ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Anopheles farauti 4 isolate 7_10-11 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020770	TTAA	3	230	242	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	47119390
2	NC_020770	ATA	4	447	458	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47119390
3	NC_020770	AAT	4	769	781	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	47119390
4	NC_020770	ATT	4	859	869	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47119390
5	NC_020770	AATT	3	912	922	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	47119390
6	NC_020770	TCAA	3	1004	1015	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	47119390
7	NC_020770	TTAA	3	1233	1245	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_020770	TAT	5	1995	2009	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	47119390
9	NC_020770	ATTT	3	2795	2806	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	47119390
10	NC_020770	ATTAA	3	3562	3576	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	47119390
11	NC_020770	TTAT	3	3895	3905	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	47119391
12	NC_020770	TTAA	3	3998	4009	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	47119391
13	NC_020770	TTTAAC	4	4313	4336	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	47119391
14	NC_020770	CA	7	4380	4392	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	47119391
15	NC_020770	TTA	4	4611	4622	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47119391
16	NC_020770	AAT	4	5778	5789	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47119391
17	NC_020770	TATTTT	3	5831	5849	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	47119391
18	NC_020770	GAAT	3	5890	5902	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	47119391
19	NC_020770	AAAG	3	6126	6136	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_020770	TTTA	3	6219	6229	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_020770	TAA	5	6324	6337	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	47119391
22	NC_020770	ATAA	3	6592	6602	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	47119391
23	NC_020770	A	19	6882	6900	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	47119391
24	NC_020770	TAA	4	7287	7298	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	47119391
25	NC_020770	AAG	4	7427	7438	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	47119391
26	NC_020770	ATT	4	7486	7497	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47119391
27	NC_020770	TTAA	3	7961	7973	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	47119391
28	NC_020770	TAAT	3	8027	8038	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	47119391
29	NC_020770	TAA	4	8172	8183	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47119391
30	NC_020770	ACTAAT	3	8683	8699	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	47119391
31	NC_020770	AAAT	3	9015	9025	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	47119391
32	NC_020770	AAAAT	3	9104	9117	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	47119391
33	NC_020770	TAA	4	9156	9167	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47119391
34	NC_020770	TAAA	6	9590	9613	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	47119391
35	NC_020770	AAGA	3	9815	9825	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_020770	TAA	4	9912	9923	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47119391
37	NC_020770	ATTT	3	10070	10082	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	47119391
38	NC_020770	ATTT	3	10994	11004	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	47119391
39	NC_020770	ATTT	3	11100	11112	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	47119391
40	NC_020770	ATTT	3	11142	11153	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	47119391
41	NC_020770	TAAAA	3	11791	11804	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	47119391
42	NC_020770	TAAA	3	12085	12096	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	47119391
43	NC_020770	TAAAA	3	12235	12248	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	47119391
44	NC_020770	TAA	4	12523	12534	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47119391
45	NC_020770	TA	6	12594	12605	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_020770	AAT	4	12705	12715	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_020770	TAAAA	3	12952	12967	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_020770	TTTA	4	13561	13576	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_020770	ATTAA	3	13577	13590	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_020770	ATTT	3	13753	13763	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_020770	AATT	3	14291	14301	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_020770	AATT	5	14524	14543	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
53	NC_020770	AATT	3	14740	14750	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_020770	ATA	5	14797	14810	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_020770	TAA	4	14833	14843	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_020770	TTAT	3	14874	14885	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_020770	TTTATT	3	14912	14930	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
58	NC_020770	T	18	14978	14995	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020770	N	54	14996	15049	54	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020770	T	23	15050	15072	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_020770	TTAAAT	4	15085	15108	24	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
62	NC_020770	AT	12	15183	15205	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_020770	AT	12	15212	15234	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_020770	TTA	5	15235	15250	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_020770	TA	8	15333	15348	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_020770	T	12	15365	15376	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Anopheles farauti 4 isolate 7_10-11 mitochondrion