ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Calliarthron tuberculosum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021075	TAAA	3	1135	1145	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_021075	TAT	4	1833	1845	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50167312
3	NC_021075	TTAA	3	2092	2103	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50167312
4	NC_021075	TAA	4	2129	2141	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	50167313
5	NC_021075	TAAA	5	3574	3594	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	50167313
6	NC_021075	AAT	4	3815	3826	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167313
7	NC_021075	TAA	5	4164	4179	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	50167313
8	NC_021075	AGAT	3	4199	4210	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	50167313
9	NC_021075	AGT	4	4517	4527	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50167313
10	NC_021075	TAA	4	4642	4652	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167313
11	NC_021075	TAA	4	4944	4954	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_021075	AAG	4	5928	5939	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50167313
13	NC_021075	ATT	4	6382	6393	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167313
14	NC_021075	ATT	6	6613	6631	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	50167313
15	NC_021075	AAT	4	6841	6852	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167313
16	NC_021075	AAAT	3	9986	9997	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021075	CAAA	3	11383	11394	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	50167314
18	NC_021075	ATTA	3	11537	11549	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	50167314
19	NC_021075	AAGA	3	11677	11687	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50167314
20	NC_021075	AT	6	12246	12256	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167314
21	NC_021075	ACA	4	13723	13734	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	50167314
22	NC_021075	ACC	4	14875	14885	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	50167314
23	NC_021075	TAAA	4	15468	15483	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_021075	ATA	4	15880	15891	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167314
25	NC_021075	ATT	4	17100	17110	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167314
26	NC_021075	AAT	4	17983	17993	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167315
27	NC_021075	TTGA	3	18374	18385	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	50167315
28	NC_021075	ATATT	4	18452	18470	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	50167315
29	NC_021075	AAT	4	18505	18516	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_021075	AATT	3	20033	20044	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50167315
31	NC_021075	GTT	4	21597	21608	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	50167315
32	NC_021075	TAA	4	23275	23285	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_021075	AT	7	23303	23315	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_021075	CTAC	3	24725	24736	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021075	CTTA	3	26349	26360	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021075	AAAT	3	28187	28197	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_021075	ATAA	3	29546	29557	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_021075	GTAAA	3	29602	29616	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_021075	TAT	4	29959	29970	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167315
40	NC_021075	TCTTT	3	31126	31140	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	50167316
41	NC_021075	CTT	4	32001	32012	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50167316
42	NC_021075	TTTA	3	32168	32178	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_021075	ATT	4	32686	32697	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167316
44	NC_021075	ACTT	3	34061	34071	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	50167316
45	NC_021075	TAT	4	34177	34189	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50167316
46	NC_021075	AATA	3	34309	34320	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021075	TAA	4	34437	34448	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167316
48	NC_021075	ATT	4	35417	35428	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167316
49	NC_021075	ACA	4	35664	35675	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	50167316
50	NC_021075	CAT	4	36460	36471	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50167316
51	NC_021075	AAT	4	37967	37977	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167316
52	NC_021075	AATT	3	39048	39059	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50167317
53	NC_021075	AT	6	40385	40396	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50167317
54	NC_021075	TTA	4	40525	40535	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167317
55	NC_021075	TA	6	41105	41115	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_021075	GAA	4	41244	41255	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50167317
57	NC_021075	ACT	4	41513	41525	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	50167317
58	NC_021075	ACC	4	41924	41935	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	50167317
59	NC_021075	TATC	3	42471	42482	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	50167317
60	NC_021075	CTTT	3	42523	42534	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	50167317
61	NC_021075	TAT	4	42539	42550	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167317
62	NC_021075	AATT	3	42575	42585	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167317
63	NC_021075	TAAA	3	42684	42695	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50167317
64	NC_021075	AT	6	43005	43015	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167317
65	NC_021075	TA	6	43310	43320	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167317
66	NC_021075	AAT	4	43538	43548	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167317
67	NC_021075	AAAAT	3	44367	44382	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_021075	TA	6	44501	44511	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167317
69	NC_021075	TTAA	3	44648	44659	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50167317
70	NC_021075	CAT	4	45191	45202	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	50167317
71	NC_021075	TTAA	3	45393	45404	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50167317
72	NC_021075	ACA	4	46916	46926	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
73	NC_021075	GAAA	3	46948	46958	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	50167318
74	NC_021075	TGA	4	47140	47150	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50167318
75	NC_021075	AAT	4	47572	47583	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167318
76	NC_021075	ATA	4	47906	47917	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167318
77	NC_021075	TAA	4	47968	47978	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167318
78	NC_021075	AGTA	3	48719	48730	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_021075	AT	7	48933	48945	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	50167318
80	NC_021075	TCAA	3	49751	49761	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	50167318
81	NC_021075	TAA	4	50088	50099	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167318
82	NC_021075	AATG	3	50536	50546	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	50167318
83	NC_021075	GCT	4	52043	52054	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50167318
84	NC_021075	AAATAT	3	53409	53427	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	50167318
85	NC_021075	TTTA	3	53681	53691	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50167318
86	NC_021075	TAAA	4	54064	54078	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_021075	TTAA	3	56000	56010	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_021075	TTTA	3	56021	56032	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50167318
89	NC_021075	ATTT	3	57816	57827	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_021075	TTAT	3	60408	60419	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_021075	TTAA	3	62981	62991	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167319
92	NC_021075	GAT	4	63191	63201	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	50167319
93	NC_021075	ATTGT	3	63564	63577	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	50167319
94	NC_021075	AT	6	63581	63592	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50167319
95	NC_021075	TTAA	3	63609	63621	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_021075	AAG	4	64085	64096	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	50167319
97	NC_021075	TTGTG	3	64779	64793	15	0 %	60 %	40 %	0 %	6 %	50167319
98	NC_021075	TTAG	3	67154	67165	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	50167320
99	NC_021075	ATTA	3	67200	67210	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167320
100	NC_021075	ATTT	3	67845	67855	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50167320
101	NC_021075	TAAT	3	68053	68064	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50167320
102	NC_021075	TTTAG	3	69245	69258	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	50167320
103	NC_021075	TTGTTT	3	69694	69711	18	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	50167320
104	NC_021075	AAT	4	70179	70189	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167320
105	NC_021075	TA	6	70277	70287	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167320
106	NC_021075	TGC	4	70301	70312	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	50167320
107	NC_021075	CTT	4	70801	70812	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50167320
108	NC_021075	TACCAA	3	71473	71490	18	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	5 %	50167320
109	NC_021075	CCTT	3	72816	72826	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	50167321
110	NC_021075	AATT	3	73192	73203	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50167321
111	NC_021075	TTTA	3	73599	73609	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50167321
112	NC_021075	TCT	4	73670	73680	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	50167321
113	NC_021075	GCA	4	75967	75977	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	50167321
114	NC_021075	TAT	4	76139	76150	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167321
115	NC_021075	TTTA	3	76429	76440	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50167322
116	NC_021075	AAT	4	77838	77849	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167322
117	NC_021075	TTTA	3	78605	78616	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	50167322
118	NC_021075	ATTG	3	78894	78905	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_021075	ATTT	3	78950	78961	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_021075	TA	6	81342	81356	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
121	NC_021075	TTAA	3	81373	81383	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_021075	AAG	4	81429	81439	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_021075	ATT	4	81674	81684	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_021075	TA	6	82281	82291	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_021075	TTA	4	83013	83024	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167323
126	NC_021075	TA	6	83209	83220	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50167323
127	NC_021075	ATTC	3	84010	84020	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	50167323
128	NC_021075	ATT	4	85528	85539	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167323
129	NC_021075	ATAA	3	86544	86555	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50167323
130	NC_021075	ATT	4	86861	86872	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_021075	TATT	3	87318	87328	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	50167323
132	NC_021075	TTAA	3	87502	87513	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_021075	TTA	4	88466	88477	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167323
134	NC_021075	TAA	4	88860	88871	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167323
135	NC_021075	AAT	4	88927	88938	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167323
136	NC_021075	AAAT	3	89193	89203	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	50167323
137	NC_021075	AAAT	3	89219	89229	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	50167323
138	NC_021075	TA	6	89232	89242	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167323
139	NC_021075	TAAG	3	90292	90304	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	50167323
140	NC_021075	TTC	4	90391	90402	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	50167323
141	NC_021075	TTTA	3	90483	90494	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_021075	ATA	4	90510	90520	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_021075	ATA	4	91317	91327	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167323
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145	NC_021075	ATT	4	91605	91617	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50167323
146	NC_021075	ATT	4	92247	92257	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167323
147	NC_021075	TA	6	95330	95340	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
148	NC_021075	TTTA	3	95465	95476	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021075	ATT	4	96648	96658	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167324
150	NC_021075	AGCT	3	96711	96722	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
151	NC_021075	TATT	3	96770	96781	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
152	NC_021075	TTAA	3	96944	96956	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	50167324
153	NC_021075	TAT	4	97838	97849	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167324
154	NC_021075	AATT	3	97938	97948	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167324
155	NC_021075	AATT	3	98251	98261	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167324
156	NC_021075	AAG	5	98578	98592	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	50167324
157	NC_021075	TTTA	4	98783	98798	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	50167324
158	NC_021075	ATT	4	99607	99617	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	50167324
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163	NC_021075	TAAT	3	102557	102568	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50167325
164	NC_021075	TCAT	3	104043	104053	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	50167325
165	NC_021075	TAT	4	104102	104113	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
166	NC_021075	ATTG	3	105525	105536	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	50167325
167	NC_021075	AAAT	3	106120	106131	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	50167325
168	NC_021075	TAT	4	107042	107053	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
169	NC_021075	ATTTT	3	107627	107641	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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171	NC_021075	AG	6	107976	107986	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	50167325
172	NC_021075	AATT	3	110134	110145	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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183	NC_021075	TA	6	114503	114513	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167326
184	NC_021075	TAT	4	115898	115910	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	50167326
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200	NC_021075	TTTG	3	132348	132359	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	50167327
201	NC_021075	TAT	4	132471	132482	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
202	NC_021075	TA	6	132567	132579	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
203	NC_021075	TAAA	3	132581	132593	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
204	NC_021075	TA	6	133570	133581	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
205	NC_021075	TAT	4	133889	133899	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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231	NC_021075	AATT	3	147575	147585	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	50167329
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236	NC_021075	TTAG	3	149165	149175	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
237	NC_021075	AATC	3	149488	149498	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
238	NC_021075	TAAA	3	149748	149760	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
239	NC_021075	AAT	4	150500	150510	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	50167329
240	NC_021075	TAA	4	151021	151032	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	50167329
241	NC_021075	ATT	4	151535	151546	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	50167329
242	NC_021075	TAAA	3	151871	151883	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
243	NC_021075	TA	6	151886	151897	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
244	NC_021075	AAAT	3	152220	152232	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
245	NC_021075	ATT	4	152394	152406	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
246	NC_021075	AAACA	3	152450	152463	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
247	NC_021075	AAGCA	3	152530	152544	15	60 %	0 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
248	NC_021075	ATT	4	152753	152764	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
249	NC_021075	GTAG	3	153006	153016	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	50167330
250	NC_021075	CTG	4	153358	153369	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	50167330
251	NC_021075	AAAT	3	153813	153824	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	50167330
252	NC_021075	ATCA	3	154730	154741	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	50167330
253	NC_021075	TTTG	3	155055	155065	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	50167330
254	NC_021075	ATT	4	155132	155143	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
255	NC_021075	AAT	5	155288	155302	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	50167330
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257	NC_021075	AT	6	157340	157351	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	50167330
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293	NC_021075	TAG	4	178580	178591	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	50167332
294	NC_021075	TA	7	178757	178769	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Calliarthron tuberculosum chloroplast