ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Gonium pectorale chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020438	TTTA	3	1	11	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_020438	TAT	4	102	112	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_020438	TAT	5	171	186	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_020438	AAAT	3	301	312	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_020438	CATAA	3	605	618	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
6	NC_020438	TTCT	3	1076	1088	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	45931475
7	NC_020438	ATA	4	1167	1178	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931475
8	NC_020438	TTTA	3	1348	1359	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_020438	TAA	4	3547	3558	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931475
10	NC_020438	TTAA	3	3699	3709	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_020438	TA	6	4158	4169	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_020438	CGAG	3	4237	4249	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
13	NC_020438	CGAG	3	4297	4309	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
14	NC_020438	CGAG	3	4357	4369	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
15	NC_020438	TAT	4	4780	4791	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_020438	TTTA	3	5428	5439	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_020438	TAA	4	5526	5536	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_020438	AAAG	3	5611	5622	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_020438	ATT	4	5683	5695	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_020438	T	13	5903	5915	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_020438	AAAG	3	5963	5973	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_020438	TAA	4	5988	5999	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_020438	AAAAT	3	6277	6290	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_020438	ATT	4	6436	6447	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_020438	ACGT	3	6952	6962	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
26	NC_020438	ATA	4	7152	7163	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_020438	T	15	7763	7777	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020438	CGAG	3	7811	7823	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
29	NC_020438	TCA	4	8233	8243	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	45931475
30	NC_020438	GTT	4	8356	8366	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45931475
31	NC_020438	TTTC	3	8835	8845	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	45931475
32	NC_020438	CGAG	3	9000	9012	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	45931475
33	NC_020438	TTTA	4	9138	9153	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	45931475
34	NC_020438	T	14	10039	10052	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	45931475
35	NC_020438	TTTAT	3	10732	10745	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_020438	CGAG	3	10907	10919	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
37	NC_020438	CTTTT	3	12552	12566	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	45931475
38	NC_020438	TTTG	3	12593	12603	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	45931475
39	NC_020438	TA	6	12631	12641	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45931475
40	NC_020438	GATT	3	13389	13399	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	45931475
41	NC_020438	TAAAAA	3	14239	14257	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
42	NC_020438	TTTA	3	14356	14366	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_020438	GTTTT	3	14921	14935	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_020438	A	13	15393	15405	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_020438	TTA	4	18320	18331	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931476
46	NC_020438	AAGCTA	3	18813	18830	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	45931476
47	NC_020438	AAAAAT	3	20333	20350	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
48	NC_020438	GATA	3	20358	20368	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_020438	AAAT	3	20480	20491	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020438	AAACT	3	21560	21573	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
51	NC_020438	TTTA	3	21750	21760	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_020438	AT	12	21773	21795	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_020438	AAAT	3	22183	22193	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_020438	CGAA	3	22347	22358	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
55	NC_020438	CAA	4	22810	22822	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
56	NC_020438	AT	9	23675	23691	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
57	NC_020438	A	18	23693	23710	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_020438	ATAA	3	24140	24151	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_020438	TCTT	3	24281	24291	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	45931476
60	NC_020438	TAAA	3	25720	25730	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45931476
61	NC_020438	TAT	4	26268	26278	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45931476
62	NC_020438	ATCG	3	27263	27274	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	45931476
63	NC_020438	AAAT	3	27535	27546	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45931476
64	NC_020438	TTAT	3	27665	27675	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45931476
65	NC_020438	TTA	4	28166	28177	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931476
66	NC_020438	TAA	4	28176	28187	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45931476
67	NC_020438	TAT	4	28407	28417	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45931476
68	NC_020438	TTTTA	3	28771	28784	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	45931476
69	NC_020438	TTGT	3	30140	30151	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	45931476
70	NC_020438	ATT	4	30181	30193	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45931476
71	NC_020438	TAAA	3	30886	30896	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45931476
72	NC_020438	ATTT	3	31265	31276	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45931476
73	NC_020438	ATT	4	31303	31314	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931476
74	NC_020438	TTTA	3	32797	32807	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45931476
75	NC_020438	TTTTA	3	32823	32836	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	45931476
76	NC_020438	ATT	4	32966	32976	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45931476
77	NC_020438	TAA	4	32976	32986	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45931476
78	NC_020438	AATA	3	34956	34966	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45931476
79	NC_020438	AATTTT	3	35196	35213	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
80	NC_020438	AAAAT	3	35228	35242	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_020438	TAT	4	35290	35301	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_020438	ATTT	3	35314	35324	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_020438	TAA	4	35362	35373	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_020438	AACA	3	35966	35976	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
85	NC_020438	ACAA	3	36056	36066	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
86	NC_020438	AGA	4	37905	37916	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45931476
87	NC_020438	TAT	4	37955	37966	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45931476
88	NC_020438	TTG	4	38832	38842	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	45931476
89	NC_020438	CTTT	3	39743	39753	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
90	NC_020438	TAA	4	40101	40112	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_020438	ATA	4	40199	40210	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_020438	AAATT	3	41115	41128	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_020438	AAAT	3	41213	41223	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_020438	ATTT	3	41372	41383	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020438	AAAAAT	4	42730	42753	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_020438	TTTA	3	42757	42767	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_020438	TA	6	42778	42788	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_020438	ATT	4	42948	42959	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_020438	TAAAA	4	45601	45619	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
100	NC_020438	GAGC	3	46657	46668	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
101	NC_020438	TCGGT	3	47377	47390	14	0 %	40 %	40 %	20 %	7 %	45931476
102	NC_020438	AAG	4	48010	48021	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45931476
103	NC_020438	CTT	7	48319	48339	21	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	4 %	45931476
104	NC_020438	AT	6	48461	48471	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_020438	ATTTT	3	48509	48523	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_020438	TAAAA	3	49359	49372	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_020438	ATCG	3	50203	50214	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
108	NC_020438	TACC	3	51996	52007	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
109	NC_020438	ATTT	3	54032	54042	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_020438	ACTTT	3	54079	54093	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020438	ATT	4	54876	54886	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_020438	CGAG	3	55300	55312	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
113	NC_020438	TCAA	3	57298	57308	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
114	NC_020438	TTGA	3	57951	57961	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_020438	AATTTT	3	58355	58373	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
116	NC_020438	TAT	19	58378	58434	57	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	1 %	Non-Coding
117	NC_020438	AACA	3	58521	58531	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
118	NC_020438	TTA	4	58561	58571	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_020438	CGCT	3	58717	58728	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
120	NC_020438	TTAA	3	59171	59181	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_020438	TCTT	3	59196	59206	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
122	NC_020438	TTAA	3	59257	59267	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_020438	TTAA	3	59343	59353	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_020438	GAAAA	3	59390	59403	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_020438	TTAA	3	59463	59473	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_020438	TTAA	3	59549	59559	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_020438	TCTT	3	59574	59584	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
128	NC_020438	TATTTT	3	59627	59645	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
129	NC_020438	AAAT	3	59655	59666	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_020438	TA	6	60465	60476	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_020438	TCT	4	60877	60889	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	45931476
132	NC_020438	TTCT	3	61477	61489	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	45931476
133	NC_020438	GTTT	3	62074	62084	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	45931476
134	NC_020438	TAAG	3	62607	62617	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_020438	AAAATA	3	63244	63262	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
136	NC_020438	CTTTTT	3	63427	63445	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	45931477
137	NC_020438	TTTAT	3	63707	63721	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	45931477
138	NC_020438	GTTTT	3	63745	63760	16	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	45931477
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378	NC_020438	TTTAT	3	184992	185005	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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388	NC_020438	TATT	3	196431	196442	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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390	NC_020438	TCAA	3	196863	196873	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
391	NC_020438	ATAAA	3	197036	197050	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
392	NC_020438	TATC	3	197991	198001	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
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394	NC_020438	TAAA	3	198917	198928	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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430	NC_020438	GATA	3	219975	219985	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
431	NC_020438	GTT	4	220442	220453	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	45931482
432	NC_020438	ATA	4	220694	220707	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Gonium pectorale chloroplast