ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Euglena viridis culture-collection ATCC:PRA110 chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020460	ATT	4	2939	2950	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_020460	TAA	4	3355	3365	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49866289
3	NC_020460	ATT	4	4376	4386	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49866289
4	NC_020460	TAA	4	5868	5879	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49866290
5	NC_020460	CAA	4	7379	7389	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	49866290
6	NC_020460	ATT	4	7503	7513	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49866290
7	NC_020460	TTA	4	7524	7534	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49866290
8	NC_020460	GAA	4	8793	8804	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	49866290
9	NC_020460	GGT	4	10062	10073	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	49866290
10	NC_020460	TGG	4	10142	10153	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	49866290
11	NC_020460	GGT	4	13909	13922	14	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_020460	TAT	7	14055	14075	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_020460	AAT	4	14438	14449	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	46024985
14	NC_020460	TAT	4	15576	15586	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	46024985
15	NC_020460	TAT	4	15853	15863	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_020460	TAA	5	16060	16074	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	46024985
17	NC_020460	TAA	4	16549	16560	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	46024985
18	NC_020460	CAT	4	17262	17273	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_020460	TAA	4	18189	18200	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_020460	TAA	4	19251	19263	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_020460	TAT	4	20384	20394	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_020460	ATT	4	22615	22626	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	46024985
23	NC_020460	TAA	4	22645	22656	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	46024985
24	NC_020460	CTT	4	24980	24991	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	46024986
25	NC_020460	TCT	4	25192	25203	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	46024986
26	NC_020460	TAA	4	26545	26555	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	46024986
27	NC_020460	ATA	5	26706	26720	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	46024986
28	NC_020460	TAA	4	26884	26896	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_020460	TAA	4	26919	26930	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_020460	ATT	4	27932	27943	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49866290
31	NC_020460	ATT	4	29899	29909	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49866290
32	NC_020460	CTT	4	30166	30177	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	49866290
33	NC_020460	ATT	4	32542	32552	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	46024987
34	NC_020460	TAC	4	33684	33695	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	46024987
35	NC_020460	CAT	4	34439	34449	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	46024987
36	NC_020460	TAA	5	34815	34829	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	46024987
37	NC_020460	ATC	4	35541	35552	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	46024987
38	NC_020460	TAT	4	38091	38102	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_020460	ATT	4	38716	38726	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_020460	ATT	4	39806	39817	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	46024987
41	NC_020460	TTA	4	39960	39970	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_020460	TAT	7	40033	40053	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49866290
43	NC_020460	TTA	4	41118	41128	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49866290
44	NC_020460	TGG	4	42010	42020	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	49866290
45	NC_020460	TGT	4	48407	48418	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	46024988
46	NC_020460	ATA	4	48894	48905	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_020460	TAA	4	50092	50102	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49866290
48	NC_020460	ATT	4	51084	51095	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	46024989
49	NC_020460	GTT	4	51111	51121	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	46024989
50	NC_020460	TTA	4	52340	52350	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49866291
51	NC_020460	TAA	4	54851	54863	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	49866291
52	NC_020460	GAA	4	55237	55248	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	49866291
53	NC_020460	AGA	4	55413	55424	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	49866291
54	NC_020460	AAT	4	57596	57606	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49866291
55	NC_020460	TAA	4	57626	57636	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49866291
56	NC_020460	TAA	4	58687	58698	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49866291
57	NC_020460	TAA	4	60039	60049	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	46024990
58	NC_020460	ATT	4	60557	60568	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49866291
59	NC_020460	CTT	4	60681	60693	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	49866291
60	NC_020460	TAA	4	60961	60972	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49866291
61	NC_020460	TAA	4	61512	61523	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_020460	ATA	4	62512	62523	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_020460	GCA	4	62977	62988	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	46024990
64	NC_020460	AAC	4	64265	64275	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
65	NC_020460	TTA	4	64962	64973	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	46024990
66	NC_020460	ATA	4	66291	66303	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	49866291
67	NC_020460	TAA	4	68566	68578	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	49866291
68	NC_020460	ATA	5	69496	69509	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_020460	AGC	4	72085	72096	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	46024991
70	NC_020460	ATT	5	72739	72753	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_020460	AAT	4	73142	73153	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49866292
72	NC_020460	TAA	6	75513	75531	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	49866292
73	NC_020460	TAA	4	76085	76095	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49866292
74	NC_020460	TAA	4	79415	79425	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49866292
75	NC_020460	ATT	4	79787	79798	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49866292
76	NC_020460	TGT	4	84682	84693	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	46024991

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