ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Anopheles hinesorum isolate ESP039 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020769	TTAA	3	230	242	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	47023578
2	NC_020769	TAT	4	424	435	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023578
3	NC_020769	TAT	4	615	626	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023578
4	NC_020769	AAT	4	769	781	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	47023578
5	NC_020769	ATTTT	4	852	871	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	47023578
6	NC_020769	AATT	3	912	922	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	47023578
7	NC_020769	CAAT	3	1005	1016	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	47023578
8	NC_020769	TTAA	3	1233	1245	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_020769	AGG	4	2086	2097	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	47023578
10	NC_020769	ATTAA	3	3561	3575	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	47023578
11	NC_020769	AATT	4	3878	3893	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	47023579
12	NC_020769	TTAA	3	3997	4008	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	47023579
13	NC_020769	ATT	4	4099	4110	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023579
14	NC_020769	TAACAT	4	4314	4337	24	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	47023579
15	NC_020769	TTA	4	4610	4621	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023579
16	NC_020769	GTA	4	5595	5606	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	47023579
17	NC_020769	GAAT	3	5889	5901	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	47023579
18	NC_020769	AAAG	3	6125	6135	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_020769	TTTA	3	6216	6226	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_020769	AAAT	3	6326	6336	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	47023579
21	NC_020769	AGAAA	3	6549	6562	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	47023579
22	NC_020769	TAAA	3	6590	6600	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	47023579
23	NC_020769	A	19	6879	6897	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	47023579
24	NC_020769	TTA	4	7175	7186	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023579
25	NC_020769	TAA	4	7284	7295	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47023579
26	NC_020769	AAG	4	7424	7435	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	47023579
27	NC_020769	ATT	4	7483	7494	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023579
28	NC_020769	TAT	4	7728	7740	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	47023579
29	NC_020769	TAAT	3	8024	8035	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	47023579
30	NC_020769	AAAT	3	8135	8146	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	47023579
31	NC_020769	TTA	4	8443	8455	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	47023579
32	NC_020769	AAAT	3	9012	9022	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	47023579
33	NC_020769	AAAAT	3	9101	9114	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	47023579
34	NC_020769	TAAA	7	9587	9614	28	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	47023579
35	NC_020769	AAGA	3	9812	9822	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_020769	TTTA	3	10069	10080	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	47023579
37	NC_020769	TTTA	3	10168	10178	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	47023579
38	NC_020769	ATT	4	10756	10766	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023579
39	NC_020769	ATTT	3	10991	11001	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	47023579
40	NC_020769	ATTT	3	11139	11150	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	47023579
41	NC_020769	TAAA	3	12082	12093	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	47023579
42	NC_020769	TAA	4	12520	12531	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47023579
43	NC_020769	AAT	4	12702	12712	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_020769	ATTT	5	13556	13576	21	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_020769	ATTA	5	13574	13594	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_020769	AAAT	4	13595	13611	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_020769	ATTT	3	13750	13760	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_020769	AATT	5	14519	14538	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
49	NC_020769	AATT	3	14735	14745	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_020769	AATT	3	14751	14761	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_020769	ATA	5	14792	14805	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_020769	TAA	4	14828	14838	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_020769	TATT	4	14901	14916	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_020769	ATTA	3	14929	14939	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_020769	T	18	14973	14990	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020769	AAATT	4	14996	15014	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
57	NC_020769	TTTAT	3	15034	15048	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_020769	TAAT	3	15091	15102	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020769	TTAA	3	15104	15114	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_020769	AT	12	15136	15158	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_020769	TA	8	15257	15272	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_020769	ATA	6	15320	15337	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

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