ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cupido argiades mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020779	TAA	4	205	216	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_020779	ATT	4	953	963	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023591
3	NC_020779	ATT	4	1036	1048	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	47023591
4	NC_020779	TAT	4	1109	1120	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023591
5	NC_020779	TAA	5	1188	1201	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	47023591
6	NC_020779	TAT	4	1958	1969	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023591
7	NC_020779	ATT	5	2033	2047	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	47023591
8	NC_020779	AAT	8	2849	2872	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	47023591
9	NC_020779	ATC	4	2921	2933	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	47023591
10	NC_020779	TAA	4	3443	3454	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	47023591
11	NC_020779	ATA	4	3495	3507	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	47023591
12	NC_020779	ATT	4	3855	3866	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_020779	ATT	4	3960	3970	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023591
14	NC_020779	AGA	5	4564	4577	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	47023592
15	NC_020779	ATT	4	4839	4849	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023592
16	NC_020779	TAT	6	4856	4872	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	47023592
17	NC_020779	ATT	4	5462	5473	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023592
18	NC_020779	TAT	7	5598	5619	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023592
19	NC_020779	TAT	4	5866	5877	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023592
20	NC_020779	TAT	4	6670	6681	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023591
21	NC_020779	TAA	4	6757	6767	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	47023591
22	NC_020779	AAT	4	6894	6904	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	47023591
23	NC_020779	TTA	4	7188	7199	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023591
24	NC_020779	AAT	5	7477	7491	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	47023591
25	NC_020779	TAA	4	7731	7743	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	47023591
26	NC_020779	AGA	4	7834	7844	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	47023591
27	NC_020779	AAT	4	8758	8769	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47023591
28	NC_020779	TAA	5	9376	9390	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	47023591
29	NC_020779	TAT	4	9935	9945	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023592
30	NC_020779	TAA	4	10333	10344	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47023592
31	NC_020779	ATT	4	11129	11139	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023592
32	NC_020779	ATT	4	11146	11157	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023592
33	NC_020779	TAT	4	11516	11526	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023592
34	NC_020779	ATT	4	11534	11546	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	47023592
35	NC_020779	AAT	4	12036	12046	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	47023591
36	NC_020779	TAA	4	12292	12302	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	47023591
37	NC_020779	TAA	4	13195	13207	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_020779	ATT	4	13413	13423	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_020779	ATT	4	14003	14014	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_020779	ATT	4	14045	14057	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cupido argiades mitochondrion