ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Euglena viridis culture-collection ATCC:PRA110 chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020460	AAAATT	3	1751	1769	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
2	NC_020460	TA	7	1985	1997	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	46024984
3	NC_020460	ATT	4	2939	2950	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_020460	GGTT	3	3151	3163	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	49866289
5	NC_020460	TAA	4	3355	3365	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49866289
6	NC_020460	TGTT	3	3391	3401	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	49866289
7	NC_020460	ATTT	3	3405	3415	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	49866289
8	NC_020460	TTAT	3	4274	4286	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	49866289
9	NC_020460	ATT	4	4376	4386	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49866289
10	NC_020460	AAAT	3	5203	5214	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	49866290
11	NC_020460	TTAA	3	5645	5656	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	49866290
12	NC_020460	TTTA	3	5811	5822	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49866290
13	NC_020460	TAA	4	5868	5879	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49866290
14	NC_020460	TCTT	3	7248	7259	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	49866290
15	NC_020460	CAA	4	7379	7389	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	49866290
16	NC_020460	ATT	4	7503	7513	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49866290
17	NC_020460	TTA	4	7524	7534	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49866290
18	NC_020460	TTAT	3	7841	7852	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49866290
19	NC_020460	GTTT	3	8045	8056	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	49866290
20	NC_020460	GAA	4	8793	8804	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	49866290
21	NC_020460	TTTTA	3	9555	9569	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	49866290
22	NC_020460	GGT	4	10062	10073	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	49866290
23	NC_020460	TGG	4	10142	10153	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	49866290
24	NC_020460	CTTAT	3	10297	10310	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	49866290
25	NC_020460	CTTT	3	10789	10799	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	49866290
26	NC_020460	TTTA	3	13856	13867	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_020460	GGT	4	13909	13922	14	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_020460	TAT	7	14055	14075	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_020460	TATT	6	14157	14179	23	25 %	75 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
30	NC_020460	AAT	4	14438	14449	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	46024985
31	NC_020460	TTTA	3	15181	15193	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	46024985
32	NC_020460	TAAA	3	15252	15262	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	46024985
33	NC_020460	TAT	4	15576	15586	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	46024985
34	NC_020460	TAT	4	15853	15863	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_020460	T	12	15920	15931	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	46024985
36	NC_020460	TAA	5	16060	16074	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	46024985
37	NC_020460	AAAT	3	16380	16390	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	46024985
38	NC_020460	TAA	4	16549	16560	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	46024985
39	NC_020460	CAT	4	17262	17273	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_020460	AATGA	3	17366	17381	16	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_020460	GTTATT	3	17645	17663	19	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
42	NC_020460	ATTT	3	17716	17726	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_020460	TAA	4	18189	18200	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_020460	ATTA	3	18844	18859	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_020460	ATTT	3	18880	18890	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_020460	TAA	4	19251	19263	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_020460	AT	6	20159	20169	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	46024985
48	NC_020460	TTTAT	3	20264	20278	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_020460	TAT	4	20384	20394	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_020460	TTTTA	3	20439	20454	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_020460	ATTTT	3	20572	20586	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	46024985
52	NC_020460	AT	6	20637	20647	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	46024985
53	NC_020460	ATTT	3	21394	21404	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	46024985
54	NC_020460	AT	6	21741	21751	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	46024985
55	NC_020460	TTTC	3	22025	22035	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	46024985
56	NC_020460	ATT	4	22615	22626	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	46024985
57	NC_020460	TAA	4	22645	22656	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	46024985
58	NC_020460	TTTA	3	23174	23184	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	46024985
59	NC_020460	AAAAT	3	24567	24581	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	46024986
60	NC_020460	T	12	24687	24698	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020460	CTT	4	24980	24991	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	46024986
62	NC_020460	ATTT	6	25126	25149	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	46024986
63	NC_020460	TCT	4	25192	25203	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	46024986
64	NC_020460	AAAT	3	26394	26404	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_020460	TAA	4	26545	26555	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	46024986
66	NC_020460	ATA	5	26706	26720	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	46024986
67	NC_020460	TAA	4	26884	26896	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_020460	TAA	4	26919	26930	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_020460	AT	6	27737	27748	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_020460	ATT	4	27932	27943	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49866290
71	NC_020460	TTTACT	3	28177	28194	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	49866290
72	NC_020460	ATTT	3	28230	28240	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	49866290
73	NC_020460	TTAA	3	29340	29350	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	49866290
74	NC_020460	TTAA	3	29529	29540	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	49866290
75	NC_020460	ATT	4	29899	29909	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49866290
76	NC_020460	CTT	4	30166	30177	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	49866290
77	NC_020460	GTTT	3	31027	31037	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	49866290
78	NC_020460	ATTA	3	32478	32488	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	46024987
79	NC_020460	ATT	4	32542	32552	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	46024987
80	NC_020460	TTTG	3	32666	32677	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	46024987
81	NC_020460	TTTA	3	32920	32931	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_020460	TTCT	3	32982	32993	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	46024987
83	NC_020460	TTTA	3	33313	33323	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	46024987
84	NC_020460	ATTT	3	33377	33388	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_020460	TAC	4	33684	33695	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	46024987
86	NC_020460	CAT	4	34439	34449	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	46024987
87	NC_020460	TAA	5	34815	34829	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	46024987
88	NC_020460	ATC	4	35541	35552	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	46024987
89	NC_020460	TAT	4	38091	38102	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_020460	TA	7	38702	38714	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_020460	ATT	4	38716	38726	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_020460	AAAT	3	39165	39176	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_020460	ATTTTA	3	39747	39765	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	46024987
94	NC_020460	ATT	4	39806	39817	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	46024987
95	NC_020460	TTA	4	39960	39970	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_020460	TATTT	3	40018	40032	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_020460	TAT	7	40033	40053	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49866290
98	NC_020460	ATTT	3	40646	40657	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49866290
99	NC_020460	TTA	4	41118	41128	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49866290
100	NC_020460	TGG	4	42010	42020	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	49866290
101	NC_020460	ATTT	3	44130	44141	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49866290
102	NC_020460	AATT	3	45126	45136	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_020460	ATTA	3	45235	45246	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	49866290
104	NC_020460	ATTT	3	45948	45959	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49866290
105	NC_020460	AATT	3	46053	46064	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	49866290
106	NC_020460	AT	6	46369	46379	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	49866290
107	NC_020460	ATTT	3	46479	46490	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49866290
108	NC_020460	TTTTAA	3	47204	47222	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
109	NC_020460	TGT	4	48407	48418	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	46024988
110	NC_020460	AT	6	48453	48464	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	46024988
111	NC_020460	AG	6	48599	48609	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	46024988
112	NC_020460	ATA	4	48894	48905	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_020460	TAAA	3	49636	49647	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	49866290
114	NC_020460	ATTTT	3	49659	49673	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	49866290
115	NC_020460	TTTA	3	50022	50033	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49866290
116	NC_020460	TAA	4	50092	50102	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49866290
117	NC_020460	AGAA	3	50724	50735	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	46024989
118	NC_020460	TAAA	3	50783	50793	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	46024989
119	NC_020460	ATT	4	51084	51095	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	46024989
120	NC_020460	GTT	4	51111	51121	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	46024989
121	NC_020460	TTTA	3	51805	51816	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49866291
122	NC_020460	TTA	4	52340	52350	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	49866291
123	NC_020460	ATTT	3	52533	52544	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	49866291
124	NC_020460	TAAA	3	52881	52891	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_020460	TTTA	3	52901	52912	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_020460	AT	6	53329	53340	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	49866291
127	NC_020460	TTAA	3	53347	53357	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	49866291
128	NC_020460	TTAT	3	54149	54160	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49866291
129	NC_020460	TTTA	3	54839	54849	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	49866291
130	NC_020460	TAA	4	54851	54863	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	49866291
131	NC_020460	AAAT	3	54944	54955	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	49866291
132	NC_020460	GAA	4	55237	55248	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	49866291
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138	NC_020460	AAAT	3	58369	58380	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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216	NC_020460	TAAA	5	83087	83105	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	49866292
217	NC_020460	AATAA	3	83450	83464	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	49866292
218	NC_020460	AAAC	3	83490	83500	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	49866292
219	NC_020460	TAAAA	3	83861	83876	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	49866292
220	NC_020460	TGT	4	84682	84693	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	46024991

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Euglena viridis culture-collection ATCC:PRA110 chloroplast