	18505	18516	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_021075	GTT	4	21597	21608	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50167315
19	NC_021075	TAA	4	23275	23285	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_021075	TAT	4	29959	29970	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167315
21	NC_021075	CTT	4	32001	32012	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50167316
22	NC_021075	ATT	4	32686	32697	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167316
23	NC_021075	TAT	4	34177	34189	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50167316
24	NC_021075	TAA	4	34437	34448	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167316
25	NC_021075	ATT	4	35417	35428	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167316
26	NC_021075	ACA	4	35664	35675	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	50167316
27	NC_021075	CAT	4	36460	36471	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50167316
28	NC_021075	AAT	4	37967	37977	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167316
29	NC_021075	TTA	4	40525	40535	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167317
30	NC_021075	GAA	4	41244	41255	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50167317
31	NC_021075	ACT	4	41513	41525	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	50167317
32	NC_021075	ACC	4	41924	41935	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	50167317
33	NC_021075	TAT	4	42539	42550	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167317
34	NC_021075	AAT	4	43538	43548	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167317
35	NC_021075	CAT	4	45191	45202	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50167317
36	NC_021075	ACA	4	46916	46926	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
37	NC_021075	TGA	4	47140	47150	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50167318
38	NC_021075	AAT	4	47572	47583	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167318
39	NC_021075	ATA	4	47906	47917	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167318
40	NC_021075	TAA	4	47968	47978	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167318
41	NC_021075	TAA	4	50088	50099	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167318
42	NC_021075	GCT	4	52043	52054	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50167318
43	NC_021075	GAT	4	63191	63201	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50167319
44	NC_021075	AAG	4	64085	64096	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50167319
45	NC_021075	AAT	4	70179	70189	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167320
46	NC_021075	TGC	4	70301	70312	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	50167320
47	NC_021075	CTT	4	70801	70812	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50167320
48	NC_021075	TCT	4	73670	73680	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	50167321
49	NC_021075	GCA	4	75967	75977	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	50167321
50	NC_021075	TAT	4	76139	76150	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167321
51	NC_021075	AAT	4	77838	77849	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167322
52	NC_021075	AAG	4	81429	81439	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_021075	ATT	4	81674	81684	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_021075	TTA	4	83013	83024	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167323
55	NC_021075	ATT	4	85528	85539	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167323
56	NC_021075	ATT	4	86861	86872	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_021075	TTA	4	88466	88477	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167323
58	NC_021075	TAA	4	88860	88871	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167323
59	NC_021075	AAT	4	88927	88938	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167323
60	NC_021075	TTC	4	90391	90402	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50167323
61	NC_021075	ATA	4	90510	90520	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_021075	ATA	4	91317	91327	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167323
63	NC_021075	ATT	4	91605	91617	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50167323
64	NC_021075	ATT	4	92247	92257	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167323
65	NC_021075	ATT	4	96648	96658	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167324
66	NC_021075	TAT	4	97838	97849	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167324
67	NC_021075	AAG	5	98578	98592	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	50167324
68	NC_021075	ATT	4	99607	99617	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167324
69	NC_021075	ATA	4	99776	99786	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167324
70	NC_021075	TGG	4	101578	101589	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	50167324
71	NC_021075	TAT	4	104102	104113	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_021075	TAT	4	107042	107053	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_021075	CTT	5	110585	110599	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	50167325
74	NC_021075	CAT	4	111023	111033	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	50167325
75	NC_021075	ATA	4	111239	111250	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167325
76	NC_021075	TGT	4	113418	113428	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	50167326
77	NC_021075	TAT	4	115898	115910	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50167326
78	NC_021075	AGT	4	118649	118660	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50167326
79	NC_021075	TAA	4	119327	119337	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167326
80	NC_021075	ATT	4	119988	119998	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167326
81	NC_021075	ATT	4	121390	121401	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167326
82	NC_021075	TTA	4	122582	122594	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50167326
83	NC_021075	ATT	4	126060	126071	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167326
84	NC_021075	ATT	4	129302	129312	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167327
85	NC_021075	GAA	4	132080	132090	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	50167327
86	NC_021075	ATT	4	132130	132141	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167327
87	NC_021075	TAT	4	132471	132482	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_021075	TAT	4	133889	133899	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_021075	TTA	6	136146	136163	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	50167328
90	NC_021075	TAT	5	136214	136227	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50167328
91	NC_021075	ATA	4	139218	139228	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167328
92	NC_021075	ATT	4	140820	140831	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_021075	GCT	4	141257	141268	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	50167328
94	NC_021075	ATT	4	141635	141646	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167328
95	NC_021075	CTT	4	141943	141954	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50167328
96	NC_021075	TAA	4	145614	145624	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_021075	TTG	4	147755	147766	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50167329
98	NC_021075	AAT	4	150500	150510	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167329
99	NC_021075	TAA	4	151021	151032	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167329
100	NC_021075	ATT	4	151535	151546	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167329
101	NC_021075	ATT	4	152394	152406	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_021075	ATT	4	152753	152764	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_021075	CTG	4	153358	153369	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	50167330
104	NC_021075	ATT	4	155132	155143	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_021075	AAT	5	155288	155302	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	50167330
106	NC_021075	TAT	4	156409	156421	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50167330
107	NC_021075	AAT	4	157755	157766	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167330
108	NC_021075	CAA	4	158915	158926	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	50167330
109	NC_021075	TAG	4	164631	164642	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50167331
110	NC_021075	ATA	4	165616	165627	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167331
111	NC_021075	AAT	4	172617	172628	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167331
112	NC_021075	ATA	4	172817	172828	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_021075	TTA	4	172912	172922	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167331
114	NC_021075	AAT	4	173975	173987	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50167332
115	NC_021075	AAT	4	177355	177366	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167332
116	NC_021075	TAG	4	178580	178591	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50167332

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Calliarthron tuberculosum chloroplast