ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Gonium pectorale chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020438	TAT	4	102	112	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_020438	TAT	5	171	186	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_020438	ATA	4	1167	1178	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931475
4	NC_020438	TAA	4	3547	3558	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931475
5	NC_020438	TAT	4	4780	4791	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_020438	TAA	4	5526	5536	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_020438	ATT	4	5683	5695	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_020438	TAA	4	5988	5999	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_020438	ATT	4	6436	6447	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_020438	ATA	4	7152	7163	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_020438	TCA	4	8233	8243	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	45931475
12	NC_020438	GTT	4	8356	8366	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45931475
13	NC_020438	TTA	4	18320	18331	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931476
14	NC_020438	CAA	4	22810	22822	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
15	NC_020438	TAT	4	26268	26278	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45931476
16	NC_020438	TTA	4	28166	28177	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931476
17	NC_020438	TAA	4	28176	28187	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931476
18	NC_020438	TAT	4	28407	28417	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45931476
19	NC_020438	ATT	4	30181	30193	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45931476
20	NC_020438	ATT	4	31303	31314	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931476
21	NC_020438	ATT	4	32966	32976	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45931476
22	NC_020438	TAA	4	32976	32986	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45931476
23	NC_020438	TAT	4	35290	35301	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_020438	TAA	4	35362	35373	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_020438	AGA	4	37905	37916	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45931476
26	NC_020438	TAT	4	37955	37966	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931476
27	NC_020438	TTG	4	38832	38842	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45931476
28	NC_020438	TAA	4	40101	40112	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_020438	ATA	4	40199	40210	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_020438	ATT	4	42948	42959	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_020438	AAG	4	48010	48021	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45931476
32	NC_020438	CTT	7	48319	48339	21	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	4 %	45931476
33	NC_020438	ATT	4	54876	54886	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_020438	TAT	19	58378	58434	57	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	1 %	Non-Coding
35	NC_020438	TTA	4	58561	58571	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_020438	TCT	4	60877	60889	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	45931476
37	NC_020438	TAA	4	64291	64302	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931477
38	NC_020438	ATT	4	64850	64861	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931477
39	NC_020438	TAG	4	65005	65016	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45931477
40	NC_020438	TTC	5	65408	65422	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	45931477
41	NC_020438	TTA	4	66969	66980	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931477
42	NC_020438	ATA	4	67667	67678	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931477
43	NC_020438	TAA	4	69356	69366	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45931477
44	NC_020438	TAT	4	71113	71124	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_020438	GTA	4	72245	72255	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_020438	AAC	4	73793	73804	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45931477
47	NC_020438	AAC	4	76695	76706	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
48	NC_020438	ATA	5	79073	79086	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45931479
49	NC_020438	TAT	5	79108	79121	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45931479
50	NC_020438	TAT	4	80268	80280	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45931479
51	NC_020438	AGT	4	80601	80612	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45931479
52	NC_020438	TAA	5	84047	84060	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45931479
53	NC_020438	CAA	4	84948	84959	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45931479
54	NC_020438	TAT	4	85198	85209	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931479
55	NC_020438	ATA	4	85396	85407	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931479
56	NC_020438	ATA	4	87220	87231	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931479
57	NC_020438	TAA	4	87926	87937	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931479
58	NC_020438	AGT	4	88446	88456	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	45931479
59	NC_020438	ACA	5	88745	88759	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	45931479
60	NC_020438	TAT	4	93044	93054	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45931479
61	NC_020438	TGG	4	95208	95219	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	45931479
62	NC_020438	TCT	4	95858	95868	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45931479
63	NC_020438	TGC	5	95901	95915	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	45931479
64	NC_020438	ATA	4	96822	96834	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45931479
65	NC_020438	TAA	4	101647	101661	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45931479
66	NC_020438	TAT	4	102370	102381	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931479
67	NC_020438	TAA	4	103039	103050	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931479
68	NC_020438	ATA	4	103620	103631	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931479
69	NC_020438	TCT	4	107479	107490	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45931479
70	NC_020438	ATA	4	108417	108428	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931479
71	NC_020438	AAT	4	108479	108490	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931479
72	NC_020438	TTA	5	108751	108765	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45931479
73	NC_020438	TAA	4	115798	115809	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931479
74	NC_020438	CAA	4	119526	119536	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	45931479
75	NC_020438	TAA	4	121460	121471	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931479
76	NC_020438	ATT	4	126126	126138	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45931479
77	NC_020438	TAA	4	127976	127988	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45931479
78	NC_020438	ATT	4	128778	128791	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45931479
79	NC_020438	ATA	4	130413	130424	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931479
80	NC_020438	TAT	4	131438	131449	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931479
81	NC_020438	CCT	4	132407	132418	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	45931479
82	NC_020438	TTG	4	132427	132437	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45931479
83	NC_020438	TTC	4	132946	132957	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45931479
84	NC_020438	ATT	4	135331	135342	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931479
85	NC_020438	CAC	5	135661	135675	15	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	6 %	45931479
86	NC_020438	CAA	4	135685	135695	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	45931479
87	NC_020438	ATA	4	137016	137026	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45931479
88	NC_020438	ACA	4	138706	138716	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	45931479
89	NC_020438	GTG	4	141529	141540	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	45931479
90	NC_020438	TGG	4	142064	142075	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	45931479
91	NC_020438	GAA	4	143425	143435	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	45931479
92	NC_020438	TAA	5	145362	145376	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45931479
93	NC_020438	TAT	4	148558	148568	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45931479
94	NC_020438	TAT	4	151241	151252	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931479
95	NC_020438	ATA	4	151518	151530	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45931479
96	NC_020438	ATT	4	154399	154410	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931479
97	NC_020438	AAT	4	155803	155813	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45931479
98	NC_020438	ATA	19	155942	155998	57	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	1 %	45931479
99	NC_020438	TAA	4	159489	159499	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45931479
100	NC_020438	AGA	7	166038	166058	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	4 %	45931479
101	NC_020438	TCT	4	166355	166365	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45931479
102	NC_020438	TAT	4	167178	167189	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931479
103	NC_020438	ACA	4	169268	169279	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45931479
104	NC_020438	TAT	5	172923	172938	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	45931479
105	NC_020438	TAT	4	173430	173440	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45931479
106	NC_020438	AAT	4	173727	173739	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45931479
107	NC_020438	ATA	5	173776	173789	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45931479
108	NC_020438	TAT	4	175374	175384	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45931479
109	NC_020438	TAA	4	178295	178307	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	45931479
110	NC_020438	ATA	4	179480	179490	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45931479
111	NC_020438	ACC	4	180568	180579	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	45931479
112	NC_020438	TTA	4	182276	182288	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_020438	ATA	4	195087	195098	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931481
114	NC_020438	TTC	4	200878	200889	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45931481
115	NC_020438	TAT	4	201593	201604	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_020438	CTA	4	201831	201841	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
117	NC_020438	AGC	4	204091	204102	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45931481
118	NC_020438	ATT	4	204989	205000	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_020438	ATT	4	213821	213832	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931481
120	NC_020438	TAA	4	213834	213845	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931481
121	NC_020438	GAT	4	216254	216264	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_020438	TAA	4	217522	217532	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45931482
123	NC_020438	TAA	4	217790	217800	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45931482
124	NC_020438	GTT	4	219454	219464	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45931482
125	NC_020438	GTT	4	220442	220453	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	45931482
126	NC_020438	ATA	4	220694	220707	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Gonium pectorale chloroplast