ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Artemisia frigida chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020607	TCT	4	795	805	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	47022768
2	NC_020607	AAGT	3	1165	1175	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	47022768
3	NC_020607	TAAA	3	1781	1792	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_020607	T	15	1957	1971	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020607	TTAT	3	1981	1992	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_020607	TA	6	1993	2003	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_020607	TTAT	3	2013	2024	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020607	TTC	4	2185	2196	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	47022768
9	NC_020607	GAA	4	2962	2973	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	47022768
10	NC_020607	GAA	4	2990	3001	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	47022768
11	NC_020607	AAAT	3	4429	4439	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_020607	TAAA	3	4624	4634	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_020607	A	13	4733	4745	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_020607	TA	6	4799	4810	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_020607	AGA	5	5089	5102	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_020607	TATT	3	5168	5178	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_020607	TCTCT	3	5348	5361	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	47022769
18	NC_020607	C	14	5430	5443	14	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	47022769
19	NC_020607	ATA	5	5645	5659	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	47022769
20	NC_020607	AATT	3	6039	6050	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	47022769
21	NC_020607	TTCT	3	7760	7770	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	47022769
22	NC_020607	TATAA	3	8788	8802	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020607	GTTT	3	9087	9098	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_020607	AATATA	3	10210	10227	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_020607	TAAT	3	10528	10543	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	47022769
26	NC_020607	TTCT	3	10906	10918	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
27	NC_020607	A	12	11206	11217	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_020607	AAG	4	12255	12267	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_020607	TAA	5	12297	12310	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_020607	T	15	12645	12659	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020607	A	12	13335	13346	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	47022769
32	NC_020607	ATTC	3	16811	16821	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	47022769
33	NC_020607	GAA	4	17331	17342	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	47022769
34	NC_020607	GAA	4	17377	17387	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	47022769
35	NC_020607	A	13	18383	18395	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	47022769
36	NC_020607	TA	6	18606	18617	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	47022769
37	NC_020607	ATA	4	23073	23084	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_020607	A	15	23084	23098	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_020607	AACA	3	23612	23622	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	47022769
40	NC_020607	ACTT	3	24284	24294	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	47022769
41	NC_020607	GTT	5	24768	24782	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	47022769
42	NC_020607	AT	6	26574	26585	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_020607	ATTT	4	27927	27942	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_020607	T	12	27936	27947	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020607	TGT	4	28183	28194	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	47022770
46	NC_020607	ATTT	4	29522	29537	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_020607	A	15	29749	29763	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_020607	AATA	4	29894	29909	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_020607	ATCT	4	30421	30436	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
50	NC_020607	AT	6	30824	30835	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_020607	TA	7	30963	30976	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_020607	TAA	4	31015	31026	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_020607	TAA	4	31939	31950	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_020607	GAAA	3	33605	33616	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	47022770
55	NC_020607	GAG	4	33725	33735	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	47022770
56	NC_020607	TTC	4	34455	34466	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	47022770
57	NC_020607	T	19	34644	34662	19	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020607	TCAA	3	34778	34788	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
59	NC_020607	AG	6	34792	34802	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_020607	ATATA	3	35081	35094	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_020607	TGTA	3	35134	35144	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_020607	TC	6	35394	35404	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	47022770
63	NC_020607	CTT	4	35546	35557	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_020607	AAAT	4	35580	35594	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_020607	AT	9	35651	35667	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_020607	AATT	3	37859	37869	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	47022770
67	NC_020607	ATG	4	38013	38023	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	47022770
68	NC_020607	AATG	3	39506	39517	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	47022770
69	NC_020607	GCA	4	39911	39922	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	47022770
70	NC_020607	ATG	4	40237	40247	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	47022770
71	NC_020607	A	17	41570	41586	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
72	NC_020607	TGA	4	41720	41731	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_020607	A	12	41754	41765	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_020607	AATCTA	3	41793	41809	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
75	NC_020607	TTTAT	3	42207	42222	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	47022770
76	NC_020607	TTTCT	3	42599	42612	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	47022770
77	NC_020607	TTTTC	3	43586	43600	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	47022770
78	NC_020607	GAAA	3	44076	44086	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_020607	AGAAAA	5	45829	45857	29	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
80	NC_020607	AATA	3	45981	45993	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_020607	AT	7	46173	46188	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_020607	A	15	46273	46287	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_020607	AATC	3	46894	46905	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020607	AT	6	47248	47258	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_020607	ATA	4	47587	47599	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_020607	AATAC	3	47661	47674	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
87	NC_020607	AAAT	3	47849	47860	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_020607	ATTTT	3	48059	48073	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_020607	TTTTTC	3	50167	50183	17	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
90	NC_020607	TTTA	4	50273	50288	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_020607	AATATT	3	50992	51010	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
92	NC_020607	TTA	4	51071	51082	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_020607	ATA	4	54000	54010	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_020607	T	14	54366	54379	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020607	TTG	4	54698	54708	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_020607	GGATAA	3	56174	56191	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	47022771
97	NC_020607	TAA	4	58533	58545	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_020607	TA	6	58597	58607	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_020607	ATA	4	58637	58648	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_020607	TCAG	3	59538	59549	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	47022771
101	NC_020607	ATA	4	59861	59872	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_020607	ATT	4	60812	60823	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020607	AT	6	60981	60991	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	47022772
104	NC_020607	TTC	4	61779	61790	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	47022772
105	NC_020607	ATT	4	62380	62390	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_020607	AAT	4	62405	62417	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_020607	TTTG	3	62980	62991	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	47022772
108	NC_020607	TTG	4	63634	63646	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_020607	TCTT	3	63866	63877	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
110	NC_020607	TA	6	64113	64126	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_020607	TTA	5	64124	64138	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
112	NC_020607	AAAG	3	65254	65265	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_020607	AAAG	3	65271	65282	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_020607	ATA	4	65547	65558	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_020607	TA	6	66564	66574	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_020607	TATT	3	66618	66629	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020607	A	14	67100	67113	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_020607	TGAA	3	67638	67649	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_020607	TTTC	3	67672	67684	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
120	NC_020607	ATTT	3	67792	67802	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_020607	AAGA	3	68928	68938	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	47022773
122	NC_020607	TTTA	3	69102	69113	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	47022773
123	NC_020607	ATA	4	69281	69291	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	47022773
124	NC_020607	TA	6	69933	69943	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	47022773
125	NC_020607	ATTG	3	69978	69989	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	47022773
126	NC_020607	ATTC	3	70162	70173	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	47022773
127	NC_020607	CATAGT	3	70996	71012	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	47022773
128	NC_020607	CTTT	3	71043	71053	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	47022773
129	NC_020607	GGTT	3	72081	72092	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	47022773
130	NC_020607	TCT	4	72452	72463	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	47022773
131	NC_020607	TAAA	3	72877	72887	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	47022773
132	NC_020607	TTTC	3	73767	73777	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	47022773
133	NC_020607	TG	6	75477	75487	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	47022773
134	NC_020607	AGAA	3	75640	75650	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	47022773
135	NC_020607	AAAT	3	76417	76428	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	47022773
136	NC_020607	T	17	76711	76727	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	47022773
137	NC_020607	AATC	4	76829	76844	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	47022773
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204	NC_020607	A	12	127333	127344	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	47022773
205	NC_020607	CTTA	3	128448	128458	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	47022773
206	NC_020607	CCTT	3	132506	132516	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	47022773
207	NC_020607	GGAT	3	132871	132882	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	47022773
208	NC_020607	TAATA	3	136177	136192	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	47022773
209	NC_020607	GAA	4	136732	136743	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	47022773
210	NC_020607	ACCGG	3	141092	141106	15	20 %	0 %	40 %	40 %	6 %	Non-Coding
211	NC_020607	TATT	3	143470	143482	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	47022777
212	NC_020607	TGAT	3	144469	144481	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	47022777
213	NC_020607	ATTG	3	146674	146685	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	47022777
214	NC_020607	ATTT	3	147216	147227	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	47022777

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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