ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Anopheles cracens isolate B1 mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020768	TTAA	3	230	242	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	47023577
2	NC_020768	ATT	4	425	435	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023577
3	NC_020768	AAT	4	769	781	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	47023577
4	NC_020768	TTAT	3	799	810	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	47023577
5	NC_020768	ATT	4	859	869	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023577
6	NC_020768	AATT	3	912	922	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	47023577
7	NC_020768	TTAA	3	1300	1311	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_020768	TTTA	3	3274	3286	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	47023577
9	NC_020768	TTAATT	3	3891	3908	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	47023577
10	NC_020768	ATT	4	4102	4114	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	47023577
11	NC_020768	TTTA	3	4238	4249	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	47023577
12	NC_020768	TAAT	3	4570	4581	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	47023577
13	NC_020768	TTA	4	4613	4624	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023577
14	NC_020768	TATTT	3	4973	4987	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	47023577
15	NC_020768	AAT	4	5781	5792	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47023577
16	NC_020768	TATTTT	3	5834	5852	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	47023577
17	NC_020768	GAAT	3	5893	5905	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	47023577
18	NC_020768	TTTA	3	6222	6232	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_020768	AAAT	3	6332	6342	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	47023578
20	NC_020768	A	19	6885	6903	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	47023578
21	NC_020768	TTA	4	7181	7192	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023578
22	NC_020768	TAA	4	7290	7301	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47023578
23	NC_020768	TGAA	3	7374	7384	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	47023578
24	NC_020768	AAG	4	7430	7441	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	47023578
25	NC_020768	TTAT	3	7507	7517	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	47023578
26	NC_020768	TAT	4	7731	7742	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023578
27	NC_020768	TAAT	3	8030	8041	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	47023578
28	NC_020768	TAA	4	8174	8185	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47023578
29	NC_020768	TAAAC	3	8654	8667	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	47023578
30	NC_020768	AAAT	3	9017	9027	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	47023578
31	NC_020768	AAAAT	3	9106	9119	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	47023578
32	NC_020768	TAAA	7	9592	9619	28	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	47023578
33	NC_020768	AAGA	3	9821	9831	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_020768	ATTT	3	10077	10089	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	47023578
35	NC_020768	TTTTA	4	10174	10193	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	47023578
36	NC_020768	AAT	4	10247	10259	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	47023578
37	NC_020768	ATT	4	10766	10776	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023578
38	NC_020768	ATTT	3	11107	11119	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	47023578
39	NC_020768	AAAC	3	12024	12034	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	47023578
40	NC_020768	AAAT	3	12068	12078	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	47023578
41	NC_020768	TAAA	3	12092	12103	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	47023578
42	NC_020768	TAA	4	12529	12541	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	47023578
43	NC_020768	ATA	4	12667	12678	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_020768	AAT	4	12712	12722	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_020768	ATT	4	13393	13404	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_020768	AATT	3	13437	13448	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_020768	TTATA	3	13501	13514	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_020768	TATT	4	13570	13585	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_020768	ATTA	5	13584	13604	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_020768	AAAT	4	13605	13621	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_020768	TAA	4	13750	13760	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_020768	TTTA	3	13761	13771	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_020768	TAT	4	13876	13886	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_020768	TAA	5	13930	13944	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_020768	A	15	13940	13954	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_020768	AATT	3	14296	14306	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_020768	TTTA	3	14463	14474	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020768	TAA	4	14543	14555	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_020768	ATA	4	14598	14609	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_020768	AATA	3	14734	14746	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_020768	ATA	5	14802	14815	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_020768	ATTAT	3	14879	14892	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_020768	ATTT	3	14893	14904	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_020768	TTAA	3	14989	15000	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_020768	T	23	15052	15074	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_020768	ATTAT	3	15143	15156	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_020768	AAT	6	15163	15181	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
68	NC_020768	AT	16	15211	15241	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_020768	TA	8	15334	15349	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_020768	TAA	5	15398	15412	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Anopheles cracens isolate B1 mitochondrion